Spiroplasma syrphidicola: SSYRP_v1c08630
Help
Entry
SSYRP_v1c08630 CDS
T02677
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
ssyr
Spiroplasma syrphidicola
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
FtsX
DUF3124
Sigma_reg_N
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
16153399
NCBI-ProteinID:
AGM26452
UniProt:
R4U4P6
LinkDB
All DBs
Position
complement(921497..925021)
Genome browser
AA seq
1174 aa
AA seq
DB search
MVSFVLLKNFWKSFLKNSLQVLGLFLMLGAMITLFCGMQLSHDLTSTQLKIMGKDLFATN
TSFEINDPLEIVNSDSNMSYSLTNINYINSDGKINVKKAHAANFKLTPVAGTKYYQVTFD
SHLDNKDNWIGSKSQNQYFKDQLEKSNEVKLKFDPLFLANNPYFLSSQEFAELKNYLIEP
DWTGLIPFVSSPDNNELKNDSYYQSKYKDFANNQARINQLEIKLLTSIIFGSVSQKALIS
QTMDIYDIFRTQYFYLQSVEEDFWTKPIMISGDYDNFINYQSENDILPVIINPTYASNHG
YRIGSIINIYNYNFEIVGLATNAYVNSNYYAKPFTQNAYTWLRQEDFALIKNSITNENDQ
FITDDAYIFYGAVYPPEQELNPDFLKDQYSWYYLASLFNNAKINNWEVPWNPLDNIITFI
KTKETMTWSLISAISILLIVSSFIMISMIINKLLVTNRTIIGNLKAQGYSATRITTNLVT
CFFFLALIITSLSLLSSWLFSLVLNITYKNFLEFTAYLSVPTLWTILTIIVFPILAICLY
AAIFILINIRVPALRLMTTNVKKPKLPKNVFWAHYFAKLSFQKKITLKFAATAKWKLLLT
IITTSISGAMLFSAFTTVLNFGQVSYNLKNNLNWHYAYNYNNSYNANSPPYDFLVYDSLE
QIKDPKVPGKTILDPTKEIYTKELVLEKVVTPQQTLCGPHIEGVSEITSLKYLWFYAKTY
DWYANNCQNTPYYDEITNLINKSIYGYIIDQVSENNGIITIGYEPIIYGPEYQELFVNNS
SMNGYEALNIGDLYSFLQSYQNANSTVGNDLSINNFYRNFTQNYNLKYFQGAGLEFYKYK
DDNILFKPNLSTNLSPEWFFNGIDSFDEGNDSLLAYAKKNTFMPKVNNAILNVAAMKELI
QSKNWFHESNPSWDPKNYSVDVYPIIINKGISFIHGINVGDIINKTFGPWGTTFYIVVDN
FWNGPKNNLLVNWYTNTNLNQQHLSTLYSIGKTNSLYNYLGIYEKNNNYQIMENPNYEGA
IVYQGAMDLDKTLSSTLNLQALLFIIYLLILFATILACIFQIFIITNIIIKDNLKVLNSF
KALGYSDWWIFNRLFMIYLPIVIISWVIGIPIGIWGIDMVRFQIIWNMIAYVSNGVIWVD
YLISFLGLWLMFIIAFLINKKFMNKRYPLTRVLN
NT seq
3525 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggttagttttgttttgttaaaaaatttctgaaaaagttttttaaaaaatagtcttcaa
gttttagggctatttttaatgctcggggcaatgataacattattttgtgggatgcaatta
tcccatgatttgactagcacccagttaaaaattatgggaaaagatctttttgcgacaaat
actagttttgaaataaatgatccgttggaaattgttaatagtgatagtaatatgtcttat
agtttaactaatattaattatattaatagtgatggaaaaattaatgttaaaaaagctcac
gctgctaattttaagctaacacctgttgcgggaacaaaatattaccaagtaacatttgat
tcccatttagataataaagataattgaattgggtcaaagagtcagaaccaatatttcaaa
gaccaattagaaaaaagtaatgaagtaaaattaaagtttgatcctttatttttagctaat
aacccttattttctatcatcccaagaatttgcagaattaaagaattacttaattgaaccg
gattgaactggtttaattccatttgttagttcacctgataataatgagttaaaaaatgat
tcttactatcaaagtaaatataaggattttgctaacaatcaagctcgaattaatcaatta
gaaattaaactattaacaagtattatatttggttcagtatcgcaaaaagccctgatttca
caaacaatggatatttatgatatttttagaactcagtatttttatttacaaagtgttgag
gaagatttttgaacaaaaccaatcatgattagtggggattatgataattttatcaattat
cagtcggaaaatgatattttaccagttattattaacccaacttatgcttctaatcatggt
tatcgcattgggagcattattaatatttataattataattttgaaattgtgggtcttgca
