KEGG   Solanum stenotomum: 125875192
Entry
125875192         CDS       T08385                                 
Name
(RefSeq) uncharacterized protein LOC125875192
  KO
K12741  heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1/A3
Organism
sstn  Solanum stenotomum
Pathway
sstn03040  Spliceosome
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:sstn00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09121 Transcription
   03040 Spliceosome
    125875192
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03019 Messenger RNA biogenesis [BR:sstn03019]
    125875192
   03041 Spliceosome [BR:sstn03041]
    125875192
Messenger RNA biogenesis [BR:sstn03019]
 Eukaryotic type
  mRNA surveillance and transport factors
   Transport factors
    Other transport factors
     125875192
   mRNA cycle factors
    Common to processing body (P body) and stress granule
     125875192
Spliceosome [BR:sstn03041]
 Common components
  Common spliceosomal components
   hnRNP proteins
    125875192
SSDB
Motif
Pfam: RRM_1 RRM_7 RRM_PARP14_3 Nup35_RRM_2
Other DBs
NCBI-GeneID: 125875192
NCBI-ProteinID: XP_049412250
LinkDB
Position
8:10482960..10485660
AA seq 378 aa
MDFDEERNEETDQPNEDVEMADKVGDREADELKPSNNGCSVRQLFVGRISTKTTEVFYFP
ESFREYFSKFGQVADSVLMSDKDSGRRRGIGFVIYADPEIADKVLKEDHTIDGKKVVVEK
PVTNTTRIYVGGLPLSLTEDELKEHFSPYGNVVDHCIVLDRRHGRSRRFGYVSFDKEEAV
EKVLSDGHMHELCGKQVSNKEFILPRTDCCLFYFDETKKNCRAGAAGYGGSSYGVHAYYG
RGSGYGNSGSSWSDGGNRGYGGGGKNDAYAYGNSGAANERYVPAYNGRGRGYGNSGNSWN
DGGNGGYGGGGRNDAYAYGNTGAANERYVPAYNGCGRGYGNSGNSWNYGGNGGYGGGGTN
GAYAYENTGAANRRYHPY
NT seq 1137 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atggattttgatgaggaacgaaatgaagaaactgaccaaccaaatgaagatgtggaaatg
gctgataaagtaggcgatagggaagccgatgaattaaaaccttcaaacaatggttgttca
gtaaggcaactttttgttggacgcatttctacgaagacaaccgaagttttttactttcca
gaatcatttagagagtatttcagcaagtttggacaggtagctgattctgtactaatgagt
gataaagactctggaaggcgacgaggaattggatttgttatatatgctgacccggaaatt
gcagataaagttttaaaggaagaccataccatagatggtaaaaaggtggtcgtggagaaa
ccagtaactaatacaacgagaatttatgttggtggtcttccattatccttgactgaagat
gagttgaaggaacatttttctccttatggcaatgttgtggatcattgcatcgttttggat
agaagacatggtcggagccgacgttttggctatgtgagttttgataaagaggaagcagtt
gaaaaagttttatctgatggccatatgcatgaactttgcggcaaacaagtgagtaataag
gaatttatactgcccagaactgattgttgcctcttttactttgatgaaacaaaaaaaaat
tgtagagctggtgcagctggttacggaggcagcagctacggtgtgcatgcctactatggt
cgtggtagtggttatgggaacagtggtagcagctggagtgatgggggcaacagaggatat
ggaggtggtggcaaaaatgatgcctatgcatatgggaactccggtgctgctaatgaaagg
tatgtgcctgcctacaatggtcgtggtcgtggttatgggaacagtggtaacagctggaat
gatggaggcaatggaggatatggaggtggtggcagaaatgatgcctatgcatatgggaac
accggtgctgctaatgaaaggtatgtgcctgcctacaatggttgtggtcgtggttatggg
aacagtggtaacagctggaattatggaggaaacggaggatatggaggtggtggcacaaat
ggtgcctatgcatatgagaacaccggtgctgctaatagaaggtatcatccttattga

DBGET integrated database retrieval system