Staphylococcus halotolerans: AAB980_000820
Help
Entry
AAB980_000820 CDS
T11589
Name
(GenBank) phage tail tape measure protein
Organism
stam Staphylococcus halotolerans
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Peptidase_M23
PhageMin_Tail
pPIWI_RE_Y
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
XTP97588
LinkDB
All DBs
Position
58658..64831
Genome browser
AA seq
2057 aa
AA seq
DB search
MSENIKGVTIRNTIDNSQVEEGFKGLKRQLGLANSELKSNLSAFEKSEQSMKKYQTRIDG
LNNKMKIQKQMFNQAEQELKDLNANYTKAKQTVSGVEKAYKSLADATKKEKAALDKSNDA
VKSSNAELKKSQSQYKRTTEQKERAYQKLKQLRQAEKDLKNSNQATTAQLKRAADATQKQ
SQKHKELVQKYKDEDAQVKKLRKQNDSLVSTNKKVKDTYDKTNTELKQTEKEYNNLNSTI
KNHGQNLTNAQKKVNDERTSMNNLQKSIDRTSKEMKSFNKEQLIANSQFTKTANHLDTMS
EKFGKIGHGMTSVGRSMSIGVTTPIVAGFGASVKAAVDYEQALAGVAKTTNLSGAELNKM
SDEITGMSKQMPFAATEIAGVAEAAGQLGVKKSEITDFTKTMLDMSVATNLTSEEAATEF
ARFANAAGMPIDKVDRLGASVVALGNTTATTEKEIVEMGQRLAGAGSQAGFSADQIMSIS
AAMSSVGIEAEAGGTAMTQIFNKMTKATAEGGETLDNFGKTAGMTGKEFAETWEANPTKA
LSAFVKGLSNTEGGAKGVLKALDSVGIKGIREADTIRRLSNNHTVLDKALRTGAKGWKEN
NALTNEAKTRYKTMGSQLQIFKNQLFALGKDIGNVIAPVVVGITKKFGQWAESFTKMPKP
IKGVAIALGLVAAATGPVVLGVGLLLRAVGSAAKGYASLNRQMAINTAEATVNAGANKAA
AGSLVTTGKATKGQQGMFGKLGNVLSTTTGRYGKLGKAVKLTGGILGKLTIPLTIITTIF
GVAYQKIDWFKQGFSDMGKIVNQVGKSIDFSWVGKMTKEISGQWEWLKNDMARGLQDGAL
FKGIKVGFDGLHKAVSKASDTTDVFAGKVSKGTKKALGSYNNLSEKAKTKLEEIRISHSK
IGDKQLHQITSLYGNINEEVTKQLDKRHDNEVKGLQKIFNRTNGLTKSEEAKILETTKNS
NKKESKEAQRINNQILGIYRVAHKEKRSLTKKENAKVAELQRNLDKTVVKSLSKGEVEQK
AILERMKQNKGKLSMQAASNVIKESAKERDTTIKDAKKKYKDTVAEAVKQRDETGTLSKS
QADKVIKNAKKQYDESKGKAKKQHKAVVNQAQKQNKGVKKNIDSQTGHVKSQWEIMKDSS
IGGAKKISKKVVGYFKDTHQGANKWWSKVGKTVGNKSKEGYNGAQKWFSKTKNKSITYFK
DTKKGADKWWNKLGSKIASESKGAWKDTGRWFSKTKTRSVNYFKDTKQGADKWWSKLGSK
IASEAKGAWKDTGKWFSKTKNKSIAYFKDTKNGADKWWNKLGSKIANKSKDSYNSSKKWF
GKTKDKSIAFFKDTHGGANKFWNKIGDKISSKSRSSYDSAKKWFGKMKDSTGDRLSDMWG
KAKDIFGKIAGEGEDKSKKTHGSWKGWLGKTLDWIKNIKKDFGKAASDLGKSVANKAIDG
LNGMIGGINKISKAITDKTLIKPITPLSTGTYNGASVATDSEGGLKQSTLAVVNDKGSGN
APGGGVQEVIEKADGSLHAPQGRNVVVSLDPGDKVHNATDTKRYQDMGVLPKFSTGTKKK
KKDDPLEYLKEAAGGVIKGTGKKISDGYHSTKEASKDAFDTIKKGGSKVLEKGKDAASWL
GDKIGDAWHYVKNPGKLVEKMIGHISFGKENKTMEMAGLAFKHLKKSLVEKVKSWFEEAE
GGDGDAAWLLKHHILQTFGHYTGGLMFNGGRHYGIDFGMPTGTKIRALTAGKISQAGPVA
GGGGNQITLDEPGGKWFQWYMHMSKIIAKKGQRVSAGDVIGLSGNTGNSTTPHLHIQRMK
