KEGG   Solanum stenotomum: 125860948
Entry
125860948         CDS       T08385                                 
Name
(RefSeq) heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 1-like
  KO
K12741  heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1/A3
Organism
sstn  Solanum stenotomum
Pathway
sstn03040  Spliceosome
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:sstn00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09121 Transcription
   03040 Spliceosome
    125860948
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03019 Messenger RNA biogenesis [BR:sstn03019]
    125860948
   03041 Spliceosome [BR:sstn03041]
    125860948
Messenger RNA biogenesis [BR:sstn03019]
 Eukaryotic type
  mRNA surveillance and transport factors
   Transport factors
    Other transport factors
     125860948
   mRNA cycle factors
    Common to processing body (P body) and stress granule
     125860948
Spliceosome [BR:sstn03041]
 Common components
  Common spliceosomal components
   hnRNP proteins
    125860948
SSDB
Motif
Pfam: RRM_1 RRM_7 RRM_PARP14_3 Nup35_RRM_2
Other DBs
NCBI-GeneID: 125860948
NCBI-ProteinID: XP_049396963
LinkDB
Position
3:complement(1429802..1433944)
AA seq 385 aa
MDYVAEQNVSEEQERNDGSAGHELKHSLDDSSAGKLFVGGIAWETREESFRKYFSRFGEI
TNCVIMMDKVSGRPRGFGFVTFADPEAANKVLEEEHIIDGRTVEVKRIVPKEDMQVKGSP
KTKKIFIGGLSLTLTEDELKEYFSSYGHVLEQQIMLDRESGRSRGFGFITFDSENAVEKV
LNNGRMHEIHGKQVEIKRAEPKRAGAENAIESRQHRGGSGSRSYNNFGGSEGGYGGGYGR
GYGGYGGYGGGIGYGGGGGGAGYGGVGAGAGYGGYGNIGGSYGGGGTGYFSGYGGYGYGF
GFSGPMYGAAGYGGTSYGAPGSYGGAAGYASGRGYTSSDDGSWYGGARSSASFNAKGYDT
GGSTGGAKAYGNGGATGGRFHPYMN
NT seq 1158 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atggattatgtagctgaacaaaatgtctcagaagagcaggaacgaaacgatggtagtgca
ggacatgaattaaagcattcactcgatgattcttctgcaggaaagcttttcgtcggaggc
attgcttgggagaccagagaagaatcttttaggaagtatttcagcaggtttggagagata
acaaattgtgtaataatgatggataaggtctctggaaggccacggggattcggctttgta
acatttgcagacccagaagctgcaaataaggttttagaggaagagcacatcatagatggt
agaacggtggaagtgaagaggatagtacctaaggaggacatgcaagttaaaggatctccg
aaaacaaagaaaatttttatcggcggtctttcattaactttaactgaagatgagttgaag
gaatatttttcttcttatggccatgttctggagcaacaaatcatgctggatcgtgagagt
ggtcgatcccgaggctttggcttcattacttttgatagtgaaaatgccgttgaaaaagtt
ttaaacaatggccgtatgcatgaaatccatggcaaacaagttgaaattaagagggctgag
ccaaaaagagctggtgctgaaaatgcaattgagagccggcagcatcgtggtggcagtggt
tcgagatcgtacaataactttggtgggtctgaaggagggtatggtggtggatacggtaga
gggtatggtggatatggaggctatggtggtggcattggttatggtggtggtggcggtggc
gctggatatggcggtgtcggcgctggcgctggctatggtggttatggaaacattggagga
agttatggcggaggtggtacaggatatttctctggatatggtggatatggttatggattt
gggtttagtggacctatgtatggcgcagctggatacggaggcactagctatggtgctcct
ggtagctatggtggtgctgctgggtatgctagcggtagaggatacacaagcagtgatgat
ggtagctggtatggtggggctagaagctctgcatctttcaatgctaaagggtatgacacc
gggggtagcactggaggtgctaaagcatatggtaatggtggtgctacaggtggaaggttt
catccttacatgaattga

DBGET integrated database retrieval system