Solanum stenotomum: 125854649
Help
Entry
125854649 CDS
T08385
Name
(RefSeq) pumilio homolog 1-like
KO
K17943
pumilio RNA-binding family
Organism
sstn
Solanum stenotomum
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
NABP
PUF
PUF_NOP9
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
125854649
NCBI-ProteinID:
XP_049390192
LinkDB
All DBs
Position
2:63466143..63473989
Genome browser
AA seq
1018 aa
AA seq
DB search
MITDGYAKMMSEIGMRSMLGGSNDFSEELGMLLSERRRQQLQQQEVSDRERELSIYRSGS
APPTVEGSLNAFSGLMIGGGGGGDNGYDFGGLSEEELRSDPSYISYYYSNVNLNPRLPPP
LLSKEDWRYAQRLQGSGGGGNVGSGGNSPVLGGIGDRRKGNRGEADKGRDVESLFSMPMG
FGAMNEENGREARKEWGGDGLIGLPGLGLGSRQMSITEMIQDHMSQTTSRHPSRPASRAY
DDIVDPSESQFAHLHQNMASLDALHSREKVQGMSLHNVSSSGSQSYGSAMGTSLSRSAIP
DPQLVARAPSPRIPSAGGGRIASLEDVSSHMGEHADLAAALSGMSLSGNNMGDEGKHQKY
QIHNEIDDHQNLFRLQNGQNPMKQHPYAKKSESVQFHKSAGSSAAYMIGPSMPTLNSGES
SLSQYPTVDSPNSTFSAYALGGYGMNPSSPTMFENQLGAGNLPSVLGNIASPVGACGIDS
RVTGGGLSLGPNLMAAAAELQNLNRLGNQTLGGSLPMSQMDPLYLQYLRSPEYLAAQLAA
LNDPTVNRESLGTSYMELIELQKAYLETLVASQKSQYGIPYLGKSSGLNHGYYGNPALGL
SMSYPGSPLAGAGLPNSPFGPGSPVRYGERNMRFHSGMRNLAGGVMGAWHSEAVSNLGET
FASSLLDEFKSNKSKCFELSEIEGHVVQFSADQYGSRFIQQKLETATTEEKNMVFQEIMP
QALSLMTDVFGNYVIQKFFEHGSSPQIRELADQLNGHVLTLSLQMYGCRVIQKAIEMVDL
DQQTKMVAELDGHVMRCVRDQNGNHVIQKCIECIPQDAIQFIVSTFYDQVVTLSTHPYGC
RVIQRVLEHCHNPETQNIVMNEILQTVCMLAQDQYGNYVVQHVLEHGKPEERTSIIRKLT
GQIVQMSQQKFASNVVEKCLSFGTPEERQTLVNEMIGTTDENEPLQAMMKDQFANYVVQK
VLETCDDQQLELILNRIKVHLNALKKYTYGKHIVARVEKLVAAGERRISFLASYSAAT
NT seq
3057 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgattactgatggttatgcgaagatgatgtcggaaattggaatgcgatcaatgctagga
ggaagcaatgattttagcgaagagttagggatgttacttagtgaacgaaggaggcagcag
ctgcagcaacaagaggtgagtgatcgagagagagagctcagtatttaccgtagtggttca
gctccaccgactgttgagggatcgttgaacgctttcagtggcttgatgataggcggtggc
ggtggtggtgacaatggttatgatttcggcggactttcagaagaggagttaaggtctgat
ccatcgtacatttcgtattactactcgaatgtgaatctgaacccaaggcttccgccacct
cttttgtctaaagaagactggcggtacgcccagcgtctacagggtagcggtggaggtggt
aatgttggtagtggtggtaattcaccagtattaggggggattggtgatagaaggaaagga
aatcgtggtgaggctgataagggaagggatgttgaatcacttttttcaatgccgatggga
tttggtgcaatgaatgaagaaaatggacgtgaggcgcggaaggagtggggtggtgatggt
cttattggattgcctggattaggtttaggaagccggcagatgagcattactgagatgatt
caggaccatatgagccaaacaacatcgaggcatccatcacgtcctgcttcccgtgcatat
gatgatattgttgatccttctgagtcccaattcgctcatctccatcaaaatatggcatct