GYPSNDTAVDPMKWLKSLKGSSQNKKASAWSDDIKRAAKRMNVTLQGNDLKNIISLIHHE
SGGNAGVTQGNIGDINNLLGTPAQGLLQYVPSTFKSYAMKGHTNIKSGYDQLLAFFNNKY
WRSQFNPLGGWSPSGPRKYENGGMVTKHQIAEIGEGNKAEMVIPLTKRNRAVQLIEQAMK
YVGMDTGNTNVTVNNDNSTVEKLLKQLVRVNDQNNKLTQTIISLLSNQKQGSPKDAANII
SQILGENMRMASYSQGG
NT seq
6174 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagcgaaaatattaagggtgtaacgatacgtaacaccatagataactcacaagtagaa
gaaggatttaaaggactaaaaagacagttaggcttagctaatagtgagttgaagtctaat
ttatctgcgtttgaaaaatcagagcagtctatgaaaaagtatcaaacgagaatagatgga
cttaacaataaaatgaaaatccaaaagcaaatgttcaatcaagcagaacaagagcttaaa
gatttaaatgctaattatacaaaagctaagcaaactgtaagtggtgtagaaaaagcttat
aagtctttagcagacgcgactaaaaaagaaaaagccgcacttgataaatcaaatgacgcg
gttaaatcctccaatgcagaattaaaaaaatctcaatctcagtataaacgaacgacagag
caaaaagaaagagcctatcaaaaattaaaacaattaagacaagctgaaaaagatttaaaa
aattcaaatcaagctactactgcacaactaaaaagagctgccgatgctacacagaaacaa
tcccaaaaacataaagaattagtacaaaagtataaagatgaagatgctcaagttaaaaaa
ttaagaaagcaaaatgactctttagtttcaacgaataaaaaagtgaaagatacttacgat
aagactaatacagagttaaaacaaacagaaaaagaatacaacaaccttaattctactatt
aaaaatcacggtcaaaatttaactaatgcacagaaaaaagtaaacgatgaacgaacttcg
atgaataacctacaaaagtctatcgatagaacttcaaaggaaatgaagtcgtttaataaa
gagcagttaattgcgaatagtcagtttactaaaactgcgaatcatttagatactatgtct
gagaagtttggcaaaataggacatggcatgacttcagtcgggcgttcaatgtcaattggt
gttacaacgcctattgttgctggttttggggcatctgttaaagcagcagttgattacgaa
caagccttagcaggagtagcaaaaaccaccaacttatcgggcgcagaattaaataaaatg
agcgatgaaatcactggaatgtctaaacaaatgccttttgctgcaactgaaattgctgga
gtagctgaagcggcaggacaattaggtgttaaaaaatctgagattacagactttactaaa
acaatgcttgatatgtctgttgcgactaatctaacttcagaggaagcagctacagaattt
gcaagatttgccaatgctgcaggaatgccaatagataaagttgataggttaggtgcaagc
gttgtagctttaggaaatacaactgcaactaccgaaaaagaaattgtagaaatggggcaa
agattagctggcgcgggttcacaagccggttttagtgcagatcaaatcatgagtataagt
gctgcaatgagttctgttggtattgaagcagaagctggtggtactgctatgacccaaatt
ttcaataaaatgactaaagcaactgctgaaggtggagaaactttagacaatttcggtaaa
acggcaggaatgacaggtaaagaatttgcagaaacttgggaagcgaaccctactaaagcc
ttatctgcatttgtaaaaggtttaagtaatactgaaggtggagctaaaggcgtattgaaa
gctttagatagtgtaggtataaagggtattcgtgaagctgatacaattcgtagactgtct
aataaccatactgtactagataaagccttaagaactggtgctaaaggttggaaggaaaat
aatgcactaactaatgaagcgaaaactcgttataaaacgatgggctcacaattacaaata
