Stanieria sp. NIES-3757: STA3757_39340
Help
Entry
STA3757_39340 CDS
T05130
Name
(GenBank) hypothetical protein
KO
K09800
translocation and assembly module TamB
Organism
stan
Stanieria sp. NIES-3757
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
stan00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
stan02000
]
STA3757_39340
Transporters [BR:
stan02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
STA3757_39340
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TamB
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BAU66529
LinkDB
All DBs
Position
complement(4302278..4307782)
Genome browser
AA seq
1834 aa
AA seq
DB search
MTNFLQNRPPDPSPKPSGFWRRLLEQIKHPSQITIIGFSTLVLGGLGYWGTQVLVKQKLP
PFLEKQISNIINRPIDLGEVTSFSLTGIEFDSATIPPTKTDPDQVAIDEVKVGFNILPLI
FQRTLPLEITLVQPEIYLEQAKDDSWLNLDLQTKEGEPSIYVDLTVNVEAGNITAVPYNQ
SPIQVQLDGSGRYDPTGEQLIEYDLDAAIEQAQAKIKGETIIASGQTNTKLQINDLVLTD
VTSLIPNSPINLSSGKLNADLDINIPSLEEITAANIQGQVNLQNVQGEVENLSSSLEAKS
QLNFGGKNAQVEDTQVNLGNLTANLKGTVDLQQGYNLNIDILPFSLSGLQKTFNTFSPVN
LAGEVAAQLQLSGAIKEPLLTGTINNTKTLTVAQTQLKSVKANFAANLSEVVLKDLKAIP
LAGGQIQGQGIIETKIKQSLEENRVIDAANMPLAFNFKATLPTEKIVAPYYSFPQEIAVN
TFNTEGKIRGTLANPQANLQWQIPQASTTAVDNLSGSGKILFSDNQLLLNDTEILVGKGR
LNLEGNANLNNQQWQTNIQASALALTPFLAQLNTSAVNFDQPITLSKGTIDLKGKLDQLA
PNKITGIANLNLDVNGSEVNLDSRLASGNFQATANTDRIALNQFVPSLPLTTTLESSRIN
LSGQLQQLLTFTENRNLNTIKADFDSNLAVANGTINAQGNLNNNQWQTNIDANNLNTNLL
AQTFTPQNLQNLNLDNLNGQIKLTGSLNPVLNNQVNLPIQANQIALQLGEQYLNAQGDLI
VSNLTTNPDLAKVNLNVNANVNFEQLPIAQLIAQTSNNNNLLAERVNLYGQANFQGQFIG
SNLISAPTNPENLNLIGDLRLNNFAFNDVVFDPTMTGQVNINPTTELAVNLRGEQDVIAA
TAEPCTANRCRFPYLPTSLELRQGEDTSQPVIAIGNRQGDVFSLDIQNFPLAVLNLAPGK
PLGIQGALDGQTTGEINANLFTLATTGNVTVEQPAVGYIQAKKFAANFNYNPEQNLAEVA
TSSLEFGNSKYNFNGGVNLATGQLQGKLSIPQAYIQDILTTFRWFTLEDLTRLFQTPNYA
QADQVAPNNIETASESLVRKLILLRTIENQIQAEAAAKQAGEVPTDIDIRGAYQGEIFLA
GTVTNPQVNFNVEAQNWEWQPQPAFANIVPSLGFIKEEIQRIAINQILIQGVYQNNTVNL
DNARIQIEDAVVALQGQLPRGVQAPPLNGGDSPSPTQPENVNFQIENLSLDTISRFINIP
VDVAGVISTNGTITGTLSQPQLEGNVTFSDGAYNGQALPNTIAGNYIYTDDKLQFATTEP
SSIQVDATVPYPIRPGNDTVTANLDLGTEAFSLLSIFTQDNLTWLGGEGTAQLRATGRLD
LNRATPLYALNATGEVNLQDAQVKSKYFSEPLITTGTATLNNQLINVEQLTGKFADKDLT
ATGTLPILYPVATIENPLTINIPEGKINLEELYEGDVAGNVIVTGAALQPVIGGEVFLKD
GEVVIPEQEDNSSTVANNINLITSTNADSSTIITRLNDFQVNLDNFKIEQSPLYQFNVRG
NLTLNGTANTPSNIRPQGTIFITRGDVDWLSSNFTLVRSRENTAVFTPEAGLLNPYLDVQ
MRTEVSNLNNVRQLESDSNEISDDISQVGRNNIINVNLVIDGEAEELLPNLGQTASNCNI
RPDNAPPSGQANYSQKELNQLATCVNVAALNGADNRNLLNSPALQLTSIPSRSQGEIVSL
LGNQFLSFAEELQNSSAEELFNLGVAQFVITPLQRRLFYGVEDFVVGVGKNIGLDYLRVY
PYLEGIYEIKQDASVRATYDYVLNEGRIEYQIRF
NT seq
5505 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgacaaattttttacaaaatcgccccccagatccttctcctaagccttctggtttttgg
cggaggttgttagaacaaattaagcatccttcccaaataacaattattggtttttctact
ttagttttgggtggtttaggttattggggaactcaagttttagttaaacaaaagttacct
