Spiroplasma syrphidicola: SSYRP_v1c02820
Help
Entry
SSYRP_v1c02820 CDS
T02677
Symbol
smc
Name
(GenBank) chromosome condensation and segregation SMC ATPase
KO
K03529
chromosome segregation protein
Organism
ssyr
Spiroplasma syrphidicola
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ssyr00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03036 Chromosome and associated proteins [BR:
ssyr03036
]
SSYRP_v1c02820 (smc)
Chromosome and associated proteins [BR:
ssyr03036
]
Prokaryotic type
Chromosome partitioning proteins
Condensin-like complex
SSYRP_v1c02820 (smc)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SMC_N
SMC_hinge
AAA_23
AAA_21
AAA_15
AAA_29
PRK
DUF6673
DUF7491
ABC_tran
SbcC_Walker_B
CENP-F_leu_zip
COG6_N
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
16152889
NCBI-ProteinID:
AGM25878
UniProt:
R4U5K6
LinkDB
All DBs
Position
296472..299438
Genome browser
AA seq
988 aa
AA seq
DB search
MLFLKRLEAVGFKSFADPLTINFDHEMIGIVGPNGSGKSNITDAIRWCLGEQSIKSLRGD
NSEDVIFNGSDAKSALNMAEVKLTFDNTRRIFNLDYDEIEIVRRVFRGSGENEYFINNQR
VRLKDVQEFALDTGLTKSSLAIISQGNINGFAEAKPLERRALFEEAAGVAKYKKRKLESL
KKLERSNENLDRLKDIINEIERKLPSLKRQSSKALRYKEKKDKLNEIELSILVKDITFFN
EKLLELREQQKVITSEKHEAERDLKNKENEYNELTKVNYGLDNKINSLSKDFQGLVTEIG
NLKVQKIELDNKKNSLKMANNDITIVEMLAKYNDLKAIVQMETEKLAALKTQQVEDHDSQ
RSLVKTQGSLNEQLGALNRSIIRLETDLEQAQRNIDNQDNLHPGVKNIIKNKNVLPGIVG
LVQEIISFDDKYEYAMAVALSGRLQDIIVKNVDSAKKAISYLKQNNAGHATFIPLDRIQP
RYISDNEQFVIKSVPGFLGLGHNLITTKKEYRQAVDYLLSRYIICDNFDSAQEVGQLLNF
KYNIVTLEGEIIRPQGAITGGSRNAKQIIVNFEKELTTIREQLAKKVAEQEAINKQLNGL
KTQLEEINEKISENQASIGASKRQIEIVEQDKLKIKNEYQLLTAKNIDESEFENGSESIN
INEMINQKEIIKVNIEQQLNVARSLKEKQTVTLNDLNNYISERRYYISALQEQVGKISTD
ISMLNVKTQQDLMRLTEEYHMTYEHATTLSLAAIDNEEAVREEIKQLRSDLADIGNVNLE
AIAEYQEEDSRYNFMLKEYEDLNKSVKNLLHSISEMDNLMQEQFDQTIKAVNKNLPHTFE
VLFGGGTAKIIYTEPDNILETGVDIKVSPPGKNIANLNLLSGGEKSLVALSVLFAILKAR
PIPLVILDEAEAPLDPANVERFAKYIKTFIDTTQFLIVTHRVGTMANCDILYGATMQKKG
VTKIVSIKLQQAEELIKNIESEGENRVN
NT seq
2967 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtgttatttttaaagagattagaagcagtaggatttaaatcatttgctgatccgttaacg
attaattttgaccatgaaatgattggaattgttggtccaaacgggagtggaaaatcaaat
attactgacgccattcgttgatgtttaggagaacaatcaattaagtctttacggggagat
aatagtgaagatgttatttttaatggttcagatgctaaatcagcgctaaatatggccgaa
gtcaaattaacatttgataatacccgccggatttttaaccttgattatgacgaaattgaa
attgttcgtcgggtttttcgtggttctggagaaaatgaatactttattaataatcaacgt
gtccgtttaaaagatgtccaagaatttgcccttgatactggtttaactaagtcatcattg
gcaattatttcacaaggaaatataaatggttttgccgaagcaaaaccattagaacgccga
gctttatttgaagaagcagcgggagttgctaaatataaaaaacgaaaattagaatcgtta
