Solanum stenotomum: 125845448
Help
Entry
125845448 CDS
T08385
Name
(RefSeq) protein DETOXIFICATION 54
KO
K03327
MATE family, multidrug and toxin extrusion protein
Organism
sstn
Solanum stenotomum
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
sstn00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
sstn02000
]
125845448
Transporters [BR:
sstn02000
]
Solute carrier family (SLC)
SLC47: Multidrug and Toxin Extrusion (MATE) family
125845448
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
MatE
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
125845448
NCBI-ProteinID:
XP_049380915
LinkDB
All DBs
Position
11:complement(45897167..45901069)
Genome browser
AA seq
499 aa
AA seq
DB search
MAEKDPDFFSHKLPTAPQVVEELKELWGMALPITAMNCLVYVRAVVSVLFLGRLGSLELA
GGALSIGFTNITGYSVLVGLASGLEPVCSQAYGSKNWDLLSQSLQRMICILLLAIIPISL
LWINLEGIMLFMRQDKEITAMAATYCIYSLPDLATNTLLQPLRVYLRSQGVTKPQMWCTF
VAVLFHVPLNYFLVVVMGLGVPGVAMASVLTNLHMMVLMMGYVYVYGRWEWRWTDGIGGI
CGGLGPLLKLAVPSCIGICLEWWWYEIVTVLAGYLPNPRLAVAATGIMIQTTSLMYTVPM
ALAGCVSARVGNELGSGKPYKAKLAAVVALACAFVIGFLNVIWTVIFRNKWGGLFTKDEM
LQALVASVLPIIGLCELGNCPQTTGCGILRGTAQPVIGARINLGSFYFVGTPVALCLAFW
LKVGFSGLWYGLLSAQAACAISILYTVHCCTDWEGEALKAKRLTNLEMMGHRDDTSDDDD
EQNVLLVNEMIKDKFDDVP
NT seq
1500 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcggagaaagaccctgattttttctcccacaaactgcctactgctcctcaggtggtg
gaggaattgaaggagctatggggaatggctttgccaataacagcaatgaactgcttagtc
tatgttagagcagtggtttctgttctattcttgggaaggcttggaagtctagaacttgct
ggtggagcactttccattgggttcacaaacataactggttactctgttcttgttggtctt
gcttcaggtcttgagcctgtttgtagccaagcttatggaagcaagaactgggacttgctt
tcacagtctctacaacgtatgatttgcatacttttgttggctatcattccaataagtctt
ttgtggattaatcttgagggaatcatgcttttcatgcgtcaagacaaggaaataacagca
atggctgcaacttactgtatctactcactccctgatcttgcaacaaacactttgttacag
cctctgagggtgtatctgaggtcacagggggtgactaagcctcagatgtggtgtactttt
gtggcagtgctctttcatgtgcccttgaactattttttggttgtggtgatggggctagga
gttccaggagttgctatggcttcagtgctgactaatctgcatatgatggtgctgatgatg
gggtatgtctatgtttatgggaggtgggagtggagatggacggatgggattggagggatt
tgtggtggattggggccactgctgaagttggcagttcctagttgtatagggatctgttta
gaatggtggtggtatgagattgtaactgttcttgctggatatttgcctaatccaaggctt
gctgtggctgctaccgggattatgatacagaccactagccttatgtacactgttcccatg
gccttggctggctgtgtatctgctagggtcgggaatgagttaggatctgggaaaccatac
aaagcgaagttagctgcagtagttgcattagcttgtgcgtttgtcattggattcctaaac
gttatatggacggtgatcttcaggaacaaatggggaggcctatttacaaaagatgagatg
cttcaagcacttgtggcatcagttttaccaataataggtttgtgtgagctcggtaactgt
cctcagaccaccggttgtggaatactccgtggaacagctcagccggttataggtgcccgg
atcaaccttggctcgttttacttcgttggcactccggtagcattatgcttagccttctgg
ctaaaagttggttttagtggtctatggtatggtctgttatcagctcaagcagcctgtgct
atctcaattctatatactgtccattgctgcacagattgggaaggcgaggcgttgaaagcg
aagcgactaaccaacttggagatgatgggacatagagatgacactagtgatgatgatgat
gaacaaaatgtccttttggttaatgagatgatcaaggacaagtttgatgatgttccataa
DBGET
integrated database retrieval system
