Solanum stenotomum: 125872592
Help
Entry
125872592 CDS
T08385
Name
(RefSeq) pumilio homolog 2-like
KO
K17943
pumilio RNA-binding family
Organism
sstn
Solanum stenotomum
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
NABP
PUF
PUF_NOP9
CAS_CSE1
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
125872592
NCBI-ProteinID:
XP_049409295
LinkDB
All DBs
Position
8:complement(2692625..2701865)
Genome browser
AA seq
991 aa
AA seq
DB search
MLSEFGPSPMLGNNENSFGDEFDKEIGMSLREQRRQEADDHEKELNLYRSGSAPPTIEGS
LSAVGGLFNNNGFRSEEELRSDPAYLSYYYANVNLNPRLPPPLLSKEDWRFAQRMQGGSS
AIGDRRKVNKNDNGSSSGRSLFAMPPGFNSIKAENENESDKLQGSVEWGGDGLIGLPGLG
LGSKQKSIAEIFQDDLSRVTPAPGPPSRPASRNAFDESSDNLGSAEAELSHLRHEFSTSD
PLRSVSNGQGSSAAQHVGAPASFTYAAALGASLSRSTTPDAQRIARAPSPSLTPIGGGRV
ATSEKRSVNSPNSFNGVSHTAESADLLAALSSMNLSNGSQNNSQQHAYLKRSESAQFNMS
SKSHSAKGPYIDTGAGNKSDLNSSNLHDDLHRSAVASNNSYVKGSQTSTLNGGGGVLSQY
QHMDSPSNYGLGSHSVNPVTSHLGNYNLPPLFETAAAASGMALPGMDSRMLGASHLNSGV
SEQNLGRMGNQMSGSALQASFMDPMYLQYLTAEYVAQVAALNDPSMDRNYMGNSYMDLLQ
KAYLGNALSPKSQYGVPLSSKGSGSSHHGYYANPAFGVGLSYPGSPLASPVVPNSPVGPG
SPMRHGDYNMRFPGAMRNITSGVIGSWHLDNMENSFASSLLEEFKSNKTRCFELSEITGH
VVEFSADQYGSRFIQQKLETATPEEKNMVFQEIIPQALTLMTDVFGNYVIQKFFEHGMAC
QRRELASKLFSHVLTLSLQMYGCRVIQKAIEVVDVDQKIKMVEELDGHVMRCVRDQNGNH
VVQKCIECVPEEHIQFIISTFFGQVVNLSTHPYGCRVIQRVLEHCCDAITQSKVMEEILG
SVSMLAQDQYGNYVIQHVLEHGKPHERSAIIKELAGKIVQMSQQKFASNVVEKCLAFGGA
SERQLLVDEMLGTTDENEPLQAMMKDQFANYVVQKVLETCSDQQRELILSRIKVHLNALK
KYTYGKHIVARVEKLVAAGERRIAAQSPNLA
NT seq
2976 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgctatctgaatttggtccaagtccaatgcttggaaacaatgagaattcgtttggtgat
gagtttgacaaagagataggaatgtcacttcgtgaacagaggagacaagaagctgatgat
catgaaaaggagctgaatttgtatagaagtgggtcagctccacctactattgagggttct
ttaagtgcagtaggtgggttgtttaacaataatgggttcaggtctgaagaggagcttagg
tctgatcctgcttacttatcgtactattacgcgaatgttaatcttaaccctaggttacct
ccaccactgttgtctaaggaggattggaggtttgcacagaggatgcaaggagggagttct
gcaattggggataggaggaaggtgaacaagaatgataatgggagtagtagtgggaggtca
ctctttgctatgcctccggggtttaactcgataaaagctgagaacgagaatgagtcagac
aaattgcagggttcagtagagtggggtggtgatgggctgattgggttaccaggactagga
ctaggtagtaaacagaagagcattgctgaaatatttcaggatgacttgagccgtgtgact
cctgctcctggtcccccttcacgaccagctagccgcaatgcttttgatgaaagtagtgat
aacttgggttcagcagaagctgagctgtctcacctccgtcatgagttttcaacttcagat
cctttaaggtcagtatctaatggacaaggctcatctgctgctcaacatgttggggcgcct
