Solanum stenotomum: 125862783
Help
Entry
125862783 CDS
T08385
Name
(RefSeq) uncharacterized protein LOC125862783
Organism
sstn
Solanum stenotomum
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Pollen_Ole_e_1
Extensin_2
MS_channel_1st_1
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
125862783
NCBI-ProteinID:
XP_049398865
LinkDB
All DBs
Position
4:complement(620787..635182)
Genome browser
AA seq
1697 aa
AA seq
DB search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NT seq
5094 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
caatggcggccctgccaagggtcgtcaatatttgccacaaatcttagtggcattggccat
attggcgttgctaatgtagtgtcggcagacccttatgtatactcttctccaccacctcca
gtgtatgagtacaaatcaccaccacctccttctccgtctccaccaccaccaccatatgtg
tacaaatctccacctcctccctcaccttctcccccacctccatatgtttataagtcacct
cctcctccttctccatcaccaccaccaccatatgtgtataagtccccaccacctccctca
ccgtctccaccaccaccctatgtgtataagtctcccccacctccttcaccatctccacct
ccaccatattactacaaatctcctccaccaccatcaccttcaccaccacctccatattac
tacaagtctccacctccaccttcaccatcacctccaccaccatactactacaaatctcca
ccaccgcctacaccatcaccacctccaccatattattataagtctccaccgccaccttct
ccttcacctcctccaccatattattacaaatctccaccacctccttcaccttctcctcca
ccaccttattactacaagtcgccacctcctccatcaccttcaccaccaccaccatactat
tacaagtctcctcctccaccttccccatcaccacccccaacgtactattacaagtcccca
ccaccaccggctaaatcacctcctcccccgtactactacagttctcctccaccaccagtg
aagtctccccctccaccatactactactcctcaccaccaccaccaaagaaatcacctcct
ccaccatatcactacagttctcctccaccaccagttaagtcacctccaactccatactac
tacaagtcaccaccaccaccaccaaagaagtcttctcccccaccatactactatacttca
ccaccaccaccaactcattactatcctccacatcatcaatttgtagtcaaacacccagag
atgtctcacgacaagaaacacctgaaaggtgctgttgttgaagtgacttgcaaggccggt
gacaaagaaattgtgagttatggtaccactaagatcaatggcaaatttagcatcacagtt
gaaggatttgaatatagcaaatatggagcaaaggcttgcaaggctaaactccacaatgct
cctaaggattcaaagtgtagcattcctacaaaccttcattggggaattaagggtgctaac
ctcaaagtgaagtcaaagaataaatatgaagttgtactttatgcaaaaccatttgcttat
ggctcaaagacaccttatgcagaatgcctaaaacccaagcctacacctgctccatactat
tataaatctcctccacctccaacaccgacttatgtttacaagtcaccaccacctccatca
ccaaaatatgtgtacaagtcaccacctcccccaaccccgacatacgtttataagtctcca
ccaccacctgcttactattacaaatctccaccaccaccaactaagtctccaccacattac
tattacaaatctccacctccaccatcaccaaaacctgcaccggtatactattataaatct
ccacctccaccatcgccaaaacctgcacctgtatactattacaaatcaccaccaccacca
tcaccaaaacctgcaccagtgtactattataagtcaccaccaccaccatcaccttctcct
ccacctccttactactacaagtctcctccaccaccatcaccaaaacccgcacctatatac
tattataaatcaccaccaccaccatcgccatcacccccaccaccttactactacaagtcc
cctcctccaccatctccatcaccacccccaccttactactacaagtctcctccaccacca
tcaccatctcccccacctccatactactataagtctcctccacctccatcgccttctccc
cctccaccatactactacaagtcaccaccaccaccatctccatctcctccaccaccctac
tactacaaatcaccaccaccaccatcaccatctcctccaccaccatacatctacaagtct
cctcctccaccatcaccttcaccacctccaccctactactacaagtcacctcctccaccg
tcaccttctccaccacctccctactactacaagtcaccaccaccaccatccccatctcct
ccaccaccctactactacaagtctcctcctccgccgtcaccttcaccaccccctccatcc
