Solanum stenotomum: 125846775 Help Entry 125846775         CDS       T08385                                  Name (RefSeq) phytochrome E isoform X1   KO K12123   phytochrome E Organism sstn  Solanum stenotomum Brite KEGG Orthology (KO) [BR:sstn00001]  09190 Not Included in Pathway or Brite   09193 Unclassified: signaling and cellular processes    99995 Signaling proteins     125846775 BRITE hierarchy SSDB OrthologParalogGene clusterGFIT Motif Pfam:  PHY PAS PAS_2 GAF PAS_4 HisKA HATPase_c PAS_9 PAS_3 Motif Other DBs NCBI-GeneID:  125846775 NCBI-ProteinID:  XP_049382329 LinkDB All DBs Position 12:complement(27088101..27093419) Genome browser AA seq 1136 aa AA seqDB search MESQSSKNRRGGRTSMNQNNQNNNKDSGFSTSSAASNMKNNASKAALAQYNADAKLMAEF EQSSVSGKSFDYSKSVPYPPQETNEEEITSYLSRIQRGGLVQPFGCMVAIEEPTFKIIGY SENCFDMLGFKPTKMKLGLIGVDARTLFTPSSGDSLAKVMASREISLLNPIWVHSRTTHK PFYAILHRIDVGIVIDLEPANSSDPALLLAGAVQSQKLAVRSISRLQSLPGGDIGVLCDT AVEDVQKLTGYDRVMVYKFHDDNHGEIVSEIRRSDLEPYLGLHYPATDIPQAARFLFKQN RVRMICDCNAQPVKVVQSEELKQPICLVNSTLRSPHECHSKYMANMGSISSLVMAVLINS GDSMKLWGLIVCHHTSPRYVPFPLRYACEFFTQAFGLQLNMELQLASQLAEKKTLQMQTL LCDMLLRDVPFGVVTQSPSIMDLVKCDGAALYSGGKCWLLGVTPTEAQVKDIAQWLLVAH KDSTGLSTDCLADAGYPGAALLGDAVCGMATARITSKDFLFWFRSHTAKEVKWGGAKHHP DDKDDGGKMHPRSSFNAFLEVVKSRSLPWEIPEINAIHSLQIIMRESIQENENSSLKTLT TSQQNDADGPSMDELSSVAMEMVRLIETATAPIFGVDPSGLINGWNEKIADLTGLHASEA VGMSLINDITHEDSRGTVEKVLHRALLGEEEKNVEIKLRRFGKDPPGLVIYLVTNTCTSR DHKNGVVGVCFVAQDVTPEKSVMDKFIQLRGDYEAIVQSLSPLIPPIFASDENACCSEWN AAMERLTGWTKYEVMGRTLPGEVFGGLCRLTGQDALTKFMILFYQAISGHETKKLPFGFF NRTGEFVEVFLTANKRTDEHGNICGCFCFLQPTTVDPEASDERQDYKDSLSKFKEYAYVL QQMKNPLNGIQFTHKLLEATGVSDNQKQLLETSEACEKQILSVIDNMDFGGIEDGSKVEL NMEEFVLGNVVDAIVSQVMIFLKEKNLQLLHDIPDQIKTLPLYGDQIKLQRVLSDFLLSV VHHAPSPDGWVEIKVLPGLKLIQDGNELIHLQFRMTHPGQGLPAALIDDMSGERNRWTTQ EGIALNVSQKLLNVMNGRVRYVREEDKCYFLIDVELQTSKPTQHGPKLEVTQEMKI NT seq 3411 nt NT seq  +upstreamnt  +downstreamnt atggagtcacagagtagtaaaaacagaagaggaggaagaacatccatgaaccagaataac caaaacaacaacaaagattccggcttttctacttcttctgctgccagtaacatgaagaat aacgccagtaaggctgccctggctcagtataatgctgatgcaaagttaatggctgagttt gagcagtctagtgtctctggtaagtcttttgattattcaaaatcagttccttatccacca caggaaactaatgaagaagaaatcacttcttatctttcaagaattcagaggggtgggctt gttcaaccatttggttgtatggttgctattgaggaacccactttcaagattataggttac agtgagaattgctttgatatgttggggtttaagcctacaaagatgaaattaggtctgatt ggtgttgatgctagaaccctttttaccccttcttcaggggattcattggctaaagttatg gcttctagggaaatttctttgttgaaccctatatgggttcattctaggactacccataag cccttttatgctatacttcacaggattgatgtgggcattgtgattgatttggaacctgct aattctagtgatcctgcattgctgcttgctggggcagtgcagtcacaaaaactggcggta cggtcaatatctaggttgcagtcactccctggtggagatataggggttctatgtgataca gctgtggaagatgtgcagaagctgactggatatgatagggtaatggtctataagttccat