ttggatgcattacattctagggaaaaggttcaaggcatgtccctccataatgtcagctca
tctgggtctcagtcttatggttcggccatgggtacatcactgtcacgaagtgccatccct
gatcctcagcttgtagctagagctcctagccctcgtattccttctgctggaggagggagg
atagcatcactagaggatgtttcatctcatatgggtgagcatgctgatttggcagctgca
ttgtctggcatgagtctatcagggaacaatatgggagatgaagggaaacatcaaaagtat
caaattcataatgagattgacgatcatcagaacctcttccgattgcagaatggtcagaat
cctatgaagcaacatccatatgcaaaaaagtctgaatctgttcagtttcacaagtctgca
ggttcctctgctgcatacatgattgggccctctatgccaactctcaacagtggagaaagt
tctttatctcaatatccaactgtcgatagtcctaattcaacattttctgcttatgcttta
ggaggttatggtatgaacccttcatcaccaaccatgtttgaaaaccagcttggggctggt
aatttgccttccgtactgggaaatatagcttctccggtgggtgcatgtggaattgattct
cgtgtaacaggaggcggattgagtttgggtcctaatttaatggctgctgcagctgaactg
cagaaccttaatagacttggtaatcagaccttggggggatctctgccaatgtctcagatg
gatccattgtacttacagtacttgaggtcacctgagtatcttgctgctcagctagcagct
ctcaatgacccaacagtgaatagggaatctttagggacttcatacatggagttgattgag
cttcagaaagcttatctggagacgttggttgcatctcaaaaatcacaatatggtattccg
tatcttggcaaatctagtggtttaaatcatggttactatgggaacccagcacttggcctt
agtatgtcatatcctggaagccctttggcaggtgcaggtcttccaaattccccatttgga
cctggtagtcctgtaaggtatggggaaaggaacatgcgttttcattcagggatgagaaac
ttagctggtggtgtcatgggagcttggcattccgaggctgtttctaacttgggtgaaacc
tttgcttcctcgttactagacgagtttaagagcaataagagcaagtgttttgagctatca
gagattgaaggccatgttgtccagttcagtgcggatcagtatggcagtcggttcattcaa
caaaaacttgagactgctaccacagaagagaagaacatggtcttccaagaaattatgccg
caagccctttctttgatgactgacgtgtttggtaattatgtgatccagaagtttttcgag
catggaagttcacctcagataagagaactggctgaccagctcaatgggcatgtactcacc
cttagccttcagatgtatggttgccgagtaatccagaaggccatagagatggttgatctg
gatcagcagacaaaaatggtcgccgagcttgatggtcatgttatgcgctgtgttagagat
caaaatgggaatcatgtaatccagaagtgcatcgaatgcattccacaggatgctatccag
ttcattgtttccacattttatgatcaagttgtgacattgtccacccatccatatggatgt
cgggtcatacagagagtcttggaacattgccataatcctgaaacccagaacattgtgatg
aatgagatattgcaaacagtttgcatgttggcgcaagatcaatatgggaattatgttgtt
cagcatgtactggaacacggaaagcctgaggagcgtacttctataattagaaagctgacg
ggacagatagttcagatgagccagcagaaatttgcctctaatgttgtggagaagtgctta
agctttggaactcccgaagaacgtcagaccttggtaaatgagatgattggcaccactgat
gaaaatgaacctcttcaggcgatgatgaaagatcagtttgcaaactacgttgtacagaaa
gtgctggagacttgtgatgatcagcaacttgaactcattctcaaccgaatcaaggttcat
ctaaatgctctgaagaaatatacttacggaaaacatatagttgcccgtgtagagaaactg
gttgctgctggagagaggaggatcagcttcctggcgtcatattctgctgctacttag
DBGET
integrated database retrieval system