Streptococcus parauberis: STP_1375
Help
Entry
STP_1375 CDS
T01504
Name
(GenBank) SWF/SNF family helicase
Organism
stk
Streptococcus parauberis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SNF2-rel_dom
SNF2_assoc
Helicase_C
ResIII
SWIM
Taeniidae_ag
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AEF25823
LinkDB
All DBs
Position
complement(1523158..1526253)
Genome browser
AA seq
1031 aa
AA seq
DB search
MARLIPGRIRNQGIALYDQGLVKIVKEEKSQIEAQVDCQKVTYGVDDDAITCQCDFFARK
KYCQHIAALEYFLKNDPNGKVISEQFTNQSESKEETKKMTSFGSLFLDNLKMNEDDTTVY
RLSATGSRSPYSSEFWWSLKINRLPDDRTYVIRDIRGFINLIKREGFYQIGKNYYEQLSL
LKFDQASQDLISFLWRLAPDSDKSDHSFVFPNHARHLHLPSGFFEEGIFLLRDLYEFTFE
GAYQNYSTVFVKPLDAEAELFKFTIEVHRKSIELKISEKSVSYLFDNVYLLHNDTFYYNT
LRQQKMISALRSLPIESDLQKHIYFDLDDQAKLAASLLDFKEIGLVKAPKSFDIRDFDVT
FNFDTNKNQILLELVFDYGDLRVSDKMTLDQLPFASNYKKEEKIYRAMSFYDFSPQFQSI
KEIESPHDLYRFFTQALPYFNKLGKVNLSESVSQLRFSEAPQIVIERQQGGLLDVSFDFS
QILENDIDDALTALFTNSPYFVTESGKLVVFDDQTQKISQSLLKLRAQQKENGHLQLDGI
AAVQLSQLFEGQENVHFSQELEELISDLRHPERLVLPDLAVNASIRDYQFQGIKWMTMLD
KYGFGGILADDMGLGKTLQTIAFLKSKLSTGKKVLILSPSSLLYNWLDEFEKFVPDLDVV
VSYGHKQVRDQLISEEHQVTITSYSSFRQDFTSYKNYNYDYLILDEAQVIKNSQTKIAKS
LREFNVSNCFALSGTPIENKLLEIWSIFQIVLPGLLPNKKDFLKMDAKQVSRYIKPFVMR
RRKDDVLPELPELIEMNYQNEMSDQQKAIYLAQLRQMQDRIRNSSDADINRRKIEILSGI
TRLRQICDTPSLFMDYDGDSGKLDSLKTLLVQIKENGHRALIFSQFRGMLDIAEKEMEAL
GLTHYKITGSTPANDRQEMTRAFNNGSKDAFLISLKAGGVGLNLTGADTVVLIDLWWNPA
VEMQAISRAHRLGQKENVEVFRLITRGTIEEKILEMQEGKRNLVTTVLDGNESRASMTIE
EIKEILGLDSY
NT seq
3096 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcgagattaattccaggaagaattagaaatcaaggaatagccttgtatgatcaagga
ttagttaaaattgttaaagaagaaaaaagccaaattgaggcacaagttgattgtcaaaaa
gttacctatggagtagatgatgatgccataacctgtcaatgtgatttttttgcgcggaaa
aaatattgccagcatattgctgctctggaatattttttgaaaaatgatccaaacgggaaa
gttatttctgagcaatttaccaaccagtctgaatcaaaagaagaaaccaaaaaaatgaca
tcctttggtagtctatttttagataatttaaaaatgaatgaggatgataccacagtctac
cgactatcggcaaccggtagtcgtagtccttattcttcagaattttggtggagtttaaag
attaatcgacttcctgatgatcggacttatgtcatcagagatatccgaggatttattaac
ttaatcaaaagagaaggtttttatcagattggaaaaaactattatgaacaattatcactc
ttgaaattcgatcaagctagccaagatttaatctcatttttatggcgactagctcctgac
tctgataaaagtgatcatagttttgtttttccaaatcacgccagacatttacatctacca
agtggcttttttgaagagggcatatttttactgagagatttatatgaattcacttttgaa
ggggcatatcagaactattcaactgtttttgttaaaccactagacgcagaggctgaattg
tttaaatttacaattgaagttcatcgtaaatcaattgaattaaaaatcagtgaaaagtca
