Sporomusa silvacetica: SPSIL_017360
Help
Entry
SPSIL_017360 CDS
T10425
Symbol
ttgB
Name
(GenBank) putative efflux pump membrane transporter TtgB
KO
K03296
hydrophobic/amphiphilic exporter-1 (mainly G- bacteria), HAE1 family
Organism
ssid Sporomusa silvacetica
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Other DBs
NCBI-ProteinID:
XFO65596
LinkDB
All DBs
Position
1753432..1756524
Genome browser
AA seq
1030 aa
AA seq
DB search
MIVMLFVVLGLVSFYRIGVELLPAINIPYVTVTVNYPGAGTEEIEQGVIKPLENSLSALS
NLKHITAVARPEKAQITLEFEFWANVDTSAINASQYVNSVLNKLPTGIQTPTVMKRDVNA
SPIMEISVIADKPLGDVYTVANDVFVERLQRASGVSDVQLYGGRDKEIAVEVDKDKLSYY
NISLNQIANRIKQENVLTPAGSVFSDNKETNVRLMAQYTSPEELASIHVTNSKNVNIPLS
NLATIREQDKRVTRYARTNGQDVVSLTVYKNSDANLVDAAKETKKQLDSLRTEYPDYQFV
IITDASQYVEDSLHNTLEALIEGLFTTGLVLYLFLRGWRSTAAVLIAIPTSLISTFFVMY
IAGFTFNMMSLMGMSLCIGILVDDSIVVLENIHRHLMLGKDAKTAAEDGRNEIGMAAIAI
TLCDVVVFMPIAFMNGMTGQYFRQFGLTIVFATLCSLFVSFTLTPMLASRFFAKGMQEAK
GKFWDAMIRAENVTIQKYERLLRLSLEHPKKIIVTVLLIFIGTVSLIPLGVIGAEYMPKT
DESSFRINVQFPVGENIDKTNSEVRQMEEYLTTIPEVKNYLSSVGQPAGNYGGISVQMVD
RKDRGRSVWQVTDQVRRYLRENFPEAVVQVSETQSSVAGVSGSTGTGGNGPSNAPVQIEI
RGANLEGIVKASYKVQDILANLKGAKDIRSSYTEGAPELRLIVDREKLKFYNTTVNDVNN
VFSGAIAGTLAGYYVNDPNNDSQDTDIYVRIKGSDGFKASDIRYIPVQAGSNLIKLSDVV
RVEDNVGPVMLRRVDKQESINISANITDRPLQEVIDDISKNIKPGDLGPNITYRFTGQAD
NMKTTFGEMAQALGLSLILVYMVLAILYESISTPLIRMCSLPFGLIGSLAFLAITYNTIN
LYSLIGILVMDGVVAKNGTLLLDYTITLMESGMNAQDAIIEAGKTRLKPICMTTLTMISG
MMPTALAMTAGSETRVSMAWVIIGGLLSSTFFTLIAIPIIFLFFDKYPMSKWFTLSGIIT
KLKHVILQKS
NT seq
3093 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgattgtcatgctgtttgtagttttaggtttggttagtttttatcgtattggagttgaa
ctgttaccggccattaatattccttatgttacagtaactgttaactatcctggggccggc
acagaggaaatagagcaaggtgttattaaacctttggaaaattcattatcggctttatcc
aacttaaagcatattacggcagttgccagaccagaaaaggcacaaatcacgctggaattt
gaattttgggcaaatgttgatacttcggcgattaatgcctcgcaatatgttaattcagta
ctgaataaactgccgactggcattcagacaccaacggttatgaaacgggatgtgaacgca
tcaccaattatggaaatatctgttattgctgacaagccgctgggggatgtctataccgtt
gctaatgatgtttttgtggaacgactgcaacgggccagcggggtatctgatgtgcaatta
tacggcggacgtgataaggaaattgcggttgaagttgataaagataaattatcttattat
aatatttctcttaatcaaattgccaaccgtattaaacaagaaaatgttttaactcccgct
ggatcggtgtttagcgataataaggaaacaaatgtcaggttaatggcacaatatacctcc
ccggaagaattggcttccattcatgttacgaatagcaaaaatgtaaatattcctttgagc
aatcttgcaacaataagggagcaggataaaagggttacgcgttatgcgcgtaccaatggg
