Streptococcus salivarius CCHSS3: SALIVB_0259
Help
Entry
SALIVB_0259 CDS
T01580
Name
(GenBank) Snf2 family protein
Organism
ssr
Streptococcus salivarius CCHSS3
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SNF2_assoc
SNF2-rel_dom
Helicase_C
ResIII
DEAD
SWIM
AAA_22
HDA2-3
Terminase_6N
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CCB92574
LinkDB
All DBs
Position
241342..244437
Genome browser
AA seq
1031 aa
AA seq
DB search
MAKLMPGRVRNEGIELFEKDLITIHQVSETQLDTTVDQHHLIYALNDSEITCDCDYFAQK
GYCPHLAAVEYYLKNDKEGQRLLAELEEEQESSQGQERGHSFGGLFLEGLSLNEDDTVRY
SLTVEGEESTFGSEIWWSIRLRRLPDERSYVIRDIPAFLKLVEAEGYYQIGKNYYEPLSL
IQFDQASQEFLDFLGRMIPDEAKTNLDFILPNNARHLCLPYGFFEEGLRRMQDLDGFRFE
WEGTEYRQLLVEDLTADAHLFSFDICVEPKMIELTVAEKNSQAFFNNRILFYQGVFYRLN
RKQQKLLVGLRSLPIGSDLNKHVSFNLDEQAILAASLFDFRTMGPVKAPKAFNIKDFTPR
FRFDLKSDSEIILTLAFDFDGFLVHDRQELSHLGFTSNYRHEQAVFRLMSKHGFTPDFQS
SKRLSSSQELYDFFTNTLSDFENAGTVLIGQALRDLRVEQSPQVQVERQGNLLDISFDFS
SLDDEDVDHALAALMESSPYFINRSGQLIVFDEATHRISESLKTLRARYSGKGHLELNQL
TAYQLMDALSESDSVRFSKDFQLLTQHLSKPETFDLPTYKVEAGLRPYQEKGVQWLSMLH
HYGFGGILADDMGLGKTLQTIAYLSAHLEEGQRVLVLSPSSLIYNWQDEFKKFAPQLDVA
VSYGLKPKRDDIIAEDHQIIITSYASFRQDFDAYKAGKYDYLILDEAQVMKNTQTKIAQY
LRDFSVPHCLALSGTPIENHLLEIWSIFQIILPGLLPAKKTFLKLTPKEVARYISPFILR
RKKEEVLPDLPDLIEITHQSELSDAQKAIYLAQLQQMQQGLISASDQEINRRKVEILSGI
TRLRQICDTPALFMDYAGDSGKLDSLRELLSQIKESDHRVLIFSQFRGMLDITEGLLQEL
GISSYKLTGSTPSDSRQEMTRAFNQGSRDAFLISLKAGGVGLNLTGADTVILIDLWWNPA
VEMQAISRAHRIGQEQNVEVYRLITRGTIEEKILELQEGKKNLVTTVLDGNESRASMTVE
DIKEILGIAIS
NT seq
3096 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcaaaattgatgccgggtagagtccgtaatgagggtattgaactttttgaaaaggat
ctcattaccattcatcaggtctcagaaactcagttggatacaacagttgaccaacatcat
ttaatttatgcactcaatgattctgaaatcacgtgtgactgtgattatttcgctcaaaaa
ggctattgtccccatttggcagcggttgagtattatctaaaaaatgataaagaaggccag
cgtctcttggcagaactggaagaggaacaagagtcctctcaaggccaagagcgaggtcac
tcttttggtggtttatttttagaaggcctttccctgaatgaagatgataccgttagatat
agcttgacggtagagggagaggaatctacttttggttcagagatttggtggagtatacgt
ttacgtcgcttaccagatgaacgttcttatgttattcgagatattcctgcctttctcaaa
cttgtagaggctgagggttattatcagataggtaagaactactatgaacccctatcactt
attcaatttgaccaggcttcacaagaatttttagacttcctaggacggatgattccagat
gaagccaagactaatttagattttattttaccgaataatgcacgtcacctttgtctccct
tacggtttttttgaggaaggtttgagacggatgcaagatttggatggctttaggtttgaa
tgggaaggaaccgaatatcgccaacttttggtcgaggatttgactgctgatgctcatctc
