Solanum stenotomum: 125857987
Help
Entry
125857987 CDS
T08385
Name
(RefSeq) cellulose synthase-like protein D3
KO
K20924
cellulose synthase-like protein [EC:2.4.1.-]
Organism
sstn
Solanum stenotomum
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
sstn00001
]
09180 Brite Hierarchies
09181 Protein families: metabolism
01003 Glycosyltransferases [BR:
sstn01003
]
125857987
Glycosyltransferases [BR:
sstn01003
]
Polysaccharide
Structural polysaccharide
125857987
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Cellulose_synt
zf-RING_4
Glyco_trans_2_3
zf-UDP
Glyco_tranf_2_3
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
125857987
NCBI-ProteinID:
XP_049393601
LinkDB
All DBs
Position
3:15518876..15524701
Genome browser
AA seq
1138 aa
AA seq
DB search
MEMASKSFKASRSSLSTSSDLPDPQHGKPPLPPHVTFQRRTSSGRYVNYSRDDLDSELSS
SDYMNYMVHLPPTPDNQPMDSISQKVEEQYVSNSLFTGGFNSVTRAHLMDKVIESEANHP
QMAGAKGSSCAIPGCDAKVMSDERGIDIVPCECDFKICRDCYLDAVKTGDGICPGCKEQY
KVTDWEEANGNDRPLPLTGPGGMSRMERRLSIMKSTKSGLIRSHTSEFDHNRWLFETKGT
YGYGNAIWPKEGGFVNGKDDDIMEPTELMSKPWRPLTRKLKVPAAILSPYRLLIVVRFVV
LGLFLAWRVNHPNKDAVWLWGMSVVCEIWFAFSWILDQLPKLCPINRATDLSVLKEKFET
PSPGNPTGRSDLPGVDMFVSTADPEKEPPLVTANTILSILAADYPVEKLACYVSDDGGAL
LTFEAMAEAASFANIWVPFCRKHKIEPRNPESYFNLKKDPYKNKVKQDFVKDRRRAKREY
DEFKVRINSLPDSIRRRSDAYHAREEIKAMKQQRQKTDDETLENVKIPKATWMADGTHWP
GTWLNSGPEHSKGDHAGIIQVMLKPPSDDPLYGNNEDGIIDLTDVDIRLPMLVYVSREKR
PGYDHNKKAGAMNALVRASAVMSNGAFILNLDCDHYIYNSQAIREGMCFMMDRGGDRLCY
VQFPQRFEGIDPSDRYANRNTVFFDGNMRALDGLQGPMYVGTGCLFRRVALYGFDPPRSK
DHQSGCCYGRKKKHVNTSEEHRALRRGDSDDEEMNLSLAPKAFGNSAVLIDSIPVAEFQG
RPLADHPAVKNGRPPGALTIPREHLDASTVAEAISVISCWYEEKTEWGQRVGWIYGSVTE
DVVTGYRMHNRGWKSVYCVTKRDAFRGTAPINLTDRLHQVLRWATGSVEIFFSRNNALFS
SSKMKFLQKIAYLNCGIYPFTSIFLIVYCFLPALSLFSGQFIVQTLNVTFLVYLLIITVT
LCLLAVLEVKWSGIELEEWWRNEQFWLIGGTSAHLAAVLQGLLKVVAGIEISFTLTSKSA
GDEEDDDFADLYLVKWTSLMIPPITIMMVNLIAIAVGFSRTIYSVIPQWSRLLGGVFFSF
WVLAHLYPFAKGLMGRRGRTPTIVFVWSGLIAITISLLWVAINPPAGTTQIGGSFQFP
NT seq
3417 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaaatggcttcaaaatcattcaaagctagtagatcatctctgtcaacatcctcagat
ttgcctgatccacagcatggcaaacctccacttcctccacatgtgactttccaacggcgg
acttcctcaggccgatatgtgaactactcaagggatgatcttgatagtgaacttagcagc
agtgactatatgaactatatggtacatctccctccgactcctgacaatcagcccatggat
tctatttctcagaaggtcgaagagcagtatgtatccaattcactgttcacaggtggtttt
aattctgttacacgcgctcatcttatggacaaggtgattgaatcagaggcgaatcatccc
caaatggcgggtgcaaaagggtcgtcgtgtgctatccctggatgtgatgctaaagtgatg
agtgatgaaaggggcattgatattgttccatgtgaatgtgatttcaagatatgcagagac
tgttacctggatgctgtcaaaactggtgatggtatatgcccggggtgtaaggagcaatat
aaagtcactgactgggaggaagctaatggaaacgatcgtccgcttcctctcactgggcca
ggtgggatgtcaaggatggagagaaggttgtcaattatgaaatcaactaagtcgggactg
attaggagccatacttcagagtttgatcacaaccgttggttgtttgaaacaaagggaaca
tatgggtatggaaatgctatatggccgaaagaaggtggatttgtaaatggaaaagatgat
