| Entry |
|
|---|
| Symbol |
secDF
|
|---|
| Name |
(GenBank) bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF
|
|---|
| KO |
| K12257 | SecD/SecF fusion protein |
|
|---|
| Organism |
ssyr Spiroplasma syrphidicola
|
|---|
| Pathway |
|
|---|
| Brite |
KEGG Orthology (KO) [BR:ssyr00001]
09120 Genetic Information Processing
09123 Folding, sorting and degradation
03060 Protein export
SSYRP_v1c05920 (secDF)
09130 Environmental Information Processing
09131 Membrane transport
03070 Bacterial secretion system
SSYRP_v1c05920 (secDF)
09140 Cellular Processes
09145 Cellular community - prokaryotes
02024 Quorum sensing
SSYRP_v1c05920 (secDF)
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02044 Secretion system [BR:ssyr02044]
SSYRP_v1c05920 (secDF)
Secretion system [BR:ssyr02044]
Sec (secretion) system
Prokaryotic Sec-SRP core components
SSYRP_v1c05920 (secDF)
|
|---|
| SSDB |
|
|---|
| Motif |
|
|---|
| Other DBs |
|
|---|
| LinkDB |
|
|---|
| Position |
complement(634042..637173)
|
|---|
| AA seq |
1043 aa
MQQVEQTKKTKKSPVDKKKITKLIARISILVLFAVAIIVGSFFSADNFRYQYKTGIAYSG
GYQVQVDVYDHSVTNPDPNTPNGNSEKGLELLKAKLDPLNNSNLYLQTLGKHSVEVMIGK
NNFTNFNDLINNIQRLGAIYLTDSTGKDLLVKDNERTPLSDVISGSTTGVDQARNPVITL
QIKDQVKWNEIINSLTPEQGNAQPLYIWTDIGQFIDDLRHDTDNIEIIRTAFNQLSLAAD
NNVLKIFNFEYYDAGTSSTKRDNLLTTSLFGAQLVEVMKSEKFTFQDVKHNDLIIDPNDK
AAISNIYLDPIRPKLKQIIDYSKKLTDKYKKYLINWDSINKGVGAGANSNTIQTTTATEA
KQISNLINGGLSGYAFVISGYREIDPVVSQPIFIISMVILGVLTLAIFVYLIVYYRLFGF
IGVLTLAFTIILTLYFSSLLGVQISPESISALIIAFGIGLEGNILFYSRYKRERYENGVP
YEPAVKIANKQTIALFVDAVVVLIILGLSLFWVGTNNIKSFATILLVNLIIAMVMVFAVA
RLLYWVVIKLRWQEKFKWLDIPQYSFNKLILKKKKNGYSYHSDDKLLATATATATVVGSE
TPAKSDVVGTETPINDSLKKSKKPKKLTARFYHFSKWTPIAGLILVIAAIIIALTGAANF
DSSIKKGTEITIGSEYWQDHENEEKAKADLANHLDTIIREHKIKTKFTYNLYTIKRLNDT
KVLVVSTNITGSNYARALLASIASYYGASAEDSGINMYQTNPIMEVKALIITLISFAIGI
LCIFVYTLFRLDWAQFVGIVLGSLFALSITVSIAIIFQILITFEMLVAFIAIFGFAMAIG
TIIMARAKQNKRTVNNVEYEKFFNYMSKHHNAVKKLRNEPKQYVKAEIKALRLANPELKR
GEFKETFKAQIKAIKTQAAEIKKKNKKEIKVINKEFHQYDLANNFLQKIANITIKQMFKH
CLTLLIILGSLLLVLAAFSGSLFGFNLVIFLGIFFGMFATLLIGIPIWVSLEKYRALNKI
RVKNYLDSQRVEIDEQIVIGIND |
|---|
| NT seq |
3132 nt +upstreamnt +downstreamnt
gtgcaacaggtagaacaaacaaaaaaaactaagaaaagcccagttgataagaaaaaaatt
actaaattaattgctcgaatttcaatattagttttatttgctgttgctattattgttggt
tcttttttttctgccgataatttccgttatcagtacaaaacggggatagcttattctggt
ggataccaagttcaagttgatgtttatgatcattccgtaactaatcctgaccctaatact
ccaaatggaaatagtgaaaaaggtttagaattattgaaagccaagttagaccctttaaat
aattctaatttatatttacaaacattagggaaacatagtgttgaagtcatgattggtaaa
aataatttcactaattttaatgatttaattaataatattcaacgtttaggagcaatttat
ttaactgatagtacaggaaaagatttattggttaaagataatgaaagaacaccattaagt
gatgttatttcgggctcaacaacaggggttgaccaagctcgtaatccagttattacttta