ttctcgtttgatatttgtgtcgagcccaagatgattgaattgactgtcgctgagaagaat
agtcaggccttttttaataatcgtattctcttttatcaaggtgttttttatcgtctgaat
cgaaaacaacaaaaacttttggttggcttacgctctcttccaatcggaagtgatttgaat
aagcacgtcagctttaatctcgatgaacaagccatcttggctgctagtctttttgatttt
aggactatggggccggttaaggcaccaaaagcttttaatatcaaggatttcacaccgaga
tttcgctttgatctgaaaagtgatagtgagattattcttacattagcatttgattttgat
ggtttcttggtacatgatcgccaagagttaagtcatttaggatttactagtaactatcgt
catgagcaggctgtttttcgtttgatgtctaagcatggattcacccctgattttcagtca
tctaaacgattaagtagcagtcaagagctctatgatttctttacaaatactctatcagat
tttgaaaatgcaggaacggttctgattggacaggcgttacgtgacttacgggttgaacag
agtccacaggttcaggtagagcgtcagggaaatttattagatatttcctttgatttttca
agtcttgacgacgaagatgtggatcatgctttagcagccttgatggaaagctcgccctat
tttatcaatcgtagtggtcagttgattgtttttgacgaagcgacgcatcgtattagtgag
agtctcaaaactttgagagctcgttattcaggaaaaggtcacctagaactcaatcaatta
actgcctatcaattgatggatgctctttcagaaagtgattctgttcgtttttcaaaagat
ttccaactcttaacgcaacatttgagtaagccagagacctttgatttgccaacctataag
gtagaagctggccttcgtccctaccaggaaaaaggtgttcagtggctatcgatgttgcat
cactatggttttggcggtatcttggccgacgatatggggttggggaaaaccttgcaaact
attgcctacctctctgcacatttagaagaaggacaacgagttttggttttgtcaccatca
agcctgatttacaattggcaggatgagtttaaaaagtttgcccctcagttagatgtagcg
gtttcttatggactcaagccaaaacgtgatgacatcattgccgaagaccaccagattatc
attacaagctatgcctccttccgtcaggattttgatgcttacaaggctggtaaatatgac
tatctcattctcgatgaggctcaggtcatgaagaatacacagacaaagattgcccaatat
ctacgtgatttttctgttccacattgcttagcactatctggaacgcctattgaaaatcat
ttgttggagatttggtctatttttcagattattctaccagggcttttaccagctaagaaa
acattccttaagttaacacctaaggaagtggctaggtatatttctccctttattctaaga
cgtaaaaaagaagaggtccttcctgatttaccagatttgattgaaatcactcaccaaagt
gaattgtcagatgctcaaaaggctatctatttagcacaattacaacagatgcaacaaggc
ttaatttcagcaagtgatcaggaaatcaaccgtcgtaaggtggaaatcttgtcaggaatt
acccgcttacgacaaatctgtgataccccagctctctttatggactatgcgggagatagc
ggaaaattagacagccttagagagttgcttagccaaattaaggaatcagaccatcgtgtc
cttatcttttcacaatttcgtgggatgttagatattacagagggtctcttacaagaatta
ggaatttcctcatacaagctaacagggtcaacgccatctgatagtcgtcaggagatgacc
agagccttcaatcaaggaagtcgagatgcctttttgatttctctgaaagcaggaggagtg
ggattgaatctaactggtgctgatacggttattctgattgacctttggtggaatccagcg
gtagaaatgcaggctattagtcgtgctcaccgtataggtcaggaacaaaatgtcgaagtt
taccgtttgattacaagagggactattgaagagaaaattcttgagcttcaagaaggcaag
aaaaacctggtaacaaccgtcttggatggcaatgaaagccgtgccagcatgaccgttgag
gatattaaagaaattcttggtattgcaatatcttaa
DBGET
integrated database retrieval system
