Sporomusa silvacetica: SPSIL_031510
Help
Entry
SPSIL_031510 CDS
T10425
Symbol
rcsC_7
Name
(GenBank) Sensor histidine kinase RcsC
Organism
ssid Sporomusa silvacetica
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PAS_9
PAS
PAS_4
HATPase_c
Response_reg
PAS_8
HisKA
PAS_3
PAS_7
PAS_10
PDE8A_N
PAS_11
Hpt
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
XFO66980
UniProt:
A0ABZ3IMU8
LinkDB
All DBs
Position
complement(3160346..3163435)
Genome browser
AA seq
1029 aa
AA seq
DB search
MCVVAENLSFSIIENQIAGDRLMNTHFMAGMLASIGDGVIAVDTAEKIIFMNEAAERITE
WSRTKAMGQPFGAVFSLYSAKNREPLLSPTTQVLQMHTAMGLQNESVIIMKDGTAKYLSA
SCTPIKQTGEKIDGVVMVFRDITRYKMLEKKIESEEDNLRMIFNSAPVGMYTVDETEKIV
EVNDAALKMFGGDRIKVVGKSFGNAFGCECSLENEKGCGHGTSCQYCEFRRATSLAFEGL
PASGIECNKTIINEGKKVVFWFRASAAPIIVDGTIRVVVALVDITDQKEKEISIIKTRDF
YLRIFESFPTIIWRNNISSETESINENWYILTGQATEHALGHGWLDRLHPDDKKKYIDSN
LGLQDKAVLEESEIRVLDRNGQYRWLYRVCKMYYNMHGIPEGYIGMGIDITDRKIAEEGL
NRYKVLSEQAQDIITFIDMDGRIIEANEASVKAYGYSREELLKLTIFDLCEKDKEAFMKC
QMAIADRKGVFFEAVHKRKNGEFFPVEINSQGTVIGERKVLLNIIRDISERKLVEEELKG
AKDKAEAANKTKSEFLANMSHEIRTPINGITGMIDLTLMTELASDQKENLTVAKSCAHQL
LGIVNDILDFSKMEAGKLSLEVVSFKFRDLIAEIVKAYSYRAGSKGLELNYTLSADVPDI
VSGDQNRLRQILNNLLDNAIKFTENGEVSLSIKRTGGNAETFDLTFAVRDTGIGIASGEM
NKLFKTFSQVDGSITRKYGGTGLGLVISKQLVEMMGGKMWVESVKDQGSAFYFTITLKAG
TIDDRPKLKFVKPLIPLNLLLVEDDAINRVVTGRMVRKMGYQIDAAENGVEALMLWRKKH
YNIILMDIQMPEMDGIETTKHIREEEAHTGKHTPIIALTAHALLGDKERFLAAGMDEYIA
KPMRFEELINKIELFSPQNKCMNPADIIRSLQINENGDVVLACEADAVNAESSALMEIVK
LLEQCSGDEKGLGLMEESAHKIKKIATQIGLDELKSMAFKAELAARRGNLRETLAHLENI
RQLCEFRKR
NT seq
3090 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtgtgttgtcgctgaaaatttaagttttagtattatagaaaatcagattgcgggtgat
aggctgatgaatacgcacttcatggccggaatgctagcttccattggagatggagttatt
gctgttgatacggcagagaagattatttttatgaatgaagccgcagaacgaattacagag
tggagtaggacaaaggctatgggtcagccatttggcgctgtgttcagtctctatagtgcc
aaaaacagagaaccattgctcagtcctactacccaggttctgcaaatgcatactgccatg
ggcttgcagaatgaatcggtaattatcatgaaggatggaacagcaaaatatctatctgca
agctgcacgccgattaaacaaactggcgagaaaattgatggtgtagtgatggtatttcgt
gatatcacacgctataaaatgttggaaaagaagatcgagagtgaagaagacaatttaaga
atgatatttaattccgccccggtaggcatgtatactgtcgatgagactgaaaagattgtc
gaggtcaatgatgcggcactaaagatgttcggtggagaccggataaaggtagtgggaaag
agtttcggcaatgcttttggatgcgagtgtagtcttgagaatgaaaagggctgtgggcac
ggaacttcttgtcaatattgcgaattccggcgtgccacttcgcttgctttcgaaggactg
ccggcgtccggcattgaatgcaacaaaaccattattaatgaaggaaaaaaagtggtattt