gatattatggagcctactgaactgatgagcaaaccatggaggccacttacgcgcaaatta
aaagttcctgctgctatcctaagtccttatagacttttgatcgtcgttcggtttgttgta
cttggacttttcttggcatggagagtgaatcatcccaacaaagatgcagtttggttgtgg
gggatgtctgttgtttgtgaaatatggtttgctttctcttggattcttgatcaattgccc
aagctttgcccgatcaaccgtgctactgatcttagtgtcttgaaagaaaaatttgaaaca
cctagcccaggcaatcctactgggagatctgatctccctggtgttgatatgtttgtctct
accgctgatccagagaaggaaccccctcttgtgactgctaatactatattgtccattcta
gctgcagattatcctgtagaaaagcttgcttgttatgtttctgatgatggaggtgccctt
ttgacctttgaggcaatggcagaagctgcaagttttgctaatatatgggtgccattttgt
cgtaaacataaaattgaacctagaaatccagaaagttacttcaatttaaagaaggatcct
tacaaaaacaaggtaaagcaagactttgttaaggatcgtaggcgggcaaagcgtgagtat
gatgagtttaaggttcgtatcaatagcttgccggattccattcgccgtaggtctgacgct
tatcatgcaagggaagaaattaaggccatgaagcaacagaggcagaagactgatgatgaa
actttagagaatgtaaagatcccaaaagctacgtggatggcagatggaacccattggcct
gggacatggttgaattctggaccggagcattccaagggcgatcatgctggaataatacaa
gtgatgttgaaacctccaagtgatgatccactatatggtaacaatgaagatgggattatt
gacctgactgatgttgatatccgtcttcccatgcttgtttatgtttcccgtgagaagcgt
cctggctatgatcacaacaagaaagcaggtgctatgaatgccctggttcgagcatctgcg
gttatgtccaatggtgcatttattcttaaccttgattgtgaccattacatttacaactcc
caggctatcagggaaggtatgtgttttatgatggataggggaggggatcgtctttgctat
gttcagttcccgcagaggtttgagggcattgacccatctgataggtatgccaatcgcaat
actgtctttttcgatggtaacatgagggcccttgatgggctacagggtccaatgtatgtg
ggaactggatgtctctttcgaagggtagccctttatggtttcgaccctcctcgctccaag
gatcaccagtccggttgctgctatggccgcaaaaaaaagcatgttaatacatcagaagaa
catcgggccttgcgacgaggtgattcagacgatgaagaaatgaacctctcactggctccc
aaggcttttgggaactcagcagtccttattgattcaattcctgtggcagagttccaaggt
cgtcctttggcagatcacccagctgtgaagaatggacggcctcctggtgctttgaccatt
cctcgagagcatcttgatgcatcaacagttgcagaggccatcagtgtcatctcctgctgg
tatgaggaaaagacagagtggggacaacgtgtcggatggatttatggttcagttactgaa
gatgttgtgacaggatacaggatgcacaacagaggttggaagtcagtttattgtgttacc
aaacgtgatgcattccgtgggactgcccctattaatctcactgataggcttcatcaggtc
cttcgatgggctactggttcagttgaaatcttcttctcccggaacaatgcccttttctcc
agctcaaaaatgaaattcttacagaaaattgcttacctcaattgtggaatctatcccttc
acatcaatcttcttaatcgtctactgtttccttccagcactgtccctgttctccggtcag
ttcattgtccaaacactcaatgtcacctttcttgtgtacctcctgattattacagtcacc
ctctgcctgcttgcggtgctcgaggtcaagtggtcaggcattgagttggaagagtggtgg
aggaatgagcagttctggctgatcggaggtacaagtgctcacttggctgctgtgcttcag
gggctcctaaaagttgttgctgggattgaaatttctttcaccttgacgtcaaaatcagct
ggtgatgaagaagacgatgactttgctgatctgtatctcgttaagtggacatccctcatg
attccaccaattacaatcatgatggtgaacttgatagcaatagcagttggttttagcagg
acaatatacagtgttataccacaatggagccgtttactaggaggtgtattcttcagtttt
tgggttttagcacatctctatcccttcgcaaaaggtcttatgggcagaagaggcaggaca
ccaaccattgtctttgtatggtcaggacttatcgcgatcactatatcccttctttgggtg
gcgattaatcctccagcaggcactacccaaattggaggatcattccagttcccatga
DBGET
integrated database retrieval system
