Solanum stenotomum: 125851285
Help
Entry
125851285 CDS
T08385
Name
(RefSeq) heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 1-like
KO
K14411
RNA-binding protein Musashi
Organism
sstn
Solanum stenotomum
Pathway
sstn03015
mRNA surveillance pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
sstn00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
03015 mRNA surveillance pathway
125851285
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
sstn03019
]
125851285
Messenger RNA biogenesis [BR:
sstn03019
]
Eukaryotic type
mRNA surveillance and transport factors
Transport factors
Other transport factors
125851285
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RRM_1
RRM_7
RRM_PARP14_3
RRM_PARP14_1
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
125851285
NCBI-ProteinID:
XP_049387028
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
475 aa
AA seq
DB search
MDSDQGKLFIGGISWETTEEKLKEYFQGYGDVLQTVVMRDKISGKPRGFGFVVFADPNVL
DRVLQDEHVIDGRTVDAKRALSREEQQGSKSGNTNSARNFGGGGNTRTKKIFVGGLPPTL
TEEGFRQYFESFGNVTDVVIMYDQQTNRPRGFGFISFDSEDAVDRVLQKSFHDLNGKQVE
VKKALPKDANPGAGGRSMGGGGGSGMGGGSYQGYGGSGNNPSSYDSRMDSNRYMQTQNAG
AGYPYGSSGYGTPGYGYGPSNNGMGYGGYGSYGGANPGYGGANPGYGAAAVAAAYGNPNA
ASAGYGSGPAGGPRSTWGSQGPSGYGNMGYGNAPWGAANAGGGGGGPASGGSGQSPTGTA
GYGNQGYGYGGYAGNEGAYGNQSGYGAVGRASGAPSGNSPVGGGAAGDMQSGAGGYMNSG
YADASGNSSYGNSAWRSDNSQSSGNYGAAPNGAHGGQVGYGGGYGGAPSRQAQQQ
NT seq
1428 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggattcagatcaaggaaagctttttattggtgggatttcatgggaaacaactgaggag
aagcttaaggagtattttcaaggatatggagatgttttgcagacagttgttatgagggat
aagatttctgggaagccaagaggatttgggtttgttgtttttgcagatcctaatgttctt
gatagggttcttcaagatgaacatgttattgatggccgtacggttgatgctaagagggcc
ttatcgagagaggagcagcagggctcaaaatctggaaacacaaatagtgccagaaatttt
ggaggtggtggaaataccaggaccaagaaaatttttgttgggggattgcctcccactttg
accgaggaaggattcagacaatattttgaaagttttggtaatgtcactgatgtagtaatt
atgtatgaccagcagaccaaccgacctcgtgggtttggtttcatctcatttgattccgaa
gatgcagtagatagagttttacagaagtcctttcatgatctgaatggtaaacaggtagaa
gtaaagaaagctcttcctaaagatgctaatcccggtgctggtggccgttccatgggcggc
ggaggtggtagtggtatgggtggtggaagttatcaggggtatggtggatcaggtaacaat
cccagttcttatgacagtagaatggattccaacaggtacatgcaaactcaaaatgctgga
gctggctatccttatggttcatctgggtatggtaccccaggatacggctatgggccatcc
aacaatggtatgggctatggtggttatggaagttatggcggagcaaatccgggctatggg
ggtgccaatcctggctatggtgctgctgcagttgctgcagcctatggaaatccaaatgca
gccagtgctggttatggaagtggtccagcgggtggaccaagaagcacatggggctctcag
ggtccttctgggtatgggaatatgggctatggtaatgccccttggggtgctgcaaatgct
ggtggtggtggtggtggacctgctagtggaggatctggtcaatctccaactggaaccgca
ggatatgggaatcaaggttatggttatgggggttatgctggtaatgagggtgcttatgga
aatcaatctggttatggtgctgttggacgtgctagtggtgctcctagtggtaactcacct
gttggaggtggtgctgcaggagacatgcaatcaggtgctgggggttacatgaacagtggc
tatgctgatgcaagtggaaactctagctatgggaattcagcatggagatctgataattca
caaagttctggtaattatggtgctgcaccaaatggagctcatggtggccaagttggatat
ggtggtggatatggaggtgcccccagtcggcaagctcagcagcagtga
DBGET
integrated database retrieval system
