Staphylococcus simulans: AL483_07165
Help
Entry
AL483_07165 CDS
T04303
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
ssif
Staphylococcus simulans
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
FIVAR
Bact_lectin
He_PIG
YSIRK_signal
Gram_pos_anchor
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AMG96614
LinkDB
All DBs
Position
complement(1457540..1467646)
Genome browser
AA seq
3368 aa
AA seq
DB search
MKKLDFLPNLRNRYSIRRFTVGTASILIGSLLFLGHSGEAKAAENINDNNTVVEASNDSS
TTQQAPEENNKTSLEKTVDATQQQTDNKAQTQNALEEVKKQATTEITSLKNLNKEEVDSY
TLEVQQADSESTVHAIVEKAKAAAQAVEQKEESIQTQKTENSKESTETTVEKTKETPSTE
AEPVKAEATVEKASEPVVENKEEAPESVVTPATEPAVEKAVETVTETSVLSPEQKVEKVK
ADLSNDYDSAKVDAVLAVIDTTDLTPEQLKSEVLRLLLEEASAQKDLFSPQATLPRTGEE
ASGYSTRAFDLEEAASQEIVVTKENFGEYFKTLNDATYDSQSGVVTLTTNEANKSGAMSL
DFKLNLTKDFSFSGAVNLGDKYEAHPKDGVTGGEGLAITFNPGKTYTLGLTGQGFGIGGE
SSSFGFKLDTFVNKANDDKSKAFSDTIQFENKGAFGAFIYTTETGLVNTVIINPNASGNA
ALLKEQPNNQLVPFKFNYNGTTKVMTITYGTQTWTQNIQDYINYSRKDSFAFSIVASTTD
HYNLQQIKLDEFRFTASAVLDEYFIDDDTEEAIDKPLRTAGDVNEKITLKDHAEYLAEKG
YEFGTEKVRDEAHAIGYDEGAGTVTLENDAQQLVYTVVDIQNPTIAEVTDVTTNVSEAIT
PITLDITDNSGHFDTIAVTGLPTGLSFNETTKQITGTPTTPGDATVEVTATDMAGNTTTK
TFKISVAGAQAPTITPINAQTGEAYTPITPIAVNVEGDLNPAPTVAVTGLPAGLSFDAAT
KQITGTPTAEGTFNVTVTATQEASEPATSTFNITVQPNAALKDLKAAVADAATVNKDSYT
PNSVEAYEAKVTAGDTLAGQPENGSNAQFADASKAIKDAKNALVPRADKAALNQSITTAE
ALQPLEAGDPEDDALKTALETAKTVQGDLNIDQPAVNKAKTDLDNAIAAKNLQDELDKED
ALDELRKTLEYVETIDPAQFTTSSKKAFTEALTNAKTILGSPGSKTIAEIKAATNALEDA
QNVLVPQADKTALKTAINTANGYNNLNPNNPVDKALQDKLAAANAVNTNGDATADQVKTA
TDDLNTAITAKKAQDDQIAKDAAAKKAALDALNDELNKVKALDKATYTPNTVTPLTEKQT
AAQAIADAPDTKTTEEINAATKALKDAQNALVPKANKDDLNNSVKTAEALPLNPADTEDK
AVQDALDKAKTVQADDNATQDAVNTAQTDLDNTVAAKKAQDAKDAAAKQAALDALNDELN
KVKALDQTTYTPNTVTSLTEKQTAAQAIADAPDTKTTEEINAATKALKDAKDALVPKADK
TDLQKALDTAKAITGLEPTDKEDKAVQDAIDAAQTVNKDDNATPQQVADATKAINDAVAT
KAHQDALDQLNKALEDAAKVDKTDYTADSVKPFDTAVKAGKTAAGDNTSTVEALNNATKA
VKDATAQLVPDKSKLDTAITEAKALEPLTDSNTDQLLKNVLNAAETVKNNPNATPEEIKT
ATWNLEDEINNKKAADAIEALKSAVNKAEQLNEAKYTPNTYEPLKTAITEGQKIINNPPS
ADTPATLAKAKQIEELVNALKERADKTELGNALDKAIAYGDLNPNDAEDKALQDAVTAGQ
KVNGDGNATTEEVANAVKTINDAIAAKERQDAVDELTKAINDAKTVNKDDYKPNTVTPFE
TAVTAGETAKDDATKTVEEIKAATKAITDAKNALDKKADKTELNTSVTTAEKLGAFDTKD
AEDKAVQDALDKAKTVQADQNATQEAVNTAKTELDNAVNAKKDQDAKDAQAKQEALDALK
AELDKVKAVDKTVYTPNTVTTLNEKETAGNDIVAAPEAKTTEEINQATQALKDAQNALVK
KADKTELQKALDKANTFTDLAATDKEDKAVQDAVEAGNTVKADDNATVEQVEKATKAIND
AVAAKERQDALDELNKAITDAKTVNKDDYKPNTVTPFETAVTAGETAKDDATKTVEELKA
ATKAITNAKNALDKKADKTELNTSVTTAEKLGALDTNDKEDKAVQDALDKAKTVQADDNA
SQEAVNTAKTELDQAVAAKKTQDELDALKKAALDELKAELSKVGKLVYKDYTPDSVKPLA
DKEVLGNAIVTIPELKTTEEIKAVTQELKDLQKALVQKADKTELVKALEKAKTLGALDAT
DKEDKAVQDAVTAGNTVNEDGNATTEQVANATKAINDAIAVKERQDALDELQKAIDDANT
VKKDDYKPNTVTPFEAAVTAGETTKDDATKSVEEIKAATKAITDAKNALDKKADKTELDT
SVTTAENIGALDTNDKEDKAVQDALDKAKTVQVDQNATQEAVNTAKTELDNALNAKKAQD
TKEAVEKQNALDALKAELEKAKTVNKELYTTNSVKVLTDSETAGQNVVDNAANKTTQEIE
EATKALKDAQANLVSKADKTELVKALEKAKTLGDLVATDKEDKAVQDAVTAGEAVNEDHN
VTQEQVANATKAINDAIAAKERQDALDALTKAIKEANSVVKDEYKPNTVTPLEEAVKAGE
TARADATKTVEELKQAAQTITDAQNKLELKANKEELNKVVKTTETLELNPADKEDKAVQG
ALNTAKEVQADQNASQETVDKVKTDLENAVKAKTTQDKVDAFNKALDALKAELEKVKTID
KDFYTPNSVKPVTDAETAGQTIVNNSADKTVEEINKATQDLKEAQKHLVEKADKVELDKV
IDTAENTELNVNDKEDKAVKDALDKAIKVQEDLNATQEEVDKAQSDLAKALENKAAQDKA
DQEKVQAFNKALEALKAQLASSRTVVKDNFTPNSVAPFQEAQAVAQGIVNNPESVTVEQV
VKATEVLKSTQSSLVTKADKSELEKVIETAEGLDLNVTDKEDKAVKEALDTAVTVEADQN
ATQESVNKATSELEKAIENKVTQDKVDAFNKALEALKAQLASSRTVVKDNFTPNSVAPFE
DAQAVAQGIVNNPESVTVEQVVKATEVLKSTQSSLVTKADKSELEKVIKTAEGLDLNVTD
KEDKAVKDALDTAVTVEEDQNATQESVNKATSELEKAIENKVAQDKVDAFNKALEALKAQ
LASSRTVVKDNFTPNSVAPFEDAQAVAQGIVNNPESVTVEQVVKATEVLKSTQSSLVTKA
DKSELEKVIKTAEGLDLNVTDKEDKAVKDALDTAVTVEADQNATQESVDKAQSDLEKALE
TKAAQDKADAVAKAKADALAELEKALDKTETIDKSKYTPESVEKLDQAVVDGKVIVEKAD
NVSVQDIKEATKAVETALNGLEKVKAPAKETGKTTESTLNTAKSDTKSDVKAQDKQTSKG
TKGTKAEKAGATKAKAENAGKNKAKALPETGQDVSSIDPQYASLMFAIGGLMMFFRKRKN
EDKDNTEK
NT seq
10107 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaaattggactttttgcctaacttaagaaatagatactctattagaagatttact
gtaggcacagcatctattctaattggatctctattattcttaggtcatagcggcgaagcc
aaagcagcagagaatataaacgataacaatacagttgtagaggcttctaatgatagtagt
acgacacaacaagcacctgaggaaaataacaaaacgtcacttgaaaaaacagttgatgct
acacaacagcaaactgataataaagcacaaacgcaaaatgcattagaagaagttaaaaaa
caagctactacagagattacttcacttaaaaatttaaacaaagaagaagttgacagttat
actctagaagtacaacaagcagactcagaatcaactgtccacgctatagttgaaaaagct
aaagcagcagcacaagcagttgaacaaaaagaagagtcaattcaaacgcaaaaaactgaa
aattcaaaagaatcaacagaaacaactgttgaaaaaacaaaagaaacaccttctactgaa
gctgaaccagtgaaagcagaagcaactgttgagaaagcatcagaacctgttgttgaaaac
aaggaagaagctcctgaatcagtagttactcctgcaactgagccagcagtagaaaaagcg
gttgaaacagtaactgaaacatctgtattgtctccagaacaaaaagtagaaaaagtaaaa
gcagacttgagtaatgactatgacagtgccaaagtggatgcagttctagcagttattgat
actacggacttaacaccagaacaattaaaatcagaagtattaagactcttacttgaagaa
gcatcagctcaaaaagacttatttagccctcaagcaactttaccaagaacaggtgaagaa
gcttcaggttattcaacaagagcatttgatcttgaagaagctgcaagccaagaaattgtt
gtaactaaagaaaattttggtgaatattttaaaacattaaatgatgcaacttatgattct
caaagcggtgttgtaacattaacgactaatgaagcgaacaaaagtggagctatgtcttta
gattttaaactaaatttaactaaagatttcagtttttctggagcggttaatcttggtgat
aaatatgaagctcatccaaaagatggagtaactggtggagaaggtctagcaattacattc
aacccaggtaagacctatacccttgggttaacagggcaagggtttggtattggtggcgaa
tcatctagttttggttttaaattagatacatttgttaacaaggctaatgatgataaaagc
aaagcattttcggatactattcaatttgagaataaaggtgcttttggcgcatttatttac
actacagaaacaggtctagttaatactgtaataataaatccaaatgcttcaggaaatgcg
gctttattaaaagaacaaccaaacaatcaattagtaccttttaaatttaattataatggt
acaactaaagtgatgacaattacgtatggtacgcaaacatggactcaaaacattcaagac
tatattaactattcacgtaaagattcatttgctttttcaattgtagcttcaactacagat
cattataatttacaacaaatcaaattagatgagttcagatttacagcttcagctgtatta
gatgaatactttattgatgacgatacagaagaagcaattgataaacctcttcgtactgcg
ggagatgttaacgaaaaaatcacattaaaagatcacgctgaatatttagctgagaaaggt
tatgaatttgggaccgaaaaagtcagagatgaagctcatgcaattggttacgacgaaggt
gctggaactgtcactttagaaaatgatgcacaacaacttgtgtatacagtcgttgatatt
caaaatcctacaatcgcagaggttacagatgttactacaaatgtttcagaagctattaca
ccaatcactttggatattacggataatagtggacactttgacacaatagcagttacaggt
ttaccaactggtttatcatttaatgaaacaacaaaacaaattacaggtactccaacaaca
cctggagatgcaactgttgaagtaacagcaacagatatggctggaaatacaactactaaa
acatttaaaatttctgtagcaggagctcaagcacctacaatcacaccaatcaatgcacaa
acaggcgaagcttatacaccaattactccaatcgctgtaaatgttgaaggggatttaaat
ccagccccaactgtagcagtaacgggtctaccagcaggtttatcgtttgatgcggcaaca
aaacaaattacaggtacgccaacagctgaaggaacatttaatgttacagttacagcaaca
caagaagcgagtgaaccagctacttcaacatttaatattactgttcagcctaatgctgca
cttaaagatttgaaagcagcagtagcagatgcagccactgtaaataaagatagctataca
ccaaacagtgttgaagcttatgaagcaaaagtaacagcgggcgacacattagctggtcaa
cctgaaaatggttcaaatgcacaatttgccgatgcatcaaaagctattaaagatgctaaa
aatgcattagttccaagagcagataaagcagcattgaatcaatctattacaacagcagaa
gctcttcaaccattagaggctggagatcctgaagatgatgcgcttaaaacagcattagaa
actgctaaaactgttcaaggtgatttaaatatcgatcaacctgcagttaataaagcgaaa
actgatttagataatgcgatagcagctaaaaatttacaagatgaattggataaagaagat
gctttagatgaattaagaaaaacattagagtatgttgaaactattgacccagctcaattt
acaacaagtagtaaaaaagcgtttactgaagctttgacaaatgctaaaactattttaggt
tcaccaggttctaaaacaattgctgagattaaagcagctacaaatgcattagaggatgca
caaaatgtattagttcctcaagcagataaaacagcacttaaaacagcaattaacacagct
aatggttataacaatctaaatccaaataatcctgtagataaagcattacaagataaatta
gcagcagcaaatgcggttaatacaaatggtgatgcaacagctgatcaagttaaaacagct
acagatgatttgaatactgcgattacagctaaaaaagctcaagatgatcaaatcgctaaa
gatgcagctgcaaaaaaagcagctcttgatgcattaaatgatgaattgaataaagttaaa
gctttagacaaagcaacatatacaccaaatacagtgacaccattaactgaaaaacaaaca
gcagcccaagccattgctgatgcaccggatactaaaacaactgaagaaatcaatgccgca
acaaaagcattgaaagacgctcaaaatgctttagttccaaaagctaataaagacgattta
aataattcagttaaaacagctgaagcattaccattaaatccagctgatactgaagataaa
gcagttcaagatgcattagataaagcgaaaacagttcaagctgatgacaacgcaacacaa
gatgcggttaatacagctcaaactgatttagataacactgttgcagctaaaaaagctcaa
gatgctaaagatgcagccgcaaaacaagcagccctcgatgcattaaatgatgaattgaat
aaagttaaagctttagaccaaacaacatatacaccaaatacagtgacatcattaactgaa
aaacaaacagcagcccaagccattgctgatgcaccggacactaaaacaactgaagaaatc
aatgcagcaacaaaagcattgaaagatgccaaagatgctttagttccaaaagcagacaaa
actgatttacaaaaagcacttgatactgcaaaagctattactggtttagaaccaactgat
aaagaagataaagcagtccaagatgctattgatgctgcacaaacagtcaacaaagatgac
aatgcaacaccacaacaagtagcagatgcaacaaaagccatcaatgatgctgttgctaca
aaagcgcatcaagatgctttagatcaattgaataaagcattagaagatgctgccaaagta
gataaaacagattatactgctgattctgttaaaccatttgatacagcagtaaaagcgggt
aaaacagcagctggcgataacacatcaacagttgaagcattgaataatgcgactaaagct
gtgaaagatgctactgcacaacttgtaccagataaatcaaaattagatacagcaattact
gaagcgaaagctttagaacctttaactgattctaatacagatcaattattgaaaaatgtt
ttaaatgcagctgaaactgttaaaaataatccaaatgcgacacctgaagaaattaaaaca
gcaacttggaatcttgaagatgaaatcaataacaaaaaagcagcagacgcgattgaagct
ttaaaatcagctgtaaataaagctgagcaacttaatgaagcaaaatatacaccaaatacg
tatgaaccgttaaaaactgcaattactgaaggacaaaaaatcatcaacaacccaccatct
gctgatacaccagcaacacttgcgaaagcaaaacaaattgaagaattagtgaatgctttg
aaagaaagagcagataaaactgaacttggcaatgctttagataaagcaattgcatatggt
gatttaaatcctaatgatgcagaagacaaagcattacaagatgcagttactgcaggtcaa
aaagtaaatggtgacggtaatgcgactactgaagaagttgctaacgcagttaaaacaatc
aatgatgcgattgccgcaaaagaacgtcaagatgctgtagacgaattaactaaagctatc
aatgacgcaaaaacagtcaataaagatgactacaaaccaaatacagtaacaccattcgaa
acagcagtcacagctggtgaaactgcgaaagatgacgcaactaaaacagttgaagaaatc
aaagcagctacaaaagccatcactgatgctaaaaatgcactagataaaaaagcggataaa
acagaattgaacacatctgttacaacagctgaaaaattaggtgcatttgatactaaagat
gctgaagataaagcagtccaagacgctttagacaaagcaaaaacagttcaagctgatcaa
aatgcaacacaagaagcagtgaatacagctaaaactgaattggataatgcagtcaatgct
aagaaagatcaagacgcgaaagatgcacaagctaaacaagaagctttagatgcattaaaa
gcagaacttgataaagtgaaagcagtagataaaactgtatatactccaaacacagtcaca
