Saccharolobus shibatae: J5U23_01625
Help
Entry
J5U23_01625 CDS
T07357
Name
(GenBank) putative membrane-anchored protein
Organism
sshi
Saccharolobus shibatae
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Thermopsin
fn3_3
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QXJ28756
LinkDB
All DBs
Position
1490227..1493232
Genome browser
AA seq
1001 aa
AA seq
DB search
MEIESRLFLLVFVMLSIIPISVIPNSQTNVAVKSYPQLHSLNDIYFPPAAHNISPLKIGD
QINPYAYYSSEPAPMGIADYGISSNGPFIRNTSEWYGIVVINGLNAISNGTPWVSFQLNV
VLNYQYNGYTYALWVQDVADYNTANNEICFVDNIWNMTSPNASVVGVQGDGGIYTTNSGV
SYYAYIAPGFTTLSLPATIQLFVSVSTNSNGQPVIYFWYNDGNRWVNYDVATVTNVFNAN
NVYFLVDGYTTTGDGHLYDAELVMGGPGGGLCAYIYNASVFFRLYYWNGHNYQEVRNAYN
FGSDTAETVNNADVLTYYYSLYGLYTSGLTSGSGSLSRLWSQDTTTQLTIYTNTYNGYVY
VYNESDPYSTAIQYENSIPLSEVSFTGGQVTLTLNPMNYAILVYNQNGQLVGEANIHTYS
GENAVTSTTQFSVSVNNPTLAITVHSTSTVNININAYGTVTINVIGPSSGISYSLSQTQF
YVDGSGTATLTINGINTGTYTLIVNATLFPGYYITQAITVNVITLTAPFTLTYTVNGQSL
PQSPEVTFNFPNGTVITIPFTSGFTIQVPTGTTYTVQQIIGGNSNVRWATENQVSGIINK
PTKISVTYYEQFLITFNYKVINGQWSYSEPSVTYYYFGTPTTSSVPTTVWADYNSPYQFS
QMITSNSERIIATNYQGTIIFPGSITTNYYIQYYVSVNSPIPIYALINGKNISLTSNWYN
SSIAINVENITYYPSQLTRDVIIGISPSSTIDLTSPITIAINTITQYYLNISSPMPIYAI
INGKNTTLTNNWYNTGTQIKVENITYYPSLHERYIMKSIAPAVQFTINSPINVKVNAIKQ
YFITVNSIIPVKAYINGSLTYLNSSWINQYTNIGILNYTYYVNSQQRYVILNISPQSFVV
KSQVNVNVSTVKQYLVTINNVSTWYNEGSKVLLSANVPIYDVGEFVGTYNVSPGTYITVN
SPIDERLVLSPNYVFYGGVSGLITAVLIAVVLLLTRKGKRK
NT seq
3006 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggagatagagagtaggttattcctcctcgtcttcgtaatgttgagcataataccgata
agcgtgatacccaattcacagacaaacgtcgctgtaaagtcatatccccaacttcattca
ttaaatgacatttattttccccctgctgctcacaatatttccccattaaaaataggagat
cagattaacccttatgcttattatagtagtgaacctgcgccaatgggtattgctgactat
ggtatatcctcaaacggtccatttataaggaatactagtgaatggtatggaatagttgta
ataaatggcttaaacgcaataagtaatggcaccccgtgggttagtttccagctcaatgtt
gtgttaaactatcagtataatggatatacttatgcattatgggttcaagacgtcgcagat
tataatactgccaataacgaaatatgttttgtagataatatttggaatatgacctctccc
aatgctagcgtcgttggagtgcaaggggatgggggaatttatactactaatagtggagtc
tcatattatgcatacattgcacctggctttaccacattatcacttccagcaactattcag
ctctttgtgagcgtttctactaattcaaacggtcagcccgtaatttacttctggtataat
gacggcaatcgttgggttaattatgacgttgcaactgtcacaaacgttttcaatgcaaac
aatgtttactttttagtggatggctataccacaacgggagatggtcatctttatgatgca
gaattagttatgggagggcctggtggaggattatgcgcttacatttataacgccagtgtt
ttctttagactctattattggaatggacataattatcaagaggttagaaatgcttataac
ttcggctcagatactgctgaaactgtaaataacgcagatgttctaacatactattattct
ctatacggactatatacttctggattaacaagtggaagcgggtcactatctcgactttgg
agtcaagatactacaacacaactaactatatacacgaatacttataacggatacgtttat
gtctataatgaaagcgatccctactcgactgcaatacagtatgagaatagcatacctcta
agtgaagtgtcctttaccggtgggcaagtaacactgacacttaatcctatgaattacgca
atcctagtttacaaccaaaatggacagttagtaggggaagccaacatacacacttattct
ggtgaaaacgcagtcacttcaactacgcaattttcagtctcagttaacaatccaacactt
gccataacagttcactccacgtcgacagtgaacatcaacattaacgcctatggcactgtt
acaattaacgtcattggtccttcaagtggaatctcttactccttgtcacaaactcaattt
tacgtggatggaagtggaactgccactctaacaataaatgggatcaacacgggaacctat
acgctaattgtcaacgcaacgctattccccggatattacataactcaagccattacggta
aacgttataacacttactgccccctttaccttaacgtatactgtaaatggacaatcatta
ccacaatcaccagaagtcacatttaacttccccaacggtactgtgataactataccattt
acaagtggcttcacaattcaagtacctaccggaactacgtacactgttcagcaaataata
ggaggtaattcaaatgttcgatgggctactgaaaaccaggttagtggcattataaataaa
ccaactaagattagtgtaacctactatgaacaatttctaataacgttcaactataaggtt
ataaacgggcagtggagttattcggaaccgagcgtaacatattattattttggaacacca
actacatcatcagtaccaacaactgtttgggctgactataattcaccttatcaattctca
caaatgataactagcaattccgaaagaattatagcaacaaactatcaaggaactataata
ttccccggttcgattacaacgaactattacatacagtattacgtatccgttaactcacca
ataccaatatacgcactaataaatggtaagaacatttccctaactagtaattggtataac
agtagtatagcaattaacgtggagaacattacttactatccatcacaactcacaagagat
gtcattataggcatatcccctagcagtactatagatttaacatcgccaattacgatagca
ataaacaccatcacacagtactatctaaatatctcatcacctatgccaatttacgcaata
attaacggaaagaacacaacgttaacaaataactggtacaataccggtactcaaataaaa
gtagagaatattacatactatccgtcattacacgagaggtacattatgaaaagtatagcg
ccggctgtgcaatttacaataaactctccaattaacgttaaagtaaatgctataaaacaa
tatttcattacggtgaactcaatcattccagttaaagcttacataaacggttccctaact
tatctaaactcctcatggattaaccaatacactaacattggaatattgaactacacctat
tacgtaaattctcaacaaagatacgttatactcaacatttcaccgcaatcgtttgtagtt
aaaagccaggtaaatgtgaacgtttcaacagtaaagcaatacttagtgacgataaataac
gtatcaacgtggtacaacgagggaagtaaagtattgctaagtgctaacgtcccaatatat
gacgtaggcgaatttgttggaacgtataacgtctctccaggcacatatatcactgttaat
tcgccaatagatgaaaggttagtattatcacctaactacgtattctatggaggagtatct
ggattaataacagccgttttgattgcagtagtcttattattaacaagaaagggaaaaaga
aaataa
DBGET
integrated database retrieval system