caaatcaaagaccaagttaagtgaaatgaaattattaattcactaacaccagaacaaggt
aatgcacaaccattgtatatttgaacggatattggtcaatttattgatgatttacgccat
gatactgataatattgaaattattcgtactgcttttaatcagttaagtttagctgccgat
aataatgttttaaaaatttttaattttgaatattatgatgctggaacatctagcacaaaa
cgcgataatctcttaacaacttcattatttggagcccagttagttgaagttatgaaaagt
gagaaatttacttttcaggatgttaaacataatgatttaattattgatccaaacgataaa
gcggcaatttcaaatatttatcttgatccaattcgtccaaaattaaaacagattattgac
tattcaaaaaaattaacagataaatataaaaaatatttaattaactgagattcaattaat
aaaggggttggagcaggggctaactcaaatacaattcaaacaacaactgcgaccgaagca
aaacaaattagtaacttaattaatggtgggctaagtggttatgcctttgtaatttcggga
taccgtgaaattgatccagttgtatcacaaccaatctttattatttcaatggtaattctt
ggcgttttaacgttagcaatctttgtttatctaatagtttactatcgtttatttggtttt
attggcgttttaacattagcctttacgattattttaacgctatatttttcatcattacta
ggggttcaaatttctcctgaaagtatttcagcattaattattgcttttggaatcggatta
gaaggaaatattctattttattctcgctataagcgtgaacgttatgaaaatggtgttccc
tatgaaccagcggttaagattgctaataaacaaacaattgccttatttgttgatgcagtt
gttgtgttaattattttaggattatctttattctgagttggaacaaataatattaaatcg
tttgcaacaattttattagttaacttaattattgcaatggtaatggtctttgctgttgca
cgattattatattgagttgtaattaaattacgttgacaagaaaaatttaagtgattagat
attccccaatattcatttaataaattaattttgaaaaagaaaaaaaacgggtattcttat
catagcgatgataaattattagcaacagcaacagcaacagcaacagtagttggaagtgaa
accccagcaaaaagtgatgtggtggggacagaaactccaattaatgatagtttgaaaaaa
agtaaaaaaccaaaaaaactaacagcgcgtttttaccacttttcaaaatgaacaccaatt
gctggattgattttagttattgccgcaattattattgctttaacaggagccgctaatttt
gatagttcaattaaaaaaggaacagaaatcacaattggaagcgaatattgacaagatcat
gaaaatgaagaaaaagccaaagcagatttagctaaccatcttgataccatcattcgtgaa
cataaaataaaaacgaaatttacttataacttatatacaattaaacgtttaaatgataca
aaagttttagttgtaagtacaaatattactggttctaactatgcccgagcattattagct
tcaattgcttcatattatggagcatcagcagaagatagcggaattaatatgtatcaaact
aatccaattatggaagtaaaagctttaattattaccctaattagttttgcaattggaatt
ttatgtatttttgtttatacattattccgtttagattgagcgcagtttgttggaattgtt
ttaggaagtttatttgctttatcaattacagtttcaatcgcgattattttccaaatttta
attacttttgaaatgttggttgcctttattgctatttttggttttgcgatggcaattgga
acaattattatggctcgagcaaaacaaaataaacgaacagttaataatgttgaatacgaa
aaattctttaattatatgtcaaaacatcataacgcagttaaaaaactacgtaatgaacca
aaacagtatgtcaaagctgaaattaaagccttacgtttagcaaacccggaattaaaacgt
ggcgaatttaaagagacttttaaagcgcaaattaaagcgattaaaactcaagcggctgaa
attaaaaagaaaaataaaaaagaaataaaagtaattaataaagagttccatcagtatgat
ctagcaaataactttttacaaaaaattgctaatattacaattaaacaaatgtttaaacat
tgtttaacattattaattattttaggttcattattattagtattagcagcattttcagga
agtttatttggctttaacttggtaattttcttaggaattttctttggaatgtttgcaaca
ttgttaattggaattccaatttgagtatcattagaaaaataccgtgccttaaataaaatt
cgggtaaaaaattacttagactcacaacgagttgaaattgatgaacaaattgtcatcggg
ataaatgattaa |
|---|