aaaaaactagaacgttctaatgaaaatcttgatcgtttaaaagatattattaatgaaatt
gaacgaaaattaccaagtttaaaacgccaaagtagtaaagcattacgttataaagagaaa
aaagataagttaaatgaaattgagttatcgattttagtgaaagatattactttttttaat
gaaaaattattagaattacgggaacaacaaaaagttattacttccgaaaaacatgaagct
gaacgtgatttaaaaaataaagaaaatgaatataatgaacttacaaaagttaattatggg
ttagataataaaattaactcattatcaaaagacttccaaggtttagtaacagaaattggg
aatttaaaagttcaaaaaattgaattagataataagaaaaattctttaaaaatggctaat
aatgatattacaattgttgaaatgttagcaaaatataatgatttaaaagccattgttcaa
atggaaactgagaaattagcagctttaaaaacccaacaagttgaagaccatgatagtcaa
cgaagcttagttaaaacacaaggtagtttaaatgaacaattaggggccttaaaccgttca
attattcgtcttgaaacggatttagaacaagcccaacgtaatattgataaccaagataat
ttacatccgggggttaaaaacattattaaaaataaaaatgttttaccagggattgttggc
ttagtccaagaaattattagttttgatgataaatatgaatatgcgatggccgttgcttta
agtgggcgtttacaagacattattgttaaaaatgttgatagtgctaaaaaagcaatttct
tatttaaaacaaaataatgctggtcatgcgacatttattccattagatcggattcaacct
cgttatattagtgataatgaacaatttgtcatcaagtctgttcctggttttttaggtctg
ggacataatttaatcacaacaaaaaaagaatatcgccaagcggttgattacttattaagt
cgttatattatttgtgataattttgatagtgcccaagaagttggtcagttattaaacttt
aaatataatattgtaaccctagaaggagaaatcattcgtccacaaggagcaattactggg
ggatcacgaaatgctaagcaaataattgttaactttgaaaaagaattaacaacaattcgc
gaacaattagccaaaaaagtagccgaacaagaagcaattaacaaacaattaaatggttta
aaaacgcagttagaggaaattaatgaaaaaatttcggaaaaccaagcttcaattggggca
agtaaacgccaaattgaaattgttgaacaagataagttaaaaattaaaaatgaatatcaa
ttattaacggcaaaaaatattgatgagtcagaatttgaaaatgggtcagaaagtattaac
attaatgaaatgattaatcaaaaagaaattattaaagttaatattgaacaacaattaaat
gttgcgcgcagtttaaaagaaaaacaaacagtaacactaaatgatttaaataactatatt
tcagaacgtcgttattatatttcagccttacaagaacaagttggaaaaattagcactgat
atttcaatgttaaatgttaaaacacaacaagatttaatgcgtttaacagaagaataccat
atgacctatgaacatgcgacaacgttatcgttagccgcaattgataatgaagaagcagta
cgtgaagaaattaaacaattacgaagtgatttagccgatattgggaatgttaacttagaa
gcaattgcggaatatcaagaagaagatagccgctataattttatgttaaaagaatatgag
gatttaaataaatctgttaaaaatttactacattcaatttcggaaatggataatttaatg
caagaacaatttgatcaaacaattaaagctgttaataaaaacttaccacatacttttgaa
gttttatttggtgggggaacagcaaaaattatttatactgagccagacaatattttagaa
acgggtgttgatattaaagtttcaccaccaggaaaaaatattgctaatttaaacttacta
tcgggaggagaaaaatcactagttgcattatcagttttatttgcaattttaaaggcgcgc
ccaatcccattagtaattttagatgaagctgaagctccattagatccagcaaatgttgaa
cgttttgctaaatacattaaaacttttattgatacaacccaattcttaattgtaacgcac
cgtgttggaacaatggcaaattgtgatatcttgtatggagcaacaatgcagaaaaaagga
gttacaaaaattgtaagtattaagttacaacaagcggaagaattaattaaaaacattgaa
agtgaaggggaaaatcgggtaaattaa
DBGET
integrated database retrieval system