ccttttttagaaaaacaaattagcaatatcattaatcgtccgattgatttaggagaagtt
actagtttttctttgacaggaattgagtttgattctgccactattcctccaaccaaaaca
gatccagaccaagttgccattgatgaagttaaagttggttttaatattttaccgcttatt
tttcagcgcactttacctttagaaattactttagttcaaccagaaatttatttagaacaa
gctaaagacgattcgtggttgaatttagacttacaaacgaaagaaggagaaccttctatt
tatgtagatttgacagtaaatgttgaagcaggaaatattactgctgttccttataatcaa
tcccctattcaagtacaattggacggtagtggtaggtatgatcctactggagagcaatta
atagaatatgatttagatgcagctatagaacaagctcaagctaaaattaaaggagaaaca
ataattgcatctggtcaaactaatactaagctacaaattaatgatttagtattaactgat
gttacttctttaattcctaattcacccatcaatcttagtagtggtaaacttaacgctgat
ttagatattaatattccttccttagaagaaattactgctgcaaatattcaaggacaagtt
aacttacaaaatgttcaaggtgaagtagaaaatttatcttcttctttagaagcaaaatct
caattaaattttggcggtaaaaatgcccaagtagaagatactcaagtaaatctaggcaat
cttactgctaacttaaaaggaacagtggatttacaacagggctataacctaaatattgat
attttgccctttagcttatcaggtttacagaaaacttttaatactttttctcctgttaat
cttgcgggggaagtcgcagcacaattacaactatcaggtgcaatcaaagagccactacta
acaggaacaattaataatactaaaactttaactgtagctcaaacacaattaaaatcagtt
aaagctaattttgctgccaatttaagtgaagttgttctaaaagatttaaaagctattccc
ttagctggaggacaaattcaaggacaaggaattatcgaaactaaaattaaacaatctctt
gaagaaaatagagttatagatgctgcaaatatgcccttggcatttaattttaaagctact
ttacccacagaaaaaatagtagctccttattatagttttcctcaagagatagctgttaat
actttcaatacagaaggaaaaattagaggtacattagctaatcctcaagccaatttacaa
tggcaaattcctcaagcttcaaccacagcagtagataatctttctggttcaggaaaaatt
ttattttctgataatcaattattacttaatgatactgaaattctagtagggaaaggtcga
ttaaatcttgaaggaaatgctaatttaaataatcaacaatggcaaactaatattcaagct
tctgctttagctttaactccatttttagctcaattaaacacttcagcagttaattttgac
caaccaattaccttatcaaaaggcacaattgatttaaagggaaaattagaccaattagct
ccaaataaaattacaggaatagctaatttaaatttagatgtcaatggcagcgaggttaat
cttgatagtagactcgcttcgggtaacttccaagcaactgctaacaccgatagaattgca
cttaatcaatttgtacccagtttacctctaactactaccttagaatctagtaggattaat
ctttcagggcaattacaacagttattaacttttactgagaatcgtaatttaaatactatt
aaagccgattttgattcaaatttggctgtagctaatggcacaattaacgctcaaggaaat
ttgaataataatcaatggcaaactaatattgatgctaataaccttaacactaatttacta
gcacaaacatttactcctcaaaatcttcaaaacttaaatttagataatctaaacgggcaa
attaagttgacaggcagcctcaatcctgtgcttaacaatcaagtcaatcttcccattcaa
gctaatcaaattgctttacaactaggagaacaatatcttaatgctcaaggagatttaatt
gtatctaatttaactactaatcccgatctagctaaggttaatttaaatgttaatgctaat
gttaattttgaacaattaccgatcgctcaattaattgctcaaacttctaataacaataat
ttattagcagaaagagttaatctttatggacaagcaaattttcaaggacaattcattggc
agcaatttaatttctgcaccgactaatccagaaaatttaaacttaattggtgatttaaga
ttaaataattttgcttttaatgatgtagtatttgacccaactatgacaggtcaagtaaat
attaatccaactacagaattagcagttaatttaagaggagaacaggatgtaattgctgct
acagcagaaccttgtacagcaaatcgatgtcgttttccctacttaccaaccagtttagaa
ttacgtcaaggcgaagatacttctcaaccagttattgccatcggaaatcggcaaggagat
gttttttcgttagatattcaaaactttcctttagcagtgcttaatcttgccccaggaaaa
