Saccharolobus shibatae: J5U23_02345
Help
Entry
J5U23_02345 CDS
T07357
Name
(GenBank) Protease related protein
Organism
sshi
Saccharolobus shibatae
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Pro-kuma_activ
Peptidase_S8
Big_7
TcfC
MG2
LRR_3
Big_13
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QXJ29476
UniProt:
A0A8F5GU48
LinkDB
All DBs
Position
2159034..2162843
Genome browser
AA seq
1269 aa
AA seq
DB search
MYRYIFLMSMLLISIIPLVFASNSSLYQNPVTLKGFREIGTLNANQEVIVTIFVPLKNLD
LLYYYASATSNPSSPLYHKFLSPQEVQQLFLPTEEYNQILNYVKSSGFQVIFTASNSVIV
IKGTVGQVEKYLGTNYAVYSNGSVTYYTNYGYPKINAYVYSSNISAIFFAHPSTLITEST
IKSFQQEINQTFPLEGYWPTVLQKVYNVTTEGENTTIGILDFYGDPYIVQQLAYFDKVTG
LPNPPNFTVVQIGPYNPNLGIATGWAGEISLDVEVAHAIAPKANITLYIANSNIPLPAII
AYITSQNKVDTLSQSFSIPESFFSSLFNGPLFYSYIILSDEYYALGSAEGITFLASSGDA
GGSGYSNGPIGTVGYPSTSPFVTSVGGTTVYLQFPNGSYYQTAWSNYGFVPNDVNYGGST
GGVSIIEPKPWYQWGLQTPSTYPNGKLIPEISANANVYPGIYIVLPGNTTGIGGGTSEAS
PLTAGVLATIESYTHHRIGLLNPILAYMAENYYGKAIEPITFGYNIPWVATYGYNLVTGY
GTINAGYFEKILSTLNLSKELNVIVSVYNTSIPTVPPQQFYPGQRILVTANITYPNGSPV
QTGEFKVLIENYLGNLTTFNLTYNSLTKLWTGSGVLPSNASGVLFIYVYGSSDGVRGIGY
YETFSGYYVTFDYTMTFTPVYTELKNAELGITLSNSYFQAPIGVMNITLNIYSYNITTNE
YTLVTTLNVPIKDGVGVIDLPANLSVGDLLIEAVGSAYGFDAFTNGIYMQSLFVLPQVVV
EPGSVSPGQYITIEGTIIPPINLPSSTFQDALYGTNITAKLVNSNGIAISEANIPLSLNG
IYFGYLYVPKNASPGIYNILLFANYYSYTLNTTIQGFYYGQIYISNQAMISVKSVSYAFE
GQTVFIYANITNGTSEVKFGMFSATVYPSSLSFYYSTISSIIEIPLWYNPKIGEWEGNFT
LPSTISAGNLTYLAGQGYFGMPFKILITGISAFGNPTTTNPGNAYTINVLPYTLIANQTL
NKTLPYYANLVNVKIANANGNLLNDFLTNVTIINSNVKILSGNISGLVIRNSTVFMMQTN
ANNIVLYNSTLYAIGGSINGLNVIDSKVVPINVHIQGLHPELPTITINSPSKNITGTINV
TVTVVGEDVSEVNVYLNGNLINSFTNNGTHVVTINTQNYPDGGYNLTITAIQSDGLSSSN
SSYLYFENGLTNINGKVSVISNQLTNVSNSLSSSISSLRTALSEYETISLVLGIVAIVLA
IFALIRRRR
NT seq
3810 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtataggtatatatttttaatgtcgatgctattaatttccattatacccctagttttt
gcatcaaattccagtctataccaaaatccagtaactttaaaaggatttagagaaatagga
actctaaatgccaatcaagaggtaatagttacaatcttcgtaccgcttaaaaatctagat
ctattatactattacgccagtgcaacctcaaacccaagttcaccgctatatcataaattc
ttaagtcctcaagaggtacagcagttattcttacctactgaagagtataatcaaattcta
aactacgtcaaaagtagcggatttcaagtgatatttactgcatcgaattcagtaatagta
ataaaaggtacagtggggcaagttgagaagtatttaggtactaattatgctgtttactct
aatggttcggtaacatactacaccaactacggatatcccaagataaacgcatatgtatac
tccagtaacatttctgcaatattcttcgcccatccatctacgttaattactgagagtaca
ataaagagctttcaacaagagataaatcaaacatttccacttgaaggctattggccaacc
gtattgcaaaaagtttacaatgttactacagagggagagaatactacaataggaatactg
gacttttatggtgatccttacattgtacagcaattagcgtatttcgacaaggttactgga
ttaccaaatcctcccaactttactgtagtacaaattggaccctataatcccaacttagga
attgcaactggttgggctggtgaaattagcctagatgttgaagtagcacacgcaatagcc
ccaaaggctaacataacgctatatatcgctaattcaaatattcctttacccgctattatc
gcatatattacaagtcaaaataaagttgatacattatcccaaagctttagcataccagaa
agtttcttttcctcacttttcaacgggccattattctattcatacataatattaagtgat
gagtactatgcactaggttcagctgagggaataactttcctagcaagttctggagatgct