tggtttagagccagtgcagcacctattatcgtagatggtacaattcgtgttgtggtagct
ttagttgatataactgaccagaaagaaaaagaaatatctattatcaaaacaagagatttt
tatttgcggatttttgagagttttcctacaattatctggcgaaataatataagtagcgag
actgaatcgattaatgaaaactggtatatactaacaggtcaggccactgaacatgcatta
gggcatggttggctggatcgactccatcctgatgacaaaaagaaatacatcgattccaac
ttggggctgcaggacaaagcggttttggaggaaagcgaaatccgggtacttgatcgtaat
ggacagtaccgctggctttatagagtttgcaagatgtactataatatgcatgggatacct
gaagggtatattggtatggggatagatatcactgacagaaaaattgccgaagaaggtttg
aacagatataaagtactttctgaacaggcgcaggatataatcacctttattgatatggac
gggcggattattgaggccaacgaagcctctgttaaagcctatggttattcacgcgaagaa
ctgctaaaattgactatttttgatctgtgtgaaaaagataaggaagcatttatgaagtgc
cagatggctatagctgacaggaagggcgtattttttgaagcggtgcataaaagaaaaaat
ggtgaatttttcccggtggaaataaattctcaaggtacggtcattggtgaaagaaaggta
ctgctaaatattatcagggatatatctgagcgaaagcttgtggaagaagaactcaaaggg
gctaaggacaaagcggaagcggctaataaaaccaaaagtgagtttcttgccaacatgagt
catgaaattcgaaccccgattaatggcattacgggaatgattgatttaacgctaatgacc
gaattagccagtgaccaaaaagagaacttaacggtcgcaaaatcttgtgcacatcagttg
ttgggaattgttaacgatattctggatttttccaagatggaagccggaaaactgtcgctt
gaggttgtcagctttaaattccgggatttaatcgctgaaatagtaaaagcttattcgtat
cgtgccggaagtaaaggtttggaattaaattataccctatcagctgatgttccggatatt
gtgagtggcgatcagaaccgattacggcagatattgaataacttacttgacaatgccata
aaatttaccgaaaatggtgaagttagcttatcaataaaaagaaccggaggaaatgctgaa
acttttgatcttacctttgctgtgcgcgataccggcatcggaattgcttctggtgaaatg
aataagctgtttaaaacatttagccaagtagatggttccattactagaaaatacggcgga
acaggattgggactggttatttcaaagcagcttgtagaaatgatgggcggcaagatgtgg
gttgagagtgtcaaggatcaggggagcgctttttactttactatcactttaaaagctggc
acaattgatgacaggccgaagttgaaatttgtcaagccattgataccattgaatcttttg
ttagttgaagacgatgcgattaatcgtgttgtgactggaagaatggttcgcaagatgggc
taccagattgatgcggcagaaaacggtgttgaagcattaatgctttggcggaaaaaacac
tataatattattttgatggatattcaaatgcctgaaatggacgggatagagaccacaaag
cacatcagggaagaggaagctcataccggcaagcataccccgattattgcgcttacggca
cacgcgcttttaggagataaggaaagatttctggcagcaggaatggatgaatatatcgct
aaaccaatgcggtttgaggaactaattaataaaattgaattgttttcaccacaaaataaa
tgcatgaatcctgccgatattattcgtagtttgcaaattaatgaaaatggggacgttgtt
ttggcttgcgaagcagatgcggtaaatgcagagtcttcggcattgatggaaatagtaaaa
ttgcttgaacagtgcagtggtgacgaaaaaggtttagggctgatggaggagtctgcccac
aagataaaaaaaatagcgactcaaattggtttagatgaattaaagagtatggcctttaag
gctgaattggccgctaggcgcggtaatttgagagaaacgcttgcgcatttagaaaatatt
cgacagctatgcgaatttcgcaaaagataa
DBGET
integrated database retrieval system
