Sphaerospermopsis torques-reginae: K2F26_05300
Help
Entry
K2F26_05300 CDS
T09782
Name
(GenBank) translocation/assembly module TamB domain-containing protein
KO
K09800
translocation and assembly module TamB
Organism
stoq
Sphaerospermopsis torques-reginae
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
stoq00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
stoq02000
]
K2F26_05300
Transporters [BR:
stoq02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
K2F26_05300
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TamB
YhdP
Adeno_PVIII
DUF4929
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QYX32776
LinkDB
All DBs
Position
1134616..1140105
Genome browser
AA seq
1829 aa
AA seq
DB search
MSNTSKQDQETPTASRKRLWLMILSRGSMALGALLLMVIIGGIWRLREFIQKDLAPLAQQ
NLTNTLNRPVELGKVKEFSLTGVRFAASAIPATPTDTDRVTIEAVDVGFDPWQLVINRQL
KLDVTLINPDIYIQQDNQGRWITTTIAPPGKPGLIKTDLDKLRVRNARLILVGNQKTESP
VPSHQSLIPVTFSGLYGTAQLIENNRLIKFDVAGKPKNGGNIFLQGNLRAQANLEGNLRV
KTQDLLAADITRLIQLPINLQAGRVNGDLQIQLIPNQQTLLDGTAALQAVTLQIPQVPQL
LSNTQGNVKFQGLAIELDNVVSNYGKIPLTAKGVIDREKGFNLSGSVNAVSVSNALETLK
VQSPFPVSGVVKADLQILGNIDEPVLSGTVANIKTAKIDQVDFEKVSSKFELSTRDAVLT
FKDIQGQTKLGGEVSGAGKISLGKVPQINVNLTAKNVPGDAIAKLYNDHINSTFKIGTVS
ATANLIGTANNIQTFVKWQAPQATYAATGETIINPNRTVDFRNVAVNIAGNIIRVYGNYN
PQSWQAVAQASGVKLTPFLNSQQLENISLNNAAFNGKLVISGTSENFKITNIRPEDANIN
IAGGKVAISRFQLEDKNFIADLIAQNVRLGTILKQSAPIFNNPIAGKFTIAGNTENFNFN
NFGAIGEGSLKVNNGTITAKNIQVSNGRYKAQVAVKNVPVQRLANVPPQIQGALVGEFNV
AGNVASFQPETIQANGQAKLNLAGGTVTASNIQLANGHYQTLVNSYGVQLKRLNQQLSGK
FAGQLKVAGIVGSAKLANIRATGQVQFSRGIPGINSPLNAVVSWNGQQLTIPQARTPNLT
ASGYILADAKQPGIPEITQLNLNVQTQNYDLKQLPLQLPNAVNVGGKADFTGQITGKITA
PNVIGSLGLRNLQVQSKIQKFAFEPLLTGNINLVQGRGLSLDVAGKRDRLAAKLNANNQP
NAFLVQWQQALVTGQSQGENWAVKVNNFPLQVLNLNLNLNLPNNPILGQGALAGLLTGDL
QINQKTLATRGNIAIAKPQLGRIKGDRFTTEFQYNNNLTTLTNSEFINAQSRYLFDANLK
QTPQGPQVQAKININQGKIQDLLTVAQIFEIQDLQRGLTPPTYGTAADLTTNPRGLANQT
LFNQIQRLAEIDALLAAEEQKRLESKPIPDLKDLKGTFNGEIAINTATKNGLTAQFDLQG
QNFTWGRETEPNRFYRAEKVIAKGAFEKGVLRLQPLSIEAKDRLIAFIGNVGGEEQSGKL
TVEKFPIQLLNNFVKIPVGISGNLNIDAAIAGSIANPQARGELKITEGTLNQKPIQSANA
GFSYADGRLKFGSQVIAVGNEPVNITGDIPYKLPFASVTPDNNQITLDVKVKDEGLGLLN
LFTNQITFESGKGEVDLTVRGNRKQPSVKGTASLNNATFAAQALQGKLTNVSGKAEFDFN
KVVVENLQGQFSNGKIEATGEIPIFNSQNIQIDKPLSVKLEQLVLNLKGLYQGGASGNLE
ITGSVLQPAIGGEIELSNGQVLLTESDTKTLSQTGSDLSIFAASKQNKTSDVESGITRLN
NLQIKLGNSVEIARPPVFNFLATGDLNVSGTLNNPIPAGTIRLTKGGVNLFTTQFNLARN
YKHTATFRTSDPRDPELDIKMFAKVLDGIQTIDLSRQVSTGLSELETVRVEAIVKGPASQ