ccatctcctccaccaccctactactacaagtctcctcctccaccgtcaccttcaccaccc
ccaccttactactacaagtcgcctcctccaccgtcaccttctccaccacctccttactac
tatcactctccacctccacccgtaaagtctcctcctcctccttattactacaactcacct
cctccaccagtgaaatcaccccctccaccgggtcgtcaatatttgccacaaatcttagtg
gcattggccatattggctgttgctaatgtagtgtcagcagacccttatgtatactcttct
ccaccacctccagtgtatgagtacaaatctccacctcctccctcgccttctaccccgcct
ccatatgtttataagtcacctcctcctccttcaccatcaccacctcctccatatgtgtat
acatctccaccccctccttcaccatctccaccaccaccatatgtgtataagtccccacca
cctccctcaccgtctccaccaccaccctatgtgtataagtctccaccacctccatcacca
tcaccacctccaccatattactacaaatctcctcctcctccatcaccttcaccaccacct
ccatattactacaagtctccacctccaccttcaccatcaccacctccaccatattattat
aagtctccaccgccaccttccccttcacctcctccaccatactactacaaatctccacca
ccaccttcaccttctcctccaccaccttattactacaagtcgccacctcctccatcacct
tcaccaccaccaccatactattacaagtctcctcctccaccttccccatcaccaccccca
ccgtactattacaagtccccaccaccaccggtcaaatcacctcctcccccgtactattac
ggttctcctccaccaccagtgatgtctccccctccaccatactactactcctcaccacca
ccaccaaagaaatcacctcctccaccatatcactacacttctcctccaccacctgttaag
tcaccacctcctccatactactactcctcaccaccaccaccaaaaatatcacctcctcca
ccatatcactacagttccccaccaccaccagttaagtcacctccaactccatactactac
aagtctccaccaccaccaccaaagaagtcttctcccccaccatactactatacttcacca
ccaccaccaactcattactatcctccacatcatcaatttgtagtcaaagttgtcggaaaa
gtctattgttttagatgccataattggaagcacccagagacgtctcacggcaagaaacac
ttgaaaggtgctgttgttgaagtgacttgcaaggccggtgacaaagaaattgtgagttat
ggtaccactaagatcaatggcaaatttagcatcactattgaaggatttgaatatagcaaa
tatggagcaaaggcttgcaaggctaaactccacaatgctcctaaggattcaaagtgtagc
attcctacaaatcttcattggggaattaagggtgctaacctcaaagtgaagtcaaagaat
aaatatgaagttgtactttatgcaaaaccatttgcttatggctcaaagacaccttatgca
gaatgcctaaaacccaagcctacacctgctccatactattataaatctcctcctcctcca
acaccgacttatgtttacaagtcaccaccacctccatcaccaaaatatgtgtacaagtca
ccacctcccccaaccccgacatacgtttataagtctccaccaccaccaactaagtctcca
ccacattactattacaaatctccacctccaccatcaccaaaacctgcaccggcatactat
tataaatctccacctccaccatcgccaaaacctgcacctgtatactattacaaatcacca
ccaccaccatcaccaaaacctgcacccgtgtactattataagtcaccaccaccaccatca
ccttctcccccacctccttactactacaagtctcctccaccaccatcaccaaaacccgca
cctgtatactattataaatcaccaccaccaccatcaccatctcctcctccaccatactat
tacaagtctccaccaccaccatcgccatcacccccaccaccttactactacaagtctcct
ccaccaccatcaccatcaccatctcctcctccaccatactattacaagtctccaccacca
ccatcgccatcaccccccccaccttactactacaagtctcctccaccaccatcaccatct
cccccacctccatactactacaagtctcctccacctccatcgccttctccccctccaccg
tactactacaagtcaccaccaccaccatcgccatctcctccaccaccctactactacaaa
tcaccaccaccaccatcgccatctcctccaccaccctacatctacaagtctcctcctcca
ccatcaccttctccacctccaccctactactacaagtcacctcctccaccgtcaccttct
ccaccgcctccctactactacaagtcaccaccaccaccatccccatctcctccaccaccc
tactactacaagtctcctcctccaccgtcaccttcaccacccccaccttactactacaag
tcgcctcctccaccgtcaccttctccaccacctccttactactatcactctccacctcca
cccgtaaagtctcctcctcctccgtattactacagctcacctcctccaccagtgaaatca
ccccctccaccggcgtacatttacgcttcaccaccaccaccagtccactactaa
DBGET
integrated database retrieval system
