Saccharolobus shibatae: J5U23_00671
Help
Entry
J5U23_00671 CDS
T07357
Name
(GenBank) Uncharacterized protein
Organism
sshi
Saccharolobus shibatae
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TAT_signal
Molybdop_Fe4S4
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QXJ27804
UniProt:
A0A8F5BM97
LinkDB
All DBs
Position
623399..627682
Genome browser
AA seq
1427 aa
AA seq
DB search
MLKLSRRDFLKISGATAVATALILGGNSVAKRIFDSVSETNYTLNYPSDEIVYTNCFQCL
GRCAIEVVRTPTGFPRYVTGTIGWHINDGGVCPRGAADVFYYFAPSRLRYPLLRAGERGS
GKWIAVDYDTAFDILVNGTSAQSWSKLGLNPQQLGIGNFPGLLKIRETNPHALAFWEGRD
QLIPAITGGYFSANFGTANAAAHGGFCSMNVYTAGVYVTGAPVWEYAGPDEERSQYFILA
GLAGDHFPNWMRRIIARIRENGGKALTIAPERYGFYSVSDEHLFVNPASDGALAMGWIRV
LVDFHYYVYKVSQGQRVLNPITLQPVQQAVDPASGQLWMQTITTSGQVVTLSSLGDIPST
AVFPHIDEEFLRYYTNLSWLVIVNSNPQNGDCLDPTDPTAENNVGLHVRMPVSNPQYSSN
NPWLEAIMGSDGNVYAYVDTPWQKGVMPVLTLDELPQNMQSQIVQVPYKLKNGTVVKVPA
IQVTVPKALGSQETITLTATTAFELLRAELFNYDPYTPSSQTPQYGALNVASVTGIPHQT
VVRIANEIANVAFQKAIYEPAKWVDYLGRFHDHVIGRPVSIYFMRGLAAHANGFMSAASL
YYLVLMVGAWDNPGADLYKYPYPHYFPGHAVPPHPLANAPQIDPSVASAIQGLNLTIPKG
RSGFLKTEYIYNDGTVDIKNVTVVGAGPYGFPDGPDDLVIYKTGRPLLVDRGYSWELPLT
TQRSISAVVPTSYLMNKYPKQVIPYTINAMMWYITSPFWNNAYNLAEVLQMVTEKDSNGN
YIIPFTVSYDLFMHETDNVVDLIMPDLSFLEVYGFHSTFDRPTSLPQGPSDSLNWPALPS
LYPVLSTGDTLLTLLWILRAYPSQNTIDPTKNPFYTTQDPITGGDLVSPITLHDPITGTT
ILQQGQPGLISTGMFILKQGILLAGYGDKFQYILTDANGKQSPNPQQLKLYASSVPNNST
QDAVINQILSSVPSGQTFSTAPTYKIGTSNRSSGIEHYFRIPVEFQPKLQSMLQTIINKY
AAGNMTLDDINPGYVKVGKGGAVYVLPPSIRYMRNVNMFYFLGWGAYMPGAYGSIGLPYL
HRIYLEYLQKFRLAAAGKWTGYNAAYYYYYLKTKNSSFLVRSQLPNDSYGQALQKNILDY
FRPFGGYYPVPAWQSDITSDGIDLSQYPLTFFVRRHDRMYHSWSYVVPWLTAIMPYTPVM
LSAADPYVKSMGIQSGDMVQFEAVNQPSSGGQRTTITAIAFLDNATRPGTAWVIVSSQAL
PGFRSQATNSPQVKYSILNNWANISYMPPSRGGILDPVKDNAFPILYLDPITGQTSWHDS
RIRIVGKSASTQVQVVSNKFTYMGQDFSNQDILSVIVSQMGGQITVNNTPSQPTFAQPID
IPHLRFDVNNITSTSLWSYVAPGSLAPTYTIGQYKIRYGFATEPSSS
NT seq
4284 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttaaagttaagtagaagggactttctcaagatatctggtgcaactgctgtagcaact
gcgttaattttaggaggtaatagtgtagcgaagaggatatttgatagtgtttctgagacg
aattacactcttaattatcctagtgacgaaatcgtatacactaattgtttccaatgctta
ggtaggtgtgcaatagaagtagttaggactcctacaggtttccccagatatgtgactgga
acaataggatggcacataaatgatggaggagtttgtccaagaggtgcagctgatgtcttc
tattactttgctccgtctagacttagatatcccttactgagagcaggagaaaggggttct
ggaaagtggatcgctgttgactacgataccgcgtttgatatattggtaaatggtacatct
gcacaaagttggagtaaactgggattaaatccccaacaattaggcattggaaacttccct
ggattgcttaaaattagagaaacaaatccacatgctttagcattttgggaaggaagagat
caattaatacccgctataacgggtggatatttctcagcaaatttcggtacagcaaacgca
gcagctcacggtggtttctgctcaatgaatgtttacactgctggagtttacgttaccggc
gctccagtatgggagtatgcagggccagatgaggaaagatcacaatactttattttagcc
gggctagctggagatcatttccctaactggatgagaaggataattgctagaataagggag
aatggtggaaaggcgctcacaatagcccccgagaggtatggattttattcagtttctgat
gaacatctcttcgttaatccggcatcagatggagcactagcaatgggttggataagggtt
cttgttgatttccactattacgtatacaaggtttctcaaggacaaagagtacttaaccca
ataacgttacagccagtccaacaagctgtagatccggcctctggtcaattatggatgcaa
acaataaccacatccggtcaagtagtaactctatcaagtttaggtgatattccctctaca
gcagtattcccacatattgatgaagaattcttaaggtattacactaacttatcttggcta
gtaattgtaaactcaaatccacaaaacggtgactgtttagatcccacagatcctacagct
