Streptomyces spinosirectus: LXH13_24115
Help
Entry
LXH13_24115 CDS
T08958
Name
(GenBank) SUKH-4 family immunity protein
Organism
sspn
Streptomyces spinosirectus
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SUKH-4
XOO_2897-deam
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UIR19937
LinkDB
All DBs
Position
5184668..5187508
Genome browser
AA seq
946 aa
AA seq
DB search
MVTFAQAQERAEEWINGELPSYQHREVRVREFELGFVVWGEDRADGPRSDGGNQRLVIAR
DSGEATLWPSLPVGEVIRRYEEEYGRPDGVAEPVLAAPERVDLNQTSFLLSPPEWLQEAA
DKLGIPDRRGGSGAGAGAGSGAAAAAAAAGDGASGAGVPGAGASGVAALPETQAGTPVPP
VAPAAPAASAAGGGWPEAGAGGEAGGGAGARPAGGTPWAGTDTNAESGEDRSVPLPATVF
APPLSNPDENTDTPADAKTALMSGGSQLPRTTVAPQVGAPGAPGAPGTPPPGAQAPGAVP
PPPPPPPSTYGYPQAGAAAGPGTPPPPAPQPPAAPGRPLPPDAGDIADAATSKAGPPPRR
STTPPPPSAPGAPGARPGGTPPPPQAPGAGGYVPTQLVSSLGPEGPGGAAGPGAPQAPGA
PQAQGGAPNPPGAPNPPGAPNPPGVPNPPGPPNTPGGTPPGGVHHAATMLADPGRPGQAG
GPPQPPAPPGAPGAPGAPQPPGAPGAPGAPAAPGVPGGSTGGRGAVHHAETVLAAPPVGG
PGAPPPPQAPGVPGAPQAPGVPGVPGVPGVPGVPGVPGAPQPPGAPGMPPHVAPPVPPGA
MPPPGQAGPGPQPSYGYPQPQGQPTVGPGYQAVLRYRAQDGSEQQLIRRSAPGTPHPEWQ
IFHELRAMNVPPDQVLELHTELESCALPGAYCARMIREQWPQARLASIAPYGTDHASRQQ
GMQQLIAHQGELHQVADGPARPAPVRASLPPVQAAPPIPPESIAQELAGAFGPGVFRFEQ
VAVSRQGVPPVVAQGLVMGGLPMDMGPFFWAQAQPGRPVPTLAELAQERGVQPASDAGSY
LVMGSDFGKAICVQYGTANIVAVPVESGPGGAPVPPQFVNTGLPEFQRCMALLGRMWRLR
FGLNQEQAGRWTVDFQAQLASLDPAALGSPESWWSVLLEQMWDGLL
NT seq
2841 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggtgaccttcgcgcaggcgcaggagcgcgccgaggagtggatcaacggtgagctgccc
tcgtaccagcatcgtgaggtgcgggtgcgggagttcgagctcgggttcgtggtgtggggc
gaggaccgggcggacgggccgcgttcggacggcggcaaccagcggctggtgatcgcccgg
gacagcggcgaggcgaccttgtggccctcgttgccggtgggtgaggtcattcgccgctac
gaggaggagtacggccgcccggacggggttgccgagcccgtgctggcggctccggaacgg
gtggatctgaaccagacgtcgttcctgctgagtccgccggagtggctgcaggaggcggcg
gacaagctggggattccggatcggcgcgggggctcgggtgccggtgctggtgccggttcc
ggcgctgctgctgccgctgcggcggcgggcgacggtgcgtccggggccggtgtgccaggg
gccggtgcgtcgggggtggccgcgctgcccgagacgcaggccgggacgccggttccgcct
gtcgctccggctgctccggctgcttcggccgccggtggcggatggccggaggcgggtgcg
ggcggtgaggccggcggtggcgccggggcgcggcccgccggagggaccccgtgggccggt
accgacaccaacgcggagtcgggtgaggaccgttcggtgccgctgcccgcgaccgtgttc