gatgataatcatggtgaaattgtgtctgagattaggagatcagacttggaaccttatttg ggtttgcattatcctgcaacagatatcccacaagctgctcgcttcttgtttaaacagaac agagttaggatgatatgtgattgtaatgcgcagcctgttaaggttgttcagagtgaagaa ctaaagcagcctatctgcttggttaattcgactcttagatcacctcatgaatgccatagc aagtatatggccaacatgggatctatatcgtcattggtgatggcagttcttatcaatagc ggtgattcaatgaagctttggggtttgattgtctgtcatcacacttctcctcggtatgtg cctttcccacttcgatatgcatgcgaattcttcacacaggcatttggcttgcagcttaat atggagcttcaattggcatcacagttggcagagaagaaaactctccaaatgcagacctta ctatgtgacatgcttcttcgagatgttccatttggcgttgtaacacaatcccctagtatt atggaccttgtgaagtgtgatggagctgcactttattctggtggaaaatgttggttgctt ggggtgacaccaactgaagcacaagttaaagatattgcacagtggttactagttgctcat aaggactctacaggtttaagtactgactgtcttgcagatgctggttatcctggtgcggct ttactgggagatgctgtttgtggcatggctactgcgagaattacttccaaggattttcta ttctggttcaggtctcacacagctaaggaagtcaagtggggaggtgctaagcatcatcca gatgataaagatgatggaggaaaaatgcacccacgatcttcatttaatgcctttcttgaa gtggttaaaagcagaagtttgccatgggagattccggagattaatgccattcattctcta caaatcataatgagagaatcaatccaagagaatgaaaacagctctctaaaaactttgact acttctcaacagaatgatgctgatgggccaagcatggatgagcttagttctgtggcaatg gaaatggttagattgattgagacagccactgctccaatttttggagttgatccatctggc ttaataaatggatggaatgagaagattgctgacttaacagggttgcatgctagtgaagct gttggaatgtctctcattaatgatattactcatgaagattcacgtggaactgttgaaaaa gttctacatagagctctgttaggtgaggaggaaaaaaatgtggaaataaaattgcgaagg tttgggaaagatccaccaggattagttatataccttgtgaccaatacttgcacaagccgg gaccacaaaaatggtgttgttggtgtgtgctttgtggctcaagatgtcactcctgagaaa tctgtcatggataaattcattcagttgcgaggagattatgaggctattgtacaaagtctt agtccattgattccaccaatatttgcttctgatgaaaatgcttgttgttcggagtggaat gcagcaatggaaagattgactggttggacaaaatatgaggtcatggggaggactcttccc ggtgaagtttttggtggtctttgtcgtcttacgggacaagatgcccttacaaaatttatg attcttttctaccaagcaattagtggtcatgaaaccaaaaagcttccatttggctttttt aataggacaggagagtttgtggaagtgttcctaacagcaaacaagagaactgatgagcat gggaatatatgtgggtgtttctgcttcctgcagcctacgacggttgacccagaggcgtca gatgagagacaagactataaagattccctttcgaaatttaaagaatatgcttacgtacta cagcagatgaaaaatccactgaatggaatccagtttacccataaactccttgaagcaacc ggtgtttcagataatcagaaacagcttctggagacaagtgaagcatgtgagaaacagata ctgtctgttattgacaatatggattttggaggtatagaggacggcagcaaagtggagcta aacatggaggaatttgttctaggaaatgttgtggatgctattgtgagtcaagtaatgatt ttcttgaaagaaaagaacttacagctgctgcatgatatccctgaccagatcaaaactctt cctctatatggtgatcaaattaagcttcagcgtgttctgtcagatttcttgcttagtgta gtgcaccatgcaccttctccggatggttgggtggaaatcaaggtgttacctggtttgaaa cttatacaagatggaaatgaattaatccacctccagttcagaatgactcaccctggccaa ggactacctgctgctctaattgatgacatgtctggagaaagaaatagatggacaacacaa gaaggaatcgcgttaaatgtttcccagaaacttctcaatgtaatgaatggacgtgtccgt tatgtcagagaggaagacaaatgttatttcctaatcgacgtggaactccaaacatcgaaa cctacacaacatggtccgaaattggaagtaactcaagaaatgaaaatctag

DBGET integrated database retrieval system