Solanum stenotomum: 125852198
Help
Entry
125852198 CDS
T08385
Name
(RefSeq) serine/threonine-protein kinase-like protein CCR1
Organism
sstn
Solanum stenotomum
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PK_Tyr_Ser-Thr
Pkinase
RCC1_2
ABC1
TNFR_c6
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
125852198
NCBI-ProteinID:
XP_049387879
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
765 aa
AA seq
DB search
MNTLFIKITFFHLLCFIFLKSASGFGSMGPISAAFGKNGFFCAIDASGKQDVICWGNKTN
NPSLPDVLNYPTDVPSMAALSGGDGFLCGILSNTSQAFCFDSMGSRSDLVPNVYKPNAYS
HIAAGRNHVCAIRGSYYSESDWGSVDCWDIIRKSNGTFVSRESSLFYNQYTSSYVFKKIV
SGDGFSCGGVKDGGVLCWGPNSSGIGISGLSESIHALTAGIDSVCGVLVESSEVKCWGSN
VSFGIPPVGVPFVSLAAGVEHFCGIRQDNHGIMCWGNYNSSLIPKGSGFLAIASSDFITC
GIREGDLVLDCWYTNISSQVDYDPPLQLCSPGLCTPGSCGEGKFSFNASLINEADLINLC
VRKDLKICSPCGVNCSEGFFPSSSCTENADRVCTTCSLCQNTSCSDVCKLQISAELKQQH
QHQMRQLIIIVGSSAFGFLFCLAGLCLLIRMISSKSKEGGKNQFASCIRKPEKETDANTD
LHPPVSVAPCPGEAQVFRLSELKDATNGFKEFNELGRGSYGFVYKAVLPDGRQVAVKRAN
AATIIHTNSREFEMELEILCSVRHSNIVNLLGYCAEMGERILVYELMPHGTLNDHLHGGL
SPVSWNLRLKIAMQAAKGIEYLHKEVSPPIVHRDVKSSNILLDADWGARIADFGLLTPNE
KDLNGDVHMDVYSFGIVLLEILSGRKAYDRDCTPPSIVDWALPLIRQGKAAVIIDRYVAL
PRNVEPLLKLAEIAEQALRENPAERPDMSQLALLLEQLVKDVMIS
NT seq
2298 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaacacccttttcatcaagattacatttttccatcttctttgcttcatcttccttaaa
tctgcatctggttttggttctatgggacccatttcagctgcttttggtaaaaatggtttc
ttttgtgctattgatgcgagtggcaaacaagatgttatttgttggggtaataaaactaat
aatccttcacttcctgatgtactaaactaccccactgatgttccctccatggctgcttta
tctggtggtgatggttttctttgtggcattttatcaaacacttcgcaggcattttgtttt
gactcaatgggatcaaggtctgatcttgttcctaatgtttataaacctaatgcttattct
catattgctgctggtaggaatcatgtgtgtgctattaggggatcttattattctgagagt
gattggggtagtgttgattgttgggatattattcgaaaatccaatggtacttttgtatcg
agggagagttcgttgttttataatcagtatactagttcatatgtttttaagaagatagtt
tctggagatgggtttagttgtgggggtgttaaggatggaggggttctttgttggggtcca
aattctagtggcattggtatatcgggtttatcggagagtattcatgctttaactgcaggg
attgactctgtttgtggggttttagtagagtcaagtgaggtcaaatgttgggggtctaat
gtctcatttggtatccctccggttggggtaccattcgtgtcgttggcagctggtgtagag
catttttgtgggattagacaagataatcatgggattatgtgttggggaaactataattca
tctctgattcctaaaggatcaggctttcttgctattgcttcatctgattttataacttgt
ggtattagggaaggcgatttggttcttgattgctggtatacgaatatttcctcacaagta
gattatgatccaccactgcagctgtgtagtccaggattgtgtactcctggttcttgcggg
gaagggaaattttcgttcaatgcgagccttataaatgaggcagatttgataaatttgtgt
gttaggaaagatcttaagatttgttcaccttgtggggtgaactgttctgaaggattcttc
ccctctagttcttgtactgaaaatgctgacagggtttgtacaacttgctctctctgccag
aatacctcttgttctgatgtttgtaagctccaaatatcggcagagttgaagcaacagcat
cagcatcaaatgcgtcaactgatcatcatagtcgggtcttctgcttttggtttcttgttc
tgcttagctggattatgtttgttaatccgcatgatatccagcaaaagtaaagaaggagga
aagaaccaattcgcctcttgtattcgcaagcctgagaaggaaactgatgctaatactgac
cttcatcctcctgtgtccgtggctccgtgtccaggggaagctcaggttttccggctttca
gagctgaaagacgccactaatgggttcaaggagttcaacgagcttggcaggggaagttac
ggatttgtttataaagctgttctgccggatgggaggcaagtagcagtaaagagggccaat
gctgctacgataatacacaccaacagccgggagtttgaaatggagctagagatcctctgc
agtgttcgtcacagcaatatagttaatttattaggttattgtgcagaaatgggggaaagg
attcttgtttacgaactcatgcctcatggaacacttaatgaccacctccatgggggtctt
tctccagtgagctggaatcttaggctgaagatcgcaatgcaggctgcaaaggggatcgag
taccttcacaaggaggtttctcctcctatcgtgcaccgtgatgtgaagagttcaaacatt
ctcttggatgctgattggggagctcggattgcagattttggactgcttacacctaatgag
aaggatcttaatggagacgtgcatatggatgtctatagctttgggatcgtgctgcttgag
attcttagtggaagaaaagcttatgacagggattgcacacctccgagtatcgttgactgg
gcactgcctctgatcagacaagggaaagcagctgttatcatagatcgttacgttgctctt
ccaagaaatgtcgaacctctgcttaaacttgctgaaattgcagagcaggcgttgcgggaa
aatcctgctgagcgccctgatatgtcacagttggcacttctgttagagcagctagtgaag
gatgtaatgatatcatag
DBGET
integrated database retrieval system