Shewanella seohaensis: N7V09_10915
Help
Entry
N7V09_10915 CDS
T08778
Name
(GenBank) diguanylate cyclase
Organism
sseh
Shewanella seohaensis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
GGDEF
MASE1
CcmH
DUF6552
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UXM80472
UniProt:
A0A9Q9JNP2
LinkDB
All DBs
Position
2441277..2442680
Genome browser
AA seq
467 aa
AA seq
DB search
MKTLFSPLLPARQSHIALLCAGIIYWLTGALGQTLFSLQPENITLIWLPSGIALVMLLMW
GRKALMLIFLGSFTLNFQGMLQQDSLGLSLLHTSIAALSDMLAPAMSMLLLRRFLPQGTG
SANDLMKFVVVAGIIPIFGSSALLSANLVFGGYILPSAFWSMGQMFFFADILGIVLVYQL
YAGWVEPNALSIAKTRHILLPLIGLPLFCLVGVKFDLGWLFYVIPPLLVVLSFEVTRFYL
ALFSSASMLFMILATAQGYGPFINATPYQTNAEMMAFVLSSALTIFGVSLQRAQLRRTER
DKQTAVQEALYDPLSGLLNRRGFMPQLANLNGPTVRYSVAMLDLDNFKMINDTYGHSVGD
RVIQLLAQLIHNHSRSQDIAARLGGEEFALVLRDIDAEQVYPVLERIRKSFAEMSIAAEE
HTIYCTVSIGWVEYQQGIAGESLLHLADKALYQAKAQGKNTIVKYQT
NT seq
1404 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttgaagacacttttttcgcctttattgccagcaagacaaagccatatcgcactgctgtgc
gcaggcattatctactggctaaccggcgccttaggccaaacgttatttagcttgcaacct
gagaatatcaccttgatttggctgccctccggcattgccttggtgatgttactcatgtgg
gggcgtaaggcattgatgctgatattcctcggcagttttactttgaattttcaaggcatg
ttgcaacaggattctctcggtctttcgctgctgcatacttcgattgccgcgttaagcgat
atgctcgcgcctgcgatgtcgatgttgttactcagacgcttcttgccacagggtacggga
agtgcgaatgacttgatgaagtttgtggtggtcgcaggcatcatccccattttcggctcc
agcgcattgttatccgctaacttagtgtttggcggttatattttgcccagcgcgttttgg
agtatggggcaaatgtttttctttgccgatattctgggaatcgtgttggtgtatcagctg
tatgcaggatgggtggaacccaatgcgctaagcatagccaaaacccgccatatccttctg
cccttgattggcttgccactgttttgtttggttggggttaagttcgatctgggctggtta
ttttatgtgatcccgccgctattggttgtgctctcctttgaggtcacgcgtttttacctc
gcgctgtttagcagcgcctccatgctgtttatgattttagcgacagcccagggctatggt
ccgtttatcaatgccacgccgtatcaaaccaatgcggagatgatggcttttgtgttgtca
tcggcattaaccatttttggggtgtcgttacagcgggcacaactgcgccgaaccgagaga
gataagcagaccgcggtgcaagaggcgctctacgatcccttgtcggggctactgaatcgc
cgcggctttatgccacagctggcaaatcttaacggcccgacagtgcgttattcggtcgct
atgttggatctcgataactttaagatgattaacgacacctatggtcacagtgtgggcgat
agggttattcagctgttggcccagttgatacacaatcatagccgtagccaagatattgcc
gcgcgcctaggcggtgaagagttcgcccttgtgcttagggatattgatgctgagcaggtg
tatccggtgcttgagcgtattcgaaaatcctttgcagagatgtcgatagcggccgaggag
cacacaatttactgcactgtgagcattggttgggtggagtatcagcaaggtatcgctggc
gagtcgttgctgcatttggcggataaggctttgtatcaagccaaggcacagggcaaaaac
acgattgtaaagtatcagacttaa
DBGET
integrated database retrieval system