tttaagaatcaactattcgcgttaggtaaagacattggtaatgttattgcgccagttgta
gttggtattactaaaaaattcggacagtgggcagaatccttcaccaaaatgccaaaacct
ataaaaggcgtagctatagctttaggcttagttgcagctgctacaggacctgttgtgctt
ggtgtaggtctattattaagagcagtaggcagtgcagcgaaaggctatgctagtttaaat
agacaaatggcgattaatacagctgaagcaactgttaatgctggagctaataaagcagca
gcaggttctttagttaccacaggaaaagctactaaaggtcaacaaggtatgttcggtaag
ttaggaaatgttttatctacgactactggacgttacggtaaacttggcaaagcagttaag
ttaactggtggtatattaggtaaattaactattccgctaacaataataactactatcttc
ggagtagcgtatcaaaagattgattggtttaagcaaggcttttctgatatggggaaaatt
gtaaaccaagtaggtaaaagtattgatttttcttgggtaggtaaaatgactaaagaaata
tcagggcaatgggaatggctaaaaaatgatatggctagaggtttgcaagacggcgcactt
ttcaaaggaattaaagtaggatttgatggcttgcataaagctgtttctaaagcatcagat
acgacagatgtttttgctggaaaagtatctaagggtactaaaaaggctttaggttcttat
aataatttatctgaaaaagcaaaaacaaaacttgaagaaattcgtattagtcattcaaaa
attggagataaacagttacatcaaattacttcactttatggaaatatcaatgaagaagta
actaaacagcttgataaacgtcatgataatgaagttaaaggcttacaaaagattttcaat
agaacaaatggtttaactaaatcagaagaagcaaaaatacttgaaaccactaaaaatagt
aacaaaaaagaatcaaaagaagcccaaagaattaacaatcaaattttaggtatttacaga
gtagctcataaggaaaaacgatctttaactaaaaaagagaatgctaaagtagctgagcta
cagagaaacttagataagacagtggttaaatctctatctaaaggagaagttgaacaaaaa
gctatccttgaaagaatgaaacagaacaaaggtaagctatcaatgcaagctgcttctaat
gtcattaaagaaagtgctaaagaacgtgacactacaattaaagatgctaaaaagaaatat
aaagatacagtagcagaagcagttaaacaacgtgatgaaacaggtactttatctaaatca
caagctgataaggttatcaaaaatgctaaaaagcaatatgatgaatcaaaaggcaaagct
aagaaacaacataaagctgttgtaaatcaagcgcagaaacaaaataaaggtgttaagaaa
aacattgattctcagacaggacatgtgaaatctcaatgggaaattatgaaagattcttct
attggcggagctaaaaaaatatcgaaaaaggttgttggttatttcaaggatacacaccaa
ggtgctaataaatggtggagtaaagttggaaaaactgtaggtaataaatcaaaagaaggc
tacaatggtgctcaaaagtggttcagcaagacgaaaaacaaatctataacttacttcaaa
gatacgaagaaaggcgccgataagtggtggaataaactaggttctaaaattgctagtgag
tcaaaaggagcttggaaagatacaggtaggtggttcagtaaaactaaaacacgctctgtt
aattatttcaaagacacgaaacaaggtgctgacaaatggtggagcaagttaggaagtaaa
atagcaagcgaagctaaaggcgcatggaaagacaccggtaaatggtttagtaaaactaag
aataaatcaatagcctactttaaagatacaaaaaacggagcagataaatggtggaataaa
ttaggtagtaaaatcgctaataaatccaaagatagttataacagttccaaaaaatggttt
ggtaaaacaaaagacaagagtatagccttttttaaagatacacacggtggagctaacaaa