LNENLELKSSPSRSQTEIVTLLGGGFVDTQGRGDTTLGLINIAGSAVFNNFQAAFSQIGD
AFGLSELRIFPTILSDRPEAGKSNSTIELALEAGVDISSKFSFSTIKILTASDPFQWGIN
YRINDDFRVRASTNFTDDSRAIIEFERRF
NT seq
5490 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtctaacacttccaaacaagatcaagaaaccccaaccgcaagccgcaaacgcttatgg
ttgatgatattgagtcgtggtagcatggctttaggcgcgttgttgctaatggtaatcatc
ggtggtatttggcggttaagagaatttatccaaaaagatttagcacccctagcacaacaa
aatcttaccaataccctcaaccgtccagttgaactgggaaaagtcaaagaattttccctg
acaggagtcaggtttgctgcttcagctatccctgcaacacccacggatacagatcgggtg
acaatagaagcggtagacgttggttttgatccttggcagttagttattaaccgccaatta
aaattagatgttactttaattaacccagatatttatattcaacaggataaccaaggacgc
tggatcactaccactatcgccccaccaggaaaaccaggactgattaaaaccgatttagat
aaactgcgcgttcgcaacgccaggttaatattagtaggaaaccagaaaacggagtcacca
gtccccagtcaccagtctctaatacctgtaacattttcaggtttatatggaactgcccaa
ttgatagaaaataaccgactaattaaatttgacgtagccggaaaaccaaagaacggaggt
aatattttcctgcaaggaaatctccgcgcccaggcaaatttagaaggtaatttaagggta
aaaacgcaagatttattagccgcagatattactcgtttgattcaattaccaataaattta
caagctggtcgggtaaatggtgatttacaaattcaattaataccaaatcaacaaacttta
ttagatggtactgctgctttacaagctgtaactctacaaattccccaagtcccacaacta
ttaagtaatactcagggaaatgtcaagtttcaaggattagctatagagttagataatgta
gttagtaattatgggaaaattccccttactgctaaaggtgtgattgaccgagaaaaaggc
tttaatttatcaggaagtgtcaatgctgtaagtgtgtcaaatgccttagaaactctgaaa
gtgcaatcacctttccctgtgagtggggtggtaaaagccgatttacagatattaggcaat
attgacgaacctgtgctttcaggaactgtggctaatatcaaaactgccaaaattgatcaa
gttgattttgagaaagttagtagtaaatttgagctttcaactcgtgatgctgtgctgact
ttcaaggatattcaaggacaaacaaaattaggtggtgaagttagcggggcaggaaaaatt
tccctggggaaagtaccgcaaattaatgttaatttaactgctaaaaatgttccaggggat
gcgatcgctaaactttataatgatcatattaactctacattcaaaattggcactgtttca
gctacagctaacctcattggtacagctaacaatatccaaactttcgtaaaatggcaagct
ccccaagccacttatgctgctactggtgaaacaattatcaacccaaatcgtacagttgat
tttcgtaatgtcgctgttaatattgctggtaatataatccgggtttatggtaattataat
cctcaaagttggcaagctgttgctcaagcttcgggtgtgaaattaaccccatttctcaac
tcacaacaattagaaaatatctctttaaataacgcagcatttaacggtaaattagtcatc
tcaggaacttctgaaaactttaaaattactaatattcgtccagaagatgcaaatattaat
attgctggcggtaaagttgcgatttctcgttttcagttagaagataaaaactttattgct
gacttgatagctcaaaatgtgcgtttagggacaatcttaaaacaatctgccccaattttc
aataatcccattgccgggaaatttactattgcaggtaataccgaaaatttcaacttcaat
aatttcggtgctattggtgaaggtagtttaaaagttaataatggcacaattacagctaaa
aatattcaagttagtaatggtcgctacaaggcgcaagttgcagttaaaaatgtacctgtg
cagagattagcaaatgttccacctcaaatacaaggtgcgttagttggtgagtttaatgtt
gctggtaatgttgcatcttttcaaccggaaactattcaagcaaatggtcