Sporomusa sphaeroides: SPSPH_042380
Help
Entry
SPSPH_042380 CDS
T10405
Symbol
cirA_4
Name
(GenBank) Colicin I receptor
KO
K16089
outer membrane receptor for ferrienterochelin and colicins
Organism
ssph Sporomusa sphaeroides
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ssph00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
ssph02000
]
SPSPH_042380 (cirA_4)
Transporters [BR:
ssph02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
SPSPH_042380 (cirA_4)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
Plug
FkbH_N
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WXA41437
LinkDB
All DBs
Position
complement(4570190..4572172)
Genome browser
AA seq
660 aa
AA seq
DB search
MKNVFTSPRKLTLLSLSILTALAMPVYAEEQAVDTRNVTITATRTEQEIKETPSAVEVIT
REDLDKIGAHNLADALQMATSINVSAPAMAGSNITVRGMSTRHSLILINGKRLVSEGSYS
TANSYELERINMENVERIEIVRGPVSSMYGSDALGGVINIITRKPEKEEFTFSLSPQRYS
DKFSVGNENYFLRYDSGKNSKWSWIVSADRTETDAYTNDDGTAENQFGQRDNFNLEGTYD
LSDDTFLDVSINLLREDLKGRTTETSGALRNDTYDNTRDQFSLGLRGKAKNGDYQIRTYY
GEHEKINKSFLDSTGQLTDFDVSKRKTWTLEGHLSTQIADNHLLTTGGEIRKEEYRGTRI
GTGNNIFDITYGNITKQGSEADMDYSAIYVQDEWLVNDRLLVIPSVRYDDSNRFSGNVSP
KLGMTYKMNDNSRLKLNVGKGFKAPTLDDMYMEMTKRMAGMTVHVTGNPDLKPEKSTSYE
LAIEGERGNTFGKLSYFVNDVKDLISTNTKVSFVPGVGMRADSKYLNEDKADIDGVEFEI
GRKLTDKLTLKLNYTYLDATGTTGQRLEGRAKQQGTVQLHYDDNRENGISAVLWNEWKKD
YLYSSNDDIHKTYALWNVSVNKKWNENFSSQLGVKNIFNKKDAELNLMGSMVHAGMTFTL
NT seq
1983 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaacgtgtttacaagccccaggaagctgacgctgctgagcctgtcgatattaacc
gcactggctatgccggtctatgcggaggaacaggccgttgatacccgcaatgtaacgatt
acagccaccagaaccgagcaggagattaaagaaaccccgtcggctgttgaggtcattacc
agggaggatctagacaaaatcggggcgcataatttggccgatgccttgcagatggctacc
agcatcaacgtttccgctccggcgatggctggcagtaatataaccgtacgggggatgtcg
acacgacattcactgattctgatcaatggcaaacggttggtttcagaaggcagttattcg
actgccaattcctatgaactggaacggattaacatggagaatgttgaacggattgagatt
gtccggggaccagtcagttctatgtacgggtcagatgccttgggaggtgtaattaatatc
ataacccgcaaaccagagaaggaagagtttactttttccctaagcccccagcgctacagt
gataaatttagtgtcggtaatgaaaattattttcttcgctatgatagtggcaaaaatagc
aaatggtcctggattgtcagtgccgaccggactgagaccgatgcttatactaatgatgat
ggtaccgctgaaaatcaattcgggcagcgcgacaattttaacctggaaggtacctatgat
ttatctgacgataccttccttgatgtctctattaatttattgcgcgaggatttaaaggga
cgcacaaccgaaacctcaggggctcttcgcaatgacacttatgataatacccgggaccaa
ttcagcctggggctgcgcggtaaggctaaaaatggtgattatcaaatacggacttattat
ggggaacatgaaaaaattaataaaagctttttagatagcaccggacaactaacagacttt
gatgtttccaagcgtaaaacctggaccctggaaggacatctttcaacgcagattgctgat
aaccatttactgacaacaggcggtgaaattcgaaaggaagaataccggggaacgcgaatt
ggtaccggtaataatatttttgacattacttacggcaatattaccaaacaaggttcggaa
gctgatatggattattcggccatctatgtgcaggatgagtggctggtcaatgaccgtctg
ctggttattccttcggtgcggtatgacgacagcaaccgcttttccggcaatgtcagcccc
aaactgggtatgacttacaaaatgaacgacaattcccgtttaaagctaaatgttggtaag
ggttttaaagcacctactctggatgacatgtatatggaaatgacgaaaagaatggcaggt
atgactgtacatgtaaccggcaatcctgatttgaaaccggagaaatccaccagctatgag
ctggctatcgaaggggagagaggcaacacttttggcaaattatcgtattttgttaatgat
gtgaaagaccttatatctacgaatacaaaggtgtcttttgttccgggggtaggaatgcgt
gccgattcaaaatatttaaatgaggacaaggccgacattgacggtgtggagtttgaaatt
ggccgcaagctgacggacaagctgacgctgaagctcaattacacctatctggatgccacc
gggacgaccgggcagcggctggaaggccgggccaagcagcagggaacggtacaactacat
tatgatgacaaccgggaaaatggtatcagtgcggtgttatggaacgagtggaagaaagat
tatttgtattcctctaatgatgatattcataaaacctatgccttgtggaatgtatcggtt
aataaaaagtggaatgaaaatttcagcagccagcttggtgtaaagaatatctttaataag
aaggatgcagaacttaatttgatgggatccatggtccatgccggcatgacctttacatta
tga
DBGET
integrated database retrieval system