Staphylococcus schweitzeri: NCTC13712_00515
Help
Entry
NCTC13712_00515 CDS
T06947
Symbol
sdrE
Name
(GenBank) Serine-aspartate repeat-containing protein E precursor
KO
K14194
serine-aspartate repeat-containing protein C/D/E
Organism
ssh
Staphylococcus schweitzeri
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SdrD_B
SdrG_C_C
CarboxypepD_reg
Big_8
SpaA
bMG3
YSIRK_signal
MetallophosN
Gram_pos_anchor
Ig_DR_A0283-like
CarbopepD_reg_2
NOMO1-like_9th
NOMO1-like_1st
Ig_J
NOMO_3rd
DUF2606
CompInhib_SCIN
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
VEE65116
LinkDB
All DBs
Position
1:571640..575029
Genome browser
AA seq
1129 aa
AA seq
DB search
MINRDNKKAITKKGMISNRLNKFSIRKYTVGTASILVGTTLIFGLGNQEAKAAENTSTEN
AKQDEASTSDNKEVVSETENKSTTESNSTNSIKKETNTESQSEAKEAPTTSRNQQQQNNA
ITSTETKPQNIENKNVKPSTDKTATEDTSVILEEKKVPNDTNNDVTTKPSTSENQPTSTT
PKESTITESSQPQSTPSKVDNQVTDATNPKAPVHVSKDELKNNPDKLKELVRNDSNTDRS
TKPVATAPTSVAPKRVNAKMRFAVAQPAAVASNNVNDLIKVTKQTIKVGDGKDNVAAAHD
GEDIEYDTEFTIDNKVKKGDTMTVNYDKNVIPSDLTDKNDPIDITDPSGEVIAKGTFDKA
TKQITYTFTDYVDKYEDIKARLTLYSYIDKQTVPNETSLNLTFATAGKETSQNVTVDYQD
PMVHGDSNIQSIFTNLDENKQTIEQQIYVNPLKKAATNTKVDIAGSQVDDYGNVKLGNGS
TTIDQNTEIKVYKVNSNQQLPQSNRIYDFSQYEDVTSQFDNKKSFSNNVATLDFGNIDSA
YIIKVVSKYTPKSDGEIDIAQGASMRTTDKYGYYSYAGYSNYIVTSTDSGGGDGTVKPEE
KLYKIGDYVWEDVDKDGIQGTDSKEKPMANVLVTLTYPDGTTKSVRTDDKGHYEFGGLKD
GETYTVKFETPAGYLPTKQNGTTDGEKDSNGSSVTVKINGKDDMSLDTGFYKEPKYNLGD
YVWEDTNKDGIQDANEPGIKDVKVTLKDSTGKVIETTTTDASGKYKFTDLDNGNYTVEFE
TPAGYTPTVKNTTSEDKDSNGLTTTGVIKDQDNWTLDSGFYKTPKYSLGDYVWYDSNKDG
KQDSTEKGIKDVKVTLLNEKGEVIGTTKTDENGKYRFDNLDSGKYKVIFEKPAGLTQTGT
NTTEDDKDADGGEVDVTITDHDDFTIDNGYFEEETSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDS
DSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDS
DSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDAGKHTPVKPMS
TVKDHNNKAKALPETGSENNGSNNATLFGGLFAALGSLLLFGRRKKQNK
NT seq
3390 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgattaacagggataacaagaaggcaataacaaaaaagggtatgatttcaaatcgctta
aacaaattttcgattagaaagtatactgtaggtacagcatcgattttagtaggtacgaca
ttgatttttggtttagggaaccaagaagctaaagctgctgaaaacactagtacagaaaat
gcaaagcaagatgaagcatcaactagtgataataaagaagtagtgtcagaaactgaaaat
aaatcgacaacagaaagcaattcaacaaattcaattaagaaagaaacaaataccgaatca
caatcagaagctaaagaagcaccaactacatctagaaaccaacaacagcaaaataatgct
ataacttcaactgaaactaagcctcaaaacattgaaaataaaaatgttaaaccttcaact
gataaaactgcaacagaagatacatctgttattttagaagagaagaaagtaccaaatgat
acaaataacgatgtaactacaaaaccatcaacaagtgaaaatcaaccaacatcaactaca
ccaaaagaatctacaattactgaatcttcacaaccacaatcaacaccttcaaaagtagac
aatcaagttacagatgcgactaatccaaaagcaccagtacatgtgtcaaaggacgaactt
aaaaataatcctgataaattaaaagaattagttagaaacgatagtaatactgatcgttca
actaaaccagtggctacagctccaacaagtgttgcaccaaaacgtgtaaatgcaaaaatg