accaatgcttatgttaattctaattattatgcgaaaccatttacacaaaatgcttataca
tgattacgccaagaggattttgctttaataaaaaattcaattacaaatgaaaatgatcag
tttattaccgatgatgcttatattttttatggggcagtttatccccctgaacaagaatta
aaccctgactttttaaaagaccaatatagttgatactatcttgccagtttatttaataac
gcaaaaattaataattgagaagttccctgaaatccattagataatattataacttttatt
aagacaaaagaaacaatgacttgatcattaattagtgcaatttcgattttattaattgta
tcctcatttattatgattagtatgattattaataaattattggtaactaatcgaacaatt
attggtaacttaaaagcgcagggttattcagcaactagaattacaactaatttagtaact
tgttttttctttttagccttaattattacatccttatcattattatcaagttgattattc
tcattggttctaaatattacttataagaattttttagaatttacagcttatctttcagtt
ccaactttgtgaacaattttaacaattattgttttcccaattttggcaatttgtttatac
gcagcaatttttattttaataaatattcgtgtaccagctttaagactaatgacaactaat
gttaaaaaaccaaaattaccaaaaaatgttttttgagcacattattttgctaaattaagt
tttcagaaaaaaataaccttaaaatttgccgcaacagcaaaatgaaaactattgttgacg
attattactacaagtatttcgggggcaatgctattttccgctttcacaactgttcttaat
tttggccaagttagttataatttaaaaaataatttaaattgacattatgcttataattat
aataattcttataatgcaaattctccaccatatgattttttagtttatgatagtttggaa
caaattaaagatccaaaagtgccagggaaaacaatcttagacccaacaaaggaaatttat
acaaaagagctcgtattggaaaaagttgttactccccaacaaacgctttgtggcccacat
attgagggagtttcagagataactagtttaaaatacttatggttttatgcaaaaacatat
gattggtatgctaataattgtcaaaatacgccatattatgatgaaattactaatttaatt
aataaaagtatttatggttatattattgatcaagttagtgaaaataatggaattattaca
attgggtatgaaccaatcatttatggaccagaatatcaagaactatttgttaataattct
agtatgaatggttatgaagcattgaatattggtgatttatatagttttttgcaatcttat
caaaatgcaaatagtacggtcggtaatgatttgtcaattaataatttttatagaaacttt
acccaaaattataatttaaaatatttccaaggtgcagggcttgaattttataaatataaa
gatgataatattttatttaaaccaaatttatcaacgaatttatcgccggaatgatttttt
aatgggattgatagttttgatgaaggcaatgatagtttattagcatatgccaagaaaaat
acctttatgccgaaagttaataatgctattcttaatgtggcggcaatgaaagaattaatt
caatctaaaaactgatttcatgaatctaatccaagttgagatccaaaaaattattcagta
gatgtttatccaattattattaataaaggaattagttttattcacggtattaatgttggg
gacattattaataaaacctttggcccttggggaactaccttttatattgttgttgacaat
ttctgaaatggtcccaaaaataatcttttagttaactggtatactaacacaaacttaaac
caacagcatttatcaacactatattcaataggaaaaacaaatagtttatataattattta
ggaatttatgagaaaaataataattatcaaattatggaaaatcctaattatgaaggggca
attgtatatcaaggagcaatggatttagataaaacattaagtagtactttgaatttacaa
gctttattatttattatttacttattaattttatttgcaacaattttagcttgcatcttc
caaatttttattattacaaatattattattaaagataatttaaaagtcttaaatagtttt
aaagcattaggatattctgattgatgaatttttaaccgtttatttatgatttatttgcca
attgtcataattagttgagtgattggaattccaatcggaatttgaggaattgatatggtt
cgtttccaaataatttgaaacatgattgcttatgtttctaatggtgttatttgagttgat
tatttaattagcttccttggcttatgattaatgttcattattgcctttttaattaataag
aaatttatgaataaacgttatcctttaacgcgggttttaaattaa
DBGET
integrated database retrieval system