gcttcctttacatatgctgctgctttgggggcttccttatcaagaagcactactcctgat
gcccagcgcattgctagggctcctagcccttccctcactcctatcggtggaggaagggta
gccacttctgagaagaggagcgttaatagtccaaattcatttaatggtgtctctcacact
gccgagtctgcagatctgcttgctgctttgtctagcatgaatctttcaaatggtagtcag
aataactctcagcagcatgcatatctgaagagatctgaatctgctcagtttaatatgtcg
tctaaatctcactctgctaaaggaccatatattgacactggtgctggcaacaagtcagac
cttaacagttctaacctccatgacgatctgcacagatctgcagttgcctctaataattct
tatgtgaaaggatctcaaacgtccacactgaatggtggaggtggtgtactttctcaatat
cagcatatggatagtccttccaattatggtttaggtagtcattccgtcaatccagtgaca
agccatcttggcaactataatctgcctcctttgtttgaaactgctgctgccgcgtctggg
atggctttacctggaatggactctcgaatgctaggggcatctcatttgaactctggtgtc
tcagagcagaatctcggcagaatgggaaatcaaatgtctgggagtgctttacaggcatcc
ttcatggatcctatgtatcttcagtacttgacagctgaatatgttgcacaggttgccgca
ctgaatgatccttcgatggataggaactacatgggcaattcctatatggacttgcttcag
aaagcttatcttggtaatgcattatctccgaagtcacaatatggtgtcccactcagcagt
aaaggtagtggttcaagtcatcatggctattatgccaatcctgcatttggagtcggttta
tcatatcctggaagtcccttggcaagtcctgtcgttccaaactctccagttggtcctggt
agtccaatgaggcacggtgattataatatgaggttccctggtgcaatgagaaacataact
tcaggtgtaataggatcatggcacttggataacatggaaaacagctttgcttcctctcta
ttggaagagttcaagagtaataagaccaggtgttttgagctttcagaaattactggtcac
gttgtcgagttcagtgcggatcagtatggtagccggttcatccaacaaaaactggaaact
gccacccctgaggagaaaaacatggtttttcaggaaattattccccaagctcttactttg
atgactgatgtttttggtaattacgtaatccagaagttttttgaacatggaatggcatgt
cagaggagagaattggctagcaagctctttagccatgtattaacactgagccttcagatg
tatggttgccgcgtgattcagaaggcaatagaagtggtagatgtggaccagaagattaaa
atggttgaggagcttgatggtcatgtcatgcgttgtgtacgagatcagaatgggaatcat
gtcgtccagaagtgtattgaatgtgtaccagaagaacacattcaattcatcatctctaca
ttttttggtcaagttgtgaatctctccacccatccatatggctgtcgtgtaattcagaga
gtattggaacactgctgtgatgcaattacacaaagtaaagtgatggaagaaattctggga
tctgttagcatgttggcacaagatcaatatggtaattatgttattcagcatgtactggag
catgggaagccacacgagcgttctgctattattaaggaactagctgggaagattgtgcaa
atgagccagcagaagtttgcctctaatgttgttgagaagtgtctagcttttggtggtgcc
agcgaaaggcagctcctggtggatgagatgctcggcacgactgatgaaaatgaacctctt
caggcaatgatgaaagatcagtttgcaaattatgttgtacagaaagttttggaaacgtgc
agtgatcagcaacgtgagctgatcctttctagaataaaggttcacttgaatgctctgaag
aaatacacttatggaaaacacattgttgctcgtgttgagaaacttgttgcagctggagaa
cgaagaattgctgctcagtctccaaatcttgcttag
DBGET
integrated database retrieval system