ggaggttctgggtatagtaatggaccaataggcacagtaggatatccctcaacgtcacct
ttcgtaacttcagtgggaggtacgactgtatatttacaattccctaacggctcgtattat
cagactgcttggtctaactacggtttcgttccaaatgatgtaaattatggtggttcaacg
ggtggtgtaagcataattgagcctaaaccatggtatcaatgggggctacaaaccccatct
acttatccaaacggtaagctaataccagagatctccgccaacgctaacgtataccctggg
atatacatcgttttaccaggtaacacaaccgggataggaggaggtacaagtgaggcttct
cccctaactgctggagtgctagccacaattgaaagctatactcatcacagaataggctta
cttaatcctatactagcttacatggctgagaattactacggtaaagcaatagagccaata
acgtttggttataacataccgtgggttgcaacttatggctataacttggtaaccggctac
ggtacaatcaacgcgggttactttgaaaaaatactatctacacttaatttatcaaaagaa
ctgaacgtaattgttagcgtttataatacatcaatacccacagtacctcctcaacaattc
taccctggacaacgtattctagttactgctaatataacgtatcctaacggaagtccagtg
caaactggagaattcaaggtattaatagagaactacctggggaacttaactacgtttaac
ctaacatataattcacttactaaattatggactggtagtggcgttttacccagtaatgct
agtggtgttttattcatctatgtttatggaagtagtgatggagtaaggggaattggatat
tatgagaccttctctggatattacgtaacattcgattatacaatgacttttacaccagtc
tatacagagttgaaaaatgctgaactgggaattaccttatctaactcatacttccaagca
ccaattggagtaatgaatattacccttaatatttactcctataacataacgacaaacgaa
tatacacttgtaacgacgttaaatgtacctattaaggatggtgtaggagttatcgattta
ccagcaaacctaagtgtaggagatctattgattgaagcggtaggcagtgcttatggattt
gatgcatttactaatggaatatacatgcaaagcttattcgtattgccacaagtggtagtt
gagcccggtagtgtatcaccgggacaatacatcacaatagaaggaacgattataccacca
attaacttacccagtagtacattccaagacgcattatatggtactaacattactgctaaa
ttggtgaatagtaacggaattgcaataagtgaggctaatattccattatcattaaatgga
atatactttggatatttatacgtacccaaaaacgcttctccagggatttataacatttta
ttgttcgcaaactattactcttatactttaaacactacaattcaaggattctactacggt
cagatatacatttctaatcaggctatgatttcagtgaagtcagttagctacgcattcgag
ggacagactgttttcatttacgctaatataactaatggtactagtgaagtcaagtttgga
atgtttagtgccactgtgtatccctccagtctctcattttattacagtacgataagctca
ataatagagataccgttatggtataatcctaagataggagaatgggaagggaatttcaca
ctgccttcaaccattagcgctgggaatctaacttacttagctggacaaggatatttcggg
atgccattcaagatcttaataaccggaatttctgccttcggaaatccaaccactaccaac
cccggtaatgcctatacaatcaacgtattgccatatactttaattgcgaatcaaacctta
aataagacgttaccatattacgcaaatttagttaacgtgaagatagcgaacgcaaatggt
aacttattgaatgacttccttaccaatgttaccataattaacagtaacgtaaaaatattg
agtggaaatatatctggtttagtaattagaaattccacagtgttcatgatgcagactaat
gcaaataatattgtattgtacaattcaactctatacgcaataggtggaagtataaacgga
ttaaatgtaattgactctaaagtagttccaataaacgtacacattcaaggtttacatcca
gaattaccaactattacaataaactcaccttctaagaacataactggaactattaacgtt
actgttaccgtggtaggtgaagacgtaagtgaagttaacgtatacttaaatggtaatctg
ataaattcgtttacaaacaatgggactcatgtagtaactataaatactcaaaactaccca
gatggtggatataatctaacaattacagcaattcagagcgatggtttaagtagtagcaat
agtagctatctatattttgaaaacggtttaaccaatataaacggaaaggttagtgtgata
tctaatcagttgactaatgtaagtaatagtttgtcatcttccatatcttccttaaggact
gcattatcagaatatgagactatatctttagtactcggtattgtcgcaatagttttggca
atatttgctctaataagaaggagaagataa
DBGET
integrated database retrieval system