gccccgccgctgagcaatcccgacgagaacacggacacaccggcggacgccaagacggcc
ctgatgtcgggtggcagccagttgccgcggacgacggtggcgccgcaggtcggcgcgccc
ggcgcgcccggtgctccgggcacgcctccgccgggggcgcaggctcccggtgccgtgccg
ccgcctccgccgcctccgccgtcgacgtatggctatccgcaggccggtgccgccgccggg
ccgggcactccgcctccgcccgcgccgcagccgcccgccgctccgggacggccgcttccg
ccggacgccggggacatcgccgacgccgccacgagcaaggcgggcccgccgccgcgccgt
tcgaccacgccgcctccgccgagcgcacccggcgctccgggcgcccggccgggcggcaca
cccccgcctccgcaggcgccgggcgcgggcggctacgtaccgacgcagctggtgtcgtcg
ctcggtcccgagggaccggggggcgccgcaggtcctggtgctccgcaggctccgggtgct
ccgcaggctcagggcggtgcgccgaacccgccgggcgcccccaacccgccgggcgccccg
aacccgcccggtgttccgaacccgcccggtccgccgaacacccccggcggtacgcctccg
ggcggtgtccaccatgccgccacgatgctcgccgacccgggcaggccgggccaggccggc
ggtcctccgcagcctccggccccaccgggtgcccctggggcgcccggtgctccccagcct
cctggtgcgcccggagctcccggcgcgcccgctgctcccggtgtgccgggtggttcgacc
ggtggccgcggtgctgttcatcacgcggagaccgtgctggccgcgccccctgtgggcggg
cccggcgcgcccccgccaccgcaggccccgggtgtccccggcgcgccgcaggctcccggt
gtgcccggtgtgcccggtgtgcccggtgtgcccggtgtgcccggtgttcccggtgcgccg
cagccgcccggtgcgcccgggatgccgccgcatgtcgcgccgcccgtgccgcccggtgcg
atgcctccgccggggcaggcggggcccggtccgcagccgtcgtacggctatccgcagccg
caggggcagccgacggtgggccccggctaccaggccgtgctgcgctatcgcgcgcaggac
gggtccgagcagcagttgatcaggcggtcggcgccgggcaccccgcacccggagtggcag
atcttccatgagctgcgcgccatgaacgtgccgccggaccaggtgttggagctgcacacg
gagctggaatcgtgcgcgctgccgggtgcgtactgtgcgcggatgatccgtgagcagtgg
ccgcaggcgcggctggcgtcgatcgccccgtacggcacggatcatgcgagccggcagcag
ggcatgcagcaactgatcgcgcaccagggcgagttgcaccaggtcgcggacggtccggcg
cgtccggcgccggtgcgtgcgtcgctgccgccggtgcaggcggcgccgccgatcccgccg
gagagcatcgcgcaggagctggcgggtgccttcggaccgggcgtcttccggttcgagcag
gtggcggtgtcccggcagggtgtgccgccggtcgtggcgcaggggctggtcatgggcggg
ctgccgatggacatgggcccgttcttctgggcgcaggcccagccgggccggcccgtgccg
acgctcgccgaactggcgcaggagcgcggtgtgcagccggcttccgacgcgggctcgtac
ctggtcatgggcagcgacttcggcaaggcgatctgtgtgcagtacggcacggcgaacatc
gtggccgtgccggtggagtcgggcccgggcggggcgccggtgccgccgcagttcgtgaac
acggggctgcccgagttccagcggtgcatggcgctgctgggccggatgtggcgtctgagg
ttcgggctgaaccaggagcaggcgggccgctggaccgtcgacttccaggcgcagctggcc
tccctcgacccggcggcgctcggctcgccggagagctggtggtcggtgctgctggagcag
atgtgggacgggctgctgtga
DBGET
integrated database retrieval system
