Spiroplasma syrphidicola: SSYRP_v1c00040
Help
Entry
SSYRP_v1c00040 CDS
T02677
Symbol
gyrA
Name
(GenBank) DNA gyrase subunit A
KO
K02469
DNA gyrase subunit A [EC:
5.6.2.2
]
Organism
ssyr
Spiroplasma syrphidicola
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ssyr00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03032 DNA replication proteins [BR:
ssyr03032
]
SSYRP_v1c00040 (gyrA)
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
ssyr03400
]
SSYRP_v1c00040 (gyrA)
Enzymes [BR:
ssyr01000
]
5. Isomerases
5.6 Isomerases altering macromolecular conformation
5.6.2 Enzymes altering nucleic acid conformation
5.6.2.2 DNA topoisomerase (ATP-hydrolysing)
SSYRP_v1c00040 (gyrA)
DNA replication proteins [BR:
ssyr03032
]
Prokaryotic type
DNA Topoisomerases
SSYRP_v1c00040 (gyrA)
DNA repair and recombination proteins [BR:
ssyr03400
]
Prokaryotic type
DSBR (double strand breaks repair)
NHEJ (non-homologous end-joining)
SHIIR (short-homology-independent illegitimate recombination)
Facilitator
SSYRP_v1c00040 (gyrA)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DNA_topoisoIV
DNA_gyraseA_C
TBCC_N
tRNA_anti-codon
STL11_N
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
16152647
NCBI-ProteinID:
AGM25600
UniProt:
R4UHG6
LinkDB
All DBs
Position
4963..7422
Genome browser
AA seq
819 aa
AA seq
DB search
MNPEDNNYDYNGKIKDVDISDEMKTGFLDYAMSVIVSRAIPDVRDGLKPVHRRIIYAMWD
LNMTYDKQHKKSARIVGEVIGKYHPHGDTAVYEAMVRMAQDFSYRYPLIDGHGNFGSMDG
DAPAAMRYTEARMSKIAGELIKDIEKETVIFADNYDGSEQEPTFLPGYFPNLLVNGASGI
AVGMATNIPPHNLGEVIDGVIAITKNKDITTAQLTKIIRGPDFPTGALITTGTSLLKAYE
TGNGTITIRSKVSIEENNNKKKIIISEIPYQVNKAKLVEKIADLIKEKTIAGIADLRDES
NREGVRIVIELKRDVQETFILNKLYKMTPLQTNYSLNILALSKNQPKIMGIKQILNYFIE
HQINIIIKRSQYDLKKCQNRLLILEGLKIALDHIDEVIKIIKQSPTTQEANDGLVKAFKL
AVEQAKAILEMRLQRLTGLEIEKIIIEIAAIKTEILELEKIINNSDYQIEIMIKELEEIK
SKYGDQRRSQIIQEELTEIDPEELIKQESILILLTKDGYIKRVTEDTFKTQNRGGKGIIG
TANNVDDSINKIVLANSIDSLFFFSNSGKVYKLRAYQVESYSRQARGLPIINLIAIDKKE
QIRTILTINESISQDSNLFFVTKKGLIKKTKLSEFSQIRQSGKVAIELKDGDELVDVIVS
DDNCDIIIANDDGKVIRFNEKEIRPMSRQSIGVKGIINDEGETISISSRLAAEEYVLSVT
ENGFAKKTLISEYRATGRGGKGVKSMNLTDKTGKLTFVNFVKDDEEIIIATKQGNIIRLP
LSQIPTFGRTTSGVKLIKLNKDDKIEVVELLRINDLKGE
NT seq
2460 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaatccagaagataataactatgattataatgggaaaataaaagatgttgatatttct
gatgagatgaaaacaggctttttagattatgccatgtcagttattgtttcacgggcaatt
ccagatgttcgcgatgggttaaaacctgttcatcgtcgaattatttatgcgatgtgagat
ctaaatatgacatatgataagcaacataaaaaatcagcgcggattgtgggggaagtaatt
gggaaatatcaccctcatggtgacactgctgtttatgaagcaatggtaagaatggctcaa
gatttttcatatcgttatccgttaattgatggacatggaaattttggttcaatggatggt
gatgctccagccgcaatgcgttatactgaagcacggatgagtaaaattgctggagaatta
attaaagacattgaaaaagaaacagtaatttttgcagataattatgatggtagtgaacaa
gaaccaacttttttaccaggatattttccaaacctattagtgaatggggcaagtggaatt
gcggttggaatggcaactaatattccacctcataatttaggggaagtaattgatggtgtt
attgcaattacaaaaaataaagatattacaacagcacaattaacaaaaattattcgtggt
ccagatttcccaacgggagctttaattacaacaggaacaagtttattaaaagcatatgaa
acagggaatgggacaattacaattcgttcaaaagtaagtattgaagaaaataataataag
aaaaaaattattatttcagagattccttatcaagttaataaggcaaagttagttgaaaaa
attgctgatttaattaaagagaaaacaattgcaggaattgctgatttacgtgatgaatca
aaccgtgaaggggttagaattgttattgaattaaaacgtgatgtccaagagacatttatt
ttaaataagttatataaaatgacgccattacagacaaattattcgttaaatattttagcg
ctgtcaaaaaatcaaccaaaaataatgggaattaaacaaatccttaattattttattgaa
catcaaattaatattattatcaaaagaagtcagtacgatttaaaaaaatgtcagaatcgc
ttattaattttagaaggattaaaaattgcgttagaccatattgatgaagtaattaaaatt
attaaacaatccccaacaacacaagaagctaatgatggtttagtgaaagcatttaaattg
gctgttgaacaagctaaagccattttagaaatgcgtttacaacgattaacaggattggaa
attgaaaaaattattattgaaattgccgcaattaaaacggaaattctagagttagaaaaa
attatcaataatagtgattatcaaattgaaatcatgattaaagaattagaagaaattaag
agtaaatatggggatcaacgtcgaagccaaatcattcaagaagaattaacagagattgat
ccagaagaattaattaaacaagaaagtattttaatcttattgacaaaagatggttatatt
aagcgtgttacagaagatacttttaaaactcaaaatcgtggtggtaaaggaattattgga
acggcaaataatgttgatgatagtattaataaaattgttttagctaatagtattgattcg
ttatttttcttttctaattcaggaaaagtttataaattacgggcataccaagttgaaagt
tattcacgtcaagcacgagggttaccaattattaatttaattgcaattgacaaaaaagaa
caaattagaacaatattaacaattaatgaaagtatctcccaagatagtaatttatttttt
gtgacaaaaaaaggattaattaaaaaaactaaactatcagaatttagtcaaattcgccaa
tcaggaaaagtggccattgaattaaaagatggtgatgaactagttgatgttattgttagt
gatgataattgtgatattattattgcaaatgatgatggtaaagtaattcgttttaatgaa
aaagaaattcgtccaatgagtagacaatcaattggtgtaaaaggtattataaatgatgaa
ggtgaaacaattagtatttcatctcgattagctgcagaagagtatgttttatcagtgaca
gaaaatgggtttgctaaaaaaactttaatttctgaatatcgagcaactggccgtggaggt
aaaggtgttaagtctatgaacttaacagataaaacaggaaaattaacatttgttaatttt
gtgaaagatgatgaagagataattattgcaacaaaacaaggtaatattattcgtctgcca
ttatcacaaattccaacatttggccgaacaacatcaggagttaaattaattaagttaaat
aaagatgataaaattgaagtagttgaattactaagaatcaatgatttaaaaggagaatag
DBGET
integrated database retrieval system