cctttaggaattcaaggtgcattagatggtcaaactacaggagaaataaatgctaatctt
tttactttagcaactacaggaaatgtcaccgtagaacaaccagcagttggttatattcaa
gctaaaaaatttgctgccaatttcaactataatcccgaacaaaatttagctgaagtagca
actagttctcttgagtttggtaatagtaaatataactttaatggtggagttaatttagca
acaggacaactccaaggaaaactaagtattcctcaagcttatatccaagatattttaacg
acatttcgttggtttactttagaagacttaactagattatttcaaactcctaattacgcc
caagctgaccaagttgctcctaataatatcgaaaccgcctcagaatctctagtcagaaaa
ttaatattattaagaacaatagaaaaccaaattcaagctgaggcagcagcaaaacaagca
ggagaagttcccacagatattgatattcgtggtgcttatcaaggagaaatttttttagca
ggaacggttactaatcctcaagtaaattttaatgtagaagctcagaattgggaatggcaa
cctcaacctgcttttgctaatattgtgccatctttaggttttattaaagaagaaattcag
cgtattgccattaatcaaattttgatccaaggagtttatcaaaataatactgttaattta
gataatgccagaattcaaattgaagatgcagttgtagcactacaagggcaattaccacgg
ggcgtacaagctccgccgttgaatggcggagacagcccctcacccactcaaccagaaaat
gttaattttcaaatagaaaatctttcccttgatacgattagtagatttatcaatattcct
gtagatgtagcaggagtaattagtaccaatggcacaattacaggtactttatctcaacct
caattagaaggaaatgttactttttcggatggtgcatacaacggacaagcactaccaaac
acaattgcaggcaattatatttacactgatgataagttacaattcgccactactgaacca
tcttcaattcaagtagatgccactgttccttaccctattagaccaggaaacgatactgtt
acagctaatttagatttgggtacagaagctttttcattattaagtatttttactcaagat
aatctgacttggcttggtggagaaggaactgctcaactaagggcgacaggacgtttagat
ttaaatcgcgcaacaccactttatgctctaaatgctacaggagaagttaacttacaagac
gctcaagtcaaaagcaaatatttctctgaacctttaattacaacaggaacagctacttta
aataatcaactaattaatgttgaacaattaacaggaaaatttgctgataaagatcttacc
gccacaggaactttaccaattttatatcctgttgcaactattgagaatcctttaactatc
aatattcccgaaggcaaaattaatctagaagaactttatgagggagatgtagcaggaaat
gtaattgtaacgggtgcagcacttcaacctgtgattggtggagaagtatttttaaaagat
ggtgaagttgttattccagaacaagaagataatagctcaactgtagccaacaatattaat
ttaattaccagcactaatgctgattcttccacaattattaccagactcaacgattttcaa
gtaaatttagacaattttaagatcgaacaatctcctctataccaatttaatgttcgagga
aatttaactcttaacggaactgccaatactcctagtaatattcgaccacaaggaactatt
tttataactagaggagatgtagattggctttctagtaactttactttagttcgcagtcgc
gaaaatactgccgtgtttactcccgaagcaggattattaaatccctatctcgatgtgcaa
atgagaacagaagtttctaatttgaataacgtgcgacaattagaatcagatagtaatgaa
atttctgatgatatttctcaggtaggaagaaataacattattaacgttaatttagtaatt
gatggtgaagcagaagagttactgccaaatctgggtcaaaccgctagtaattgcaatatt
cgtcctgataatgctcctcctagtggacaggcaaactatagtcaaaaagaattaaatcaa
ttagccacttgtgttaacgtcgctgccttaaacggagcagataaccgcaatttactcaat
tctcctgccctccaacttacgagtattccttcgcgcagtcaaggagaaattgtcagtttg
ttaggtaatcaatttttatcctttgccgaggaacttcaaaatagtagcgcagaagaatta
ttcaatcttggcgtagctcagtttgtaattactccccttcaacgccgactgttttatgga
gtggaagattttgtcgtcggtgttggtaaaaacattggtttagattatctgcgggtctat
ccttatttagaaggtatttatgaaattaaacaagatgcttcggtcagagcaacttatgat
tatgttttgaatgaaggcagaatagagtatcaaataagattttga
DBGET
integrated database retrieval system