acattaaatgaaaaagaaactgctggtaatgatattgttgcagcacctgaagctaaaaca
actgaagaaattaatcaagcaactcaagcattgaaagatgcccaaaatgctcttgtgaaa
aaagcagataaaacagaattacaaaaagcacttgataaagcgaatactttcactgattta
gcagcaacagataaagaagataaagcggttcaagatgctgtagaagcaggtaatactgtt
aaagctgatgacaatgcaacagttgaacaagttgaaaaagctacaaaagcaatcaacgat
gcagttgccgcaaaagaacgtcaagatgctttagatgaattgaataaagccatcacagac
gcaaaaacagtcaacaaagatgactataaaccaaatacagtaacaccatttgaaacagca
gtcacagctggtgaaactgcgaaagatgacgcaactaaaacagttgaagaattaaaagca
gctacaaaagctatcactaatgctaaaaatgcattagataaaaaagcagacaaaacagag
ttgaacacatctgtgacaacagctgaaaaattaggtgcgcttgatacaaatgataaagaa
gataaagcagtccaagatgctttagataaagcaaaaacagttcaagctgacgacaatgcg
agtcaagaagctgtaaatacagctaaaactgaacttgatcaagccgttgcagctaagaaa
actcaagacgaacttgacgcacttaaaaaagcagcgcttgatgaattgaaagcagaactt
tcaaaagtcggtaaattagtctataaagactacacaccagacagtgtgaaacctttagct
gacaaagaagttttaggcaacgcaattgttacaattcctgaacttaaaactactgaagaa
atcaaagctgtcacacaagaattgaaagatttacaaaaagctttagttcaaaaagcagat
aaaacagaacttgtgaaagctcttgaaaaagctaaaactttaggtgcacttgacgcaact
gacaaagaagacaaagccgttcaagatgcagtcacagctggtaatacagtcaatgaagat
ggcaatgcgactactgaacaagtagcaaatgccacaaaagctatcaacgatgcaattgct
gtgaaagaacgtcaagacgctttagatgaattacaaaaagcaattgacgatgctaacaca
gttaagaaagatgactacaaaccaaatacagtgacaccgtttgaagcagcagtcacagcg
ggtgaaactacgaaagatgacgcaactaaatcagttgaagaaatcaaagcagctacaaaa
gcaattactgatgctaaaaatgcattagataaaaaagcagacaaaacagagttggacaca
tctgtgacaacagctgaaaatataggtgcgcttgatacaaatgataaagaagataaagct
gttcaagacgctttagacaaagcgaaaacagtacaagttgatcaaaatgcaacgcaagaa
gcagtgaatacagctaaaactgaattagataatgcgttaaatgctaaaaaagcacaagat
actaaagaagctgttgaaaaacaaaatgctttagatgcattgaaagcagagcttgaaaaa
gcaaaaacagttaataaagaactttacactacaaacagcgtaaaagttttaactgactct
gaaactgcaggacaaaatgtggttgataatgcagctaataaaacaactcaagaaattgag
gaagcaacaaaagcattgaaagatgctcaagcaaacttagtttcaaaagcagataaaaca
gaacttgtgaaagctcttgaaaaagcaaaaactttaggtgacttagtcgcaactgacaaa
gaagacaaagccgttcaagatgcagtaacagcaggtgaagctgttaatgaagatcacaat
gtaacacaagaacaagttgctaacgcaacaaaagcaattaacgatgcgattgctgcaaaa
gaacgtcaagatgctttagatgctttaacaaaagctattaaagaagcaaattcagtagtt
aaagatgaatacaaaccaaacacagtcactccattagaagaagctgttaaagctggtgaa
acagctcgtgctgatgctactaagactgttgaagagttgaaacaagcagcacaaacaatt
actgatgctcaaaataaacttgaacttaaagcaaataaagaagaattgaataaagttgtt
aaaactacagaaactttagagcttaatccagctgataaagaagataaagcggttcaaggt
gcattaaatactgctaaagaagttcaagcagatcaaaacgcatcacaagaaacagttgat