ttttggaacaaaataggagacaaaatttctagtaaatcaagaagtagttacgacagtgca
aaaaaatggtttggcaaaatgaaggattcaactggtgatagactatctgacatgtggggt
aaagctaaagatatttttggtaaaatcgccggcgaaggcgaagacaaatctaagaaaaca
catggaagttggaaaggttggttaggtaaaacactagattggattaaaaacatcaagaaa
gattttggaaaagccgcatcagacttaggtaaatcagttgcgaacaaagcgattgatgga
ctaaatggaatgattggcggtattaacaaaatttctaaagctataactgataagacttta
atcaaacctatcacacctctatcaactggtacttataatggtgcctccgttgctactgac
agtgaaggtggtttaaaacaatcaacacttgcagtagttaatgataaaggttcaggtaat
gcaccaggtggtggagtacaagaagtaattgaaaaagctgatggctctttacatgctcca
caaggcagaaatgtagtggtttcattagatcctggcgataaagttcataatgctacagat
actaaacgctatcaagatatgggtgtgcttccaaagttcagcactggaactaagaaaaag
aaaaaagatgaccctctagaatatcttaaagaagcagctggtggagtaattaaagggaca
ggaaagaaaatatctgacggttaccatagtaccaaagaagcatcaaaagatgcctttgac
actataaaaaaaggcggaagtaaagtattagaaaaaggcaaagatgctgctagttggcta
ggcgataagattggtgatgcttggcactacgttaagaaccctggaaaattagtagaaaag
atgattggacatattagttttggtaaagaaaacaaaactatggagatggcaggattagca
tttaaacaccttaaaaaatcattagtagaaaaagtgaagtcatggtttgaagaggcagaa
ggtggcgatggagatgctgcttggttactaaaacaccatattctacaaacattcggacat
tatacaggtggacttatgtttaatggtggacgacactacggtattgactttggtatgcca
acaggtacaaaaataagagccttaacagcgggtaagatatcacaagcaggaccagttgca
ggcggcggtggtaatcaaattacacttgatgagcctggtggtaagtggttccagtggtac
atgcatatgagtaaaatcattgctaaaaaaggtcaaagagtaagtgcaggtgatgtaatc
ggtttatctggtaacactggtaattcaacaacacctcacttacacatacaacgtatgaaa
ggatacccatctaatgacactgctgttgacccaatgaaatggttgaagtctcttaaaggc
tcaagccaaaacaaaaaagcatctgcttggtcggacgacattaaaagagctgctaagcga
atgaatgtcacactgcaaggaaatgatttgaaaaatattatctctcttattcatcatgaa
tcaggaggtaatgctggtgttacacaaggcaatattggagatattaataatcttcttggt
actccagcacaaggtttacttcagtatgtaccaagtacttttaagtcatacgctatgaaa
ggtcatactaatattaaatctggttatgatcaattgcttgctttctttaacaataaatat
tggcgttctcaatttaatccgttgggaggctggtctccatcgggaccaagaaaatatgaa
aatggtggtatggttactaaacaccaaatagctgaaatcggtgaaggtaacaaagcagaa
atggtcatacctttaactaaacgtaacagagcagttcaacttattgaacaagcaatgaaa
tatgttggtatggatactggcaacacaaacgttacagttaataatgataattcaactgtt
gagaaattattaaaacaacttgttagagtgaatgaccaaaataataaacttacacaaaca
attattagtttattaagtaaccaaaagcaagggtctcctaaagatgcagcaaacattatt
tcacaaatattaggagagaatatgcgcatggctagttatagtcaaggaggttaa
DBGET
integrated database retrieval system