gttagttatttatttgataatgtctacctattacataatgacaccttctattacaatact
ttaagacaacagaaaatgatttctgctctacgcagtctaccaattgaatcagatttgcaa
aagcatatttactttgatttagatgaccaagctaaattggctgcaagtcttttagatttc
aaagagattggtctagtaaaggcacctaaaagttttgacattagagattttgatgttact
tttaactttgataccaacaaaaatcaaattttgcttgaactagtctttgattatggtgat
ttgcgggtctctgataagatgacattagatcaattgccttttgcaagtaactataaaaaa
gaagaaaaaatatacagagcaatgagcttctatgatttttctcctcagtttcagtccata
aaagaaattgaatcaccacatgacttatatcgatttttcactcaagctcttccttatttt
aataaattaggtaaagttaatttatctgaatctgttagtcaattgagattctcagaagca
ccacaaattgttattgaaagacaacaaggcggtttattagatgtctcatttgatttttct
caaattcttgaaaatgatattgatgatgctttgacggcattatttaccaatagtccatat
tttgtaactgaaagtggtaaattagttgtttttgatgatcagactcaaaaaatcagtcaa
tcattgcttaaactacgggcacaacaaaaagaaaatggccacctacaattagacggaatt
gcggcagttcaattatcacaactttttgaagggcaagaaaacgtccatttttctcaagaa
ttggaagagttaatttctgacttgagacatccagagcgtttagttttacctgacttagct
gtgaatgcttcaattagggattaccaatttcaaggaataaaatggatgacgatgcttgat
aagtatggttttggtggcattctagcagatgatatgggattgggtaaaacccttcaaaca
attgcttttttaaaaagtaagttatctactggcaaaaaggttctgattctatcaccttca
agtttactctataattggttagatgaatttgaaaaatttgtgcctgatttagatgttgtt
gtctcttatgggcataaacaagtcagagaccaacttatttcagaagaacaccaagttact
attacctcatactcatctttcagacaggactttacaagctacaaaaattataactatgat
tacttgattcttgatgaagcacaagttataaagaactcccagactaagattgctaaaagt
ttacgggaatttaatgttagtaattgctttgccttatctgggacaccaattgaaaataaa
cttcttgaaatttggtctatctttcaaattgtcctaccgggattgcttcccaataaaaaa
gactttttaaaaatggatgctaagcaggtgtcacgttatattaagccatttgttatgcgt
cgtcgtaaggatgatgtattacctgaattaccagaactaatcgaaatgaactaccaaaac
gaaatgtcagatcagcaaaaggcaatttacttagctcagttacgtcaaatgcaagacagg
attcgaaattctagtgatgctgatattaatcgtcgtaaaatcgaaattttgtcaggtatt
acgagattgagacaaatttgtgatacaccaagtttatttatggattatgatggagatagt
ggtaaattagatagtttaaaaaccctacttgttcaaatcaaagaaaatggacatcgtgca
ctgattttttcacaattccgtggaatgttagatattgctgaaaaagaaatggaagcttta
ggtttgacccattataaaatcaccggttcaactccggctaatgatcgccaggagatgacc
agagcatttaataatggctcaaaagatgccttcctaatttcccttaaagcaggtggtgtc
ggattgaatttgactggggctgatactgttgttctaattgatttatggtggaatcctgct
gtcgaaatgcaagctattagccgagctcatcgacttggccaaaaagaaaatgtggaagtc
tttcgtttaatcaccagaggaaccattgaagaaaaaattctggaaatgcaagaaggaaaa
cggaatttagtaacaacagttcttgacggtaatgaaagtagagctagcatgaccattgag
gaaattaaagaaattttaggtctcgatagttattga
DBGET
integrated database retrieval system
