Spiroplasma syrphidicola: SSYRP_v1c09950
Help
Entry
SSYRP_v1c09950 CDS
T02677
Symbol
polA
Name
(GenBank) DNA polymerase I
KO
K02335
DNA polymerase I [EC:
2.7.7.7
]
Organism
ssyr
Spiroplasma syrphidicola
Pathway
ssyr03030
DNA replication
ssyr03410
Base excision repair
ssyr03420
Nucleotide excision repair
ssyr03440
Homologous recombination
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ssyr00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03030 DNA replication
SSYRP_v1c09950 (polA)
03410 Base excision repair
SSYRP_v1c09950 (polA)
03420 Nucleotide excision repair
SSYRP_v1c09950 (polA)
03440 Homologous recombination
SSYRP_v1c09950 (polA)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03032 DNA replication proteins [BR:
ssyr03032
]
SSYRP_v1c09950 (polA)
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
ssyr03400
]
SSYRP_v1c09950 (polA)
Enzymes [BR:
ssyr01000
]
2. Transferases
2.7 Transferring phosphorus-containing groups
2.7.7 Nucleotidyltransferases
2.7.7.7 DNA-directed DNA polymerase
SSYRP_v1c09950 (polA)
DNA replication proteins [BR:
ssyr03032
]
Prokaryotic type
DNA Replication Elongation Factors
Elongation factors (bacterial)
Other elongation factors
SSYRP_v1c09950 (polA)
DNA repair and recombination proteins [BR:
ssyr03400
]
Prokaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
BER (base exicision repair)
DNA polymerase I
SSYRP_v1c09950 (polA)
NER (nucleotide excision repair)
GGR (global genome repair) factors
SSYRP_v1c09950 (polA)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DNA_pol_A
5_3_exonuc_N
DNA_polI_exo1
5_3_exonuc
HHH_2
HHH_5
HHH
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
16152848
NCBI-ProteinID:
AGM26582
UniProt:
R4U519
LinkDB
All DBs
Position
complement(1083833..1086436)
Genome browser
AA seq
867 aa
AA seq
DB search
MNKILLIDGNSLIFRAFYATAYSGEMLKSLDGTPTNAVYAFANMLNKILKDNNYYSVVVA
FDKGKINFRHDLIADYKAGRSKTPEELVQQFPIVKEFLDSYQIPYLEKEGYEADDLLGCL
AKQAETQNYYVDILSSDKDLFQLISDKTNILIPRQGDSADIFDKTALLNKWEVSPEQVPD
LKGLMGDPSDNLKGIPGVGEKTAIKLIKEYQTIENIYQNIDDIKGSLKNNLISHQAEALL
CKKVATILCDLELGDFAFSKLEVNKEKLLDFYLKYNMNSYVTKLYNNSEPVKQSLAVKVI
TEWSEEWNEDGTTVFLELFDENYHLSELIGFGIVNSHGIFYFDYTSAKFDTSFHAFLANE
NYQKFTYNAKSLIVGLGRDNITINNISYDMMLAGYIYNSNTKNTLDNYINLFAKKQILSD
ELFYGKGVKKTIPTDLNKLSYFIGEKANYIHTLREKIVSLLTSSNQYQLYYDIELPTTFA
LARMERAGVKVDQRELSKQTVRIEQIVNDLNREINTMANKEVNPNSPKQLSELLYQDLQL
KDHKKGSTAQEVLETIKLSHPIISKILDYRKYQKLYSTYLKGMEKYLFQDGKVHTIYKQT
LTATGRLSSVEPNMQNISIRDEVQKEVRKIFVVSSEDNILLSADYSQIELRILADMSKDD
HMLAAFNAGEDIHTNTAMKIFNLKKEEITSTIRRSAKAVNFGIIYGISDFGLANDLNISV
PEAKEIIQNYYQQFPTIKNFIDSQVEFCKNNGYVMTMFNRKRYVPEINDANYMQREFGKR
IAMNMPIQGTAADIIKIALKNIDQELLRLKLRTKIIAQIHDELIFEVPKTELAQVKALVK
DLMENSTKLSVKLTVDMVEGASWYQLK
NT seq
