Solanum stenotomum: 125868042
Help
Entry
125868042 CDS
T08385
Name
(RefSeq) F-box/LRR-repeat MAX2 homolog A-like
KO
K27701
F-box protein MAX2
Organism
sstn
Solanum stenotomum
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
sstn00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
04121 Ubiquitin system [BR:
sstn04121
]
125868042
Ubiquitin system [BR:
sstn04121
]
Ubiquitin ligases (E3)
Multi subunit type E3
SCF complex
Target recognizing subunit (F-box)
125868042
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
F-box_5
F-box-like
DUF7885
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
125868042
NCBI-ProteinID:
XP_049404594
LinkDB
All DBs
Position
6:complement(57358760..57361209)
Genome browser
AA seq
724 aa
AA seq
DB search
MAALARPTIINDLPDVILSNIIAAVSDVRSRNAAALVCRKWLVLERATRTSLTLRGNIRD
LFMLPTCFRSVTHLDLSLVSPWGHPLLPPRAASSDGGDDADSVLIAHLLRHAFPIVTSLI
VYARSPHTLQFLPVQWPHLKYIKLVRWHQRPQLASGDEFNLLFQGCPQLGSLDLSTFYCW
TDDIPPALELNPLVAGNLTVFNLMNASFSEGFKTDEIRVITKCCPNLKELKIACMFDPMY
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LSLLEELELDVCNNVRDSGPALEILNTKCPKLRSLKLGQFHGVSMPIGSKLDGVALCQGL
KSLSIRNVGDLDDMGLIAIGRGCSRLAKFEIQSCKKITMRGMRTLASLLWKSLVDVRISC
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GFGDTFGSMDDDIMFNRNKRCKYDYDLNSVCMEDNGHGNGFGGRTWDRLQYLSLWIGVGD
LLTPLAAAGLEHCPNLEEIKIRVEGDCRLWSKPSERAFGLSTLLRYHKLVKMHLDCGDII
GYAHTAPSGQMDLSLWERFYLFGIGTLNLKELDYWPPQDRDVNQRSLSLPAAGLLQECIT
LRKLFIHGTAHEHFMMFLLRIPDLRDVQLREDYYPAPENDMSTEMRSDSLSRFEAALNRR
QICD
NT seq
2175 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggctgctttagctagacccaccatcattaatgaccttcctgatgtaatcctttctaac
ataatcgccgccgtctccgacgtccgcagccggaacgccgccgcactcgtctgccggaaa
tggctcgtccttgaacgagccacgagaacttcactcaccctccgtggtaacatccgtgac
cttttcatgttacctacttgcttccgatctgttacccatctcgacctctcactcgtttct
ccttggggacatcccctcctacctccacgcgccgcctctagcgacggtggcgacgatgct
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atgagtacagaaatgaggtcagactccttgagccgttttgaagcggctctaaacagacga
cagatttgtgattga
DBGET
integrated database retrieval system