aaagttaaaactgatcttgaaaatgcagtaaaagctaaaacaactcaagataaagtagac
gcattcaacaaagcgcttgatgcattgaaagcagaacttgaaaaagtaaaaactatcgac
aaagacttctacactcctaatagtgttaaaccagttacagatgctgaaactgcaggtcaa
actattgtaaataattctgctgataaaacagttgaagaaatcaataaagcaacacaagac
ttgaaagaagcacaaaaacacttagtagaaaaagctgacaaagttgaacttgataaagtc
atcgacacagcagaaaatactgaattgaacgtaaatgataaagaagataaagcagtcaaa
gatgctttagacaaagctatcaaagttcaagaagacttgaatgcaacacaagaagaagtc
gacaaagctcaatctgatttagcaaaagcgcttgaaaataaagcagctcaagacaaagct
gaccaagaaaaagtacaagcgttcaacaaagcgttagaagcgttgaaagcacaacttgca
agctcaagaacagtggttaaagataacttcacaccaaacagcgttgctccattccaagaa
gcacaagcggtggcacaaggtatcgtaaacaatccagaatccgtaacagtggaacaagtt
gtcaaagcaacagaagtcttgaaatcaacacaatcaagcttagtaaccaaagcagataaa
tcagaacttgaaaaagtaattgaaactgctgaaggattagacttgaatgtaactgataaa
gaagacaaagctgtaaaagaagcattagatacagcagtaactgttgaagcagatcaaaac
gcaacgcaagagtctgtgaacaaagcaacttctgagttagaaaaagcaatcgaaaataaa
gtgactcaagataaagtcgatgccttcaacaaagcacttgaagcgttgaaagcacaactt
gcaagctcaagaacagtggttaaagataacttcacaccaaacagtgttgctccattcgaa
gatgcacaagcggtagctcaaggaatcgtgaacaatcctgaatctgtaacagtggaacaa
gttgtcaaagcaacagaagtcttgaaatcaacacaatcaagcttagtaaccaaagcagat
aaatcagaacttgaaaaagtgattaaaactgctgaaggtttagatttgaacgtgactgat
aaagaagacaaagctgtaaaagatgcattagatacagcagtaactgttgaagaagatcaa
aatgcgactcaagagtctgtaaacaaagcaacttctgagttagaaaaagcaatcgaaaat
aaagtggctcaagataaagtcgatgccttcaacaaagcacttgaagcgttgaaagcacaa
cttgcaagctcaagaacagtggttaaagataacttcacaccaaacagtgttgctccattc
gaagatgcacaagcggtagctcaaggaatcgtgaacaatcctgaatctgtaacagtggaa
caagttgtcaaagcaacagaagtcttgaaatcaacacaatcaagcttagtaaccaaagca
gataaatcagaacttgaaaaagtgattaaaactgctgaaggattagacttgaatgtgact
gataaagaagacaaagctgtaaaagatgcattagatacagcagtaactgttgaagcagat
caaaatgcgactcaagaatctgtagataaagcacaatctgatttagaaaaagcacttgaa
actaaagcggctcaagataaagcagatgcagttgcgaaagccaaagcagacgctttagct
gaacttgaaaaagcattagataaaactgaaacaattgataaatctaaatacactccagaa
tctgttgaaaaattagatcaagcagttgtagatggaaaagtcattgttgaaaaagcagat
aatgtttctgttcaagatattaaagaagcaactaaagctgttgaaactgcattgaatggt
ctagaaaaagttaaagctcctgcgaaagaaacaggaaaaacaactgaatctacactaaat
acagctaaatctgatacaaaatctgatgtgaaagcacaagataaacaaacatctaaaggt
acaaaaggtacaaaagctgaaaaagctggagcaactaaagctaaagctgaaaatgcaggc
aaaaataaagcgaaagcattaccagaaacaggtcaagatgtttcatctatcgacccacaa
tacgcttcattaatgtttgcgattggtggtttaatgatgttcttcagaaaacgtaaaaat
gaagacaaagataacactgaaaaataa
DBGET
integrated database retrieval system