2604 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaataaaattttactaattgatggaaactcattaatctttcgggctttttatgcaaca
gcctatagtggtgaaatgttaaaaagtttagatggaacaccaacaaatgccgtttatgct
tttgctaatatgttaaataaaatcttaaaagataataattattatagtgttgttgtggct
tttgataagggaaaaattaattttcgccatgacttaattgctgattataaagcgggaaga
agtaaaaccccagaagaattagtacagcaatttccaattgtgaaagaatttttagatagt
tatcaaattccttatttagaaaaagaaggatatgaagccgatgatttgctaggttgttta
gctaagcaagctgagacgcaaaattattatgttgatattttatcaagtgataaagattta
tttcaattaattagtgataaaacaaatattttaattcctcgccaaggtgatagtgctgat
atttttgataaaacagcactattaaataagtgagaagttagtcccgaacaagttcctgat
ttaaaaggtttaatgggtgatccttctgataatttaaaaggaatccccggggttggagaa
aaaacagcgatcaagttaattaaggaatatcaaacaattgaaaatatttatcaaaatatt
gacgatattaaagggagcttaaagaataatttaattagtcatcaagctgaagcgttatta
tgtaagaaagtagcaacaattctatgtgatttggaattaggtgattttgcttttagcaaa
ctagaagttaacaaagaaaaactactagatttttatttaaaatataatatgaattcttat
gttactaaactttacaataatagtgaaccagttaaacagagtttagccgttaaagttatt
acagaatgaagcgaggaatgaaatgaagatgggacaactgtttttttagaattgtttgat
gaaaattatcatctatccgaacttatagggtttggaattgttaattcgcatggtattttt
tattttgattatacgagtgctaaatttgacacgagttttcatgcttttttagcaaacgaa
aattatcaaaaatttacttataatgctaaaagtttaattgttggtttaggccgcgataat
attacaattaacaatattagttatgacatgatgttagcgggctatatttataattcaaac
acaaaaaatacccttgataattacattaatttatttgctaaaaaacaaattttatctgat
gaattattttatggcaaaggggttaaaaaaactattcccacggatttaaataaattaagt
tactttattggcgagaaagcgaattatattcacacgttacgtgaaaagattgtttcttta
ttaacaagtagtaatcaatatcagttatattatgatattgaattaccaacaacatttgct
ttggctcgaatggaacgagctggagttaaagttgaccaacgagagctatcaaaacaaact
gttcgaattgaacaaattgttaatgacctaaatcgtgaaattaatacaatggccaataaa
gaagttaatcctaattctccaaaacaattatcggaattattgtatcaagacttacaatta
aaagatcataagaagggttcaacagcccaagaagttttagaaacaattaaattaagtcac
ccaattattagtaaaattttggattatcggaaatatcaaaaattatattcaacctattta
aaagggatggaaaaataccttttccaagatgggaaagtgcacacaatttataaacaaaca
ttaacagcaactggacgattatcttcagttgaacctaatatgcaaaatattagtattcgc
gatgaagtacaaaaagaagttcgtaaaatttttgttgtctcatcggaagataatatttta
ttatcagcagactattcacaaattgaattgcgaattttagctgatatgtcaaaagatgat
catatgttagcagcatttaatgctggagaagatatccatactaatacggcgatgaaaatt
ttcaatttgaaaaaagaagaaattacttcaacaattcgtcgcagtgctaaagcagttaat
tttggaatcatttatgggattagtgattttggtttagccaatgatttaaatatttctgtg
ccagaagcaaaagaaattattcaaaattattatcaacaattcccaacaattaaaaatttc
attgatagtcaagttgagttttgtaagaataatggctatgttatgacaatgtttaaccgt
aaacgctatgttccagaaattaatgatgctaattatatgcaacgggaatttggtaaacgg
attgcaatgaatatgccaattcagggaacagcggccgatattattaaaatagctttaaaa
aatattgatcaagaattattacgcttaaagttaagaacaaaaattattgcccaaattcac
gatgaattaatttttgaagtcccaaaaacagaattagcacaagtaaaagcgttggtgaaa
gatttaatggaaaattcaacaaaactaagtgttaaattaactgttgatatggttgaagga
gcatcttgatatcaattaaaataa
DBGET
integrated database retrieval system