gagaataacgtgggacttcacgtaagaatgcccgtaagtaatccacagtatagtagtaat
aatccttggctagaagcaataatgggaagcgatggtaatgtttatgcgtatgttgacact
ccatggcagaaaggtgttatgccagtacttactttagatgagttaccacaaaatatgcaa
tcacagatcgttcaagtaccttataaactaaagaacggaacagtagtaaaagtaccagcc
attcaggttaccgttcctaaagctttaggttctcaagagacaattaccttaacggctact
acggcatttgagttattaagggctgagttatttaactacgacccatacacaccctcatca
caaactccacaatatggtgcactaaacgtcgcatcagttactggaattccacatcaaact
gtagtgagaattgctaatgagattgctaatgttgctttccaaaaggcgatatacgaacca
gctaagtgggtagactatttaggaagattccatgaccacgtgataggtaggccagtttca
atttacttcatgagaggtttagctgctcatgcaaatggttttatgagtgctgcatcgctt
tactacttagtgttaatggtaggtgcgtgggataacccgggcgctgatctgtacaaatat
ccttatccgcactacttccccggtcacgcagtaccaccgcatcccttggctaatgctcca
caaatagacccaagtgttgcaagtgcgatacaagggctaaatctaacaatacccaagggt
aggagtgggttcttgaaaactgaatacatatataatgatggaacagtagatataaagaat
gtaactgtggtaggagctgggccctatggatttccagatgggccagatgatttagtaatt
tataagactggaagaccattattagtagacagaggttattcttgggaactaccactaaca
acgcagaggtctatttcagctgtagtacctacctcatatcttatgaacaagtatccaaag
caagttataccatatacgataaatgccatgatgtggtacataacatcaccgttctggaat
aacgcatataatcttgcagaagttcttcaaatggtaactgaaaaagatagcaatggaaat
tacatcattccatttacagtctcatacgacttgttcatgcatgaaaccgataacgtcgtt
gatctaattatgccagacttatcattccttgaagtatatggtttccacagtacctttgat
agacccacttcattacctcaaggtccttctgattcgttgaactggcccgcattaccctca
ttataccccgtattaagtactggtgacactctattaacattactatggatattaagggca
tatccaagccagaatacaatagaccccacgaagaacccattctatacaactcaagatcct
atcacgggtggagacctggttagccctataacgttgcatgacccaatcaccggaactaca
attctacaacaaggtcagcccggattaatatccaccggaatgttcatattaaagcaaggg
atattattggcaggttatggtgacaagttccagtacattttgacagacgctaatggtaaa
caatcacccaatcctcagcaattaaagctctacgcctcatcagtaccaaacaattcaacg
caagatgctgtaataaatcagatactaagtagtgtacccagtggacaaacattttccacg
gctccaacttacaagattggcactagcaatagatcaagcggaatagaacattactttagg
attccagtagagtttcaacctaagttacaatcaatgttacagaccataatcaataaatac
gctgcaggaaacatgacattggacgatatcaatcccggttatgttaaagtaggaaaagga
ggggcagtatacgtattaccaccttcaataagatacatgagaaacgttaatatgttctac
ttccttggatggggagcttacatgcccggagcttatggatcaataggtctaccatactta
catagaatatacttagaatacttacagaagtttagattagccgctgctggaaaatggact
ggttataatgctgcctattactactactatctaaaaactaagaatagcagcttcctagta
agatcacagcttcctaatgatagttatggtcaagctctacaaaagaatattctagattac
ttcagaccatttggtggttactatcccgtaccggcatggcagtcagatataacttctgat
ggaatagatctaagtcagtatccgttaaccttcttcgttagaagacatgatagaatgtac
cattcgtggtcttacgtagtaccatggttaactgcaataatgccatacacaccagtaatg
ctaagtgcagcagatccctatgttaagagcatgggaatccaaagtggtgatatggtacag
tttgaagcagttaaccaaccgtctagcggaggacaaagaactactattaccgcaattgcc
ttcttagataacgcaacaaggccaggtacggcatgggtgatcgtatcgtcgcaagcctta
ccaggctttagaagccaagcaaccaattcaccacaggttaaatatagcatacttaacaat
tgggctaatatctcttatatgcctccatccagaggtggaatattagatcctgtgaaagat
aatgcgttcccaatattatatcttgatccaattactggacaaacttcatggcatgatagt
agaataagaattgtgggcaaaagtgcatcaacacaagttcaagtagtctccaataagttc
acttacatgggccaagacttttcaaaccaagatatacttagcgtaatagtaagccaaatg
ggaggtcaaataacagtaaataatacgccatcacaaccaacatttgcacaaccgatcgat
attccacatctgagatttgacgttaataatattacgtcaactagtctatggagttatgtt
gcacctggttcgttagccccaacttatactatagggcaatataagataagatacgggttc
gcaacagaaccctcttcctcttaa
DBGET
integrated database retrieval system