caagatgtagtttctctgactgtatataaaaatagtgatgcaaatctggtggacgcagct
aaggagacgaaaaagcagcttgatagtttacggacagagtatcctgactaccaatttgtt
atcattaccgatgcgtcacagtatgtagaagattcattgcataatactttggaagcgttg
atagagggtttattcaccaccgggttggtgctgtatttatttttgcggggctggcgctct
acagcggcagttttaattgctataccgacatcgttgatttctaccttttttgtgatgtat
attgccgggtttacgtttaacatgatgtccttgatgggaatgtcgctatgcattggaatt
ttagtcgatgactctattgtcgtgctggaaaatattcatcggcacttgatgctgggaaaa
gatgccaaaacagcggcggaagatggacgaaatgaaattggtatggcggcaatagccatt
acgctctgtgatgttgtggtatttatgccgattgcctttatgaatggaatgaccggacaa
tattttcgccagtttgggcttaccatcgtatttgccactttgtgttcactgtttgtttcc
tttacattgacaccgatgctggcgtcaagattttttgccaaaggaatgcaagaagcaaaa
ggcaagttttgggatgcgatgatccgtgcggaaaatgtgacaatacaaaaatatgagcga
ttattgcgcttaagtttagagcatcccaaaaagattattgtgacagtgttgctgattttt
atagggacggtctcgcttatacccctaggagtgattggcgctgaatatatgcctaaaacg
gatgagagtagttttcgtattaatgtacagtttccggtaggagagaatattgataaaacc
aattctgaagtgagacaaatggaagagtatcttacaacaataccggaagttaaaaattat
ttgtcaagtgttggtcaaccggcgggaaattatggcggaattagtgtgcaaatggttgac
cgtaaagaccgtggaagaagcgtatggcaagttacagatcaggttcgccgctatttgcgg
gagaattttcccgaagctgttgtacaggttagtgaaacgcaatcttccgttgccggagta
tcaggcagtacaggaaccggtggtaatggacctagtaatgcgcctgtacaaattgaaata
cggggagcaaatttagagggtattgttaaagcttcctataaagttcaggatattttagca
aatcttaaaggggcaaaagatattcgcagttcttatacagaaggggcacccgaattgcgg
ctcatagtagaccgggaaaaattaaaattttataatacgactgtaaacgatgtcaataat
gtattttctggggcgatagccggtacactggcaggatattatgtgaacgacccaaataat
gacagccaggataccgatatttacgttcgcattaaaggcagtgacggttttaaagcttcg
gatatccgttacatacctgtgcaggccggtagtaatttaataaaactcagcgatgtggtg
agagtggaggataatgtcgggccggtaatgctgcgccgcgtggataaacaagagtctatc
aatatttcagcaaacataacggatcgacccttgcaggaagttattgatgatattagcaaa
aatataaagcctggcgatttagggccaaacattacctaccgttttaccggtcaagcagat
aatatgaaaactacttttggtgaaatggcccaggcgctaggattgtcgctgatcctggtg
tatatggtgctggctatcttatatgaatcaatttctacgcctttaatcaggatgtgttct
ttgccgtttggcttaattggttcattagcctttttggcgattacttataatacgatcaat
ttgtattcgttgattggtattttggttatggacggcgttgtggctaaaaatggtactttg
ttgttagattatactataacgttaatggaaagcgggatgaatgcccaggatgccattatt
gaagcggggaaaaccaggttaaagcctatttgtatgacaacattaacaatgatttcgggg
atgatgccgacggctttagcaatgacagctggttcggaaacgagagtcagtatggcatgg
gtcataattggcggccttctttcatctactttctttacactcattgcgattccgattatc
tttttattctttgataaatacccgatgtctaagtggtttactctttcgggaataattact
aagttaaaacatgtaatacttcaaaaatcttga
DBGET
integrated database retrieval system