cgctttgcagttgcacaaccagcagctgttgcttcaaacaatgttaatgatttaattaaa
gtgacgaagcagacgattaaagttggtgatggtaaggataacgttgcagctgcacatgac
ggtgaagatattgaatatgatactgagtttacaattgataacaaagttaaaaaaggcgat
acaatgactgttaattacgataagaatgtaattccttctgatttaaccgataagaatgat
cctatcgatattactgatccatctggagaagtcattgctaaaggaacgtttgataaagcg
actaaacaaatcacatatacatttacagattatgtagataaatatgaagatataaaagca
cgtttaacattatactcatatattgataagcaaacagttcctaatgaaactagtttgaat
ttaacatttgctacagctggtaaagagactagccaaaatgttactgtagactatcaagat
ccaatggttcatggtgactcgaacattcaatctatctttacaaatttagatgaaaataaa
caaactattgaacaacaaatttatgttaatccattgaaaaaagcagcaactaacactaaa
gttgatattgctggtagccaagttgatgattatggaaatgttaaattaggaaatggtagc
actactattgatcaaaatacagaaataaaagtttataaagttaactctaatcaacaatta
cctcaaagtaatagaatttatgattttagccaatacgaagatgtaacaagccaatttgat
aacaaaaaatcgtttagtaataatgtagcgacattggattttggtaatattgactcagct
tatattattaaagtagttagtaaatatacacctaaatcagatggagaaatagatatagcg
caaggtgctagtatgagaacgactgataaatatggttattacagttacgccggatattct
aattatattgtaacttctactgactctggtggtggtgacggtacggttaaacctgaagaa
aagttatacaaaattggtgattatgtatgggaagacgttgataaagacggcattcaaggt
actgattctaaagagaaaccaatggcaaacgttttagtaacgttaacttacccagatggc
acaacaaaatcagtaagaacagatgacaaaggtcattatgagtttggtggtttgaaagac
ggtgaaacttatactgttaaattcgaaacgccagccggataccttccaacaaaacaaaat
ggaacaactgatggtgaaaaagactcaaatggtagttctgtaactgttaaaattaatgga
aaagacgatatgtctttagacactggtttttataaagaacctaaatataatttaggtgat
tatgtatgggaagatacaaataaagatggtatccaggatgccaatgaacctggtatcaaa
gatgttaaggttacattaaaagatagcactggaaaagttattgaaacaactactactgat
gcatcaggtaaatataaatttacagatttagataatggtaactatactgttgagttcgag
acgccagctggatacacaccaacggttaaaaatactacttcagaagataaagattctaat
ggtttaacaacgacaggtgttattaaagatcaagacaattggacattagatagcggattc
tataaaacaccaaaatatagtctaggcgattatgtttggtacgacagtaataaagatggt
aaacaagattcaactgaaaaaggtatcaaagatgttaaagttactttattaaacgaaaaa
ggtgaagtaattggaacaactaaaacagatgaaaatggtaaatatcgtttcgataattta
gatagcggtaaatacaaagttatctttgaaaagcctgctggcttaacacaaacaggtaca
aatacaactgaagatgataaagatgccgatggtggtgaagttgacgtaacaattacggat
catgatgatttcacaattgataacggatacttcgaagaagaaacatcagacagcgactca
gattcagacagcgactcagactcagacagcgactcagattcagacagcgactcagactca
gacagcgactcagactcagacagcgactcagattcagatagtgactcagattcagatagt
gactcagattcagatagcgattcagattcagacagcgactcagattcagacagcgactca
gattcagatagcgactcagattcagatagcgactcagattcagacagcgactcagattca
gatagtgactcagattcggacagcgactcagattcagatagtgactcagattcggacagc
gactcagattcagacagcgactcagactcagacagcgattcagattcagacagtgactca
gactcagatagcgactcagactcagatgcaggtaagcacacacctgttaagccaatgagt
actgtaaaagatcataataataaagcaaaagcattaccagaaacaggtagtgaaaataac
ggctcaaataacgcaacattatttggcggattattcgcagcattaggttcattattgtta
ttcggtcgtcgtaaaaaacaaaataaataa
DBGET
integrated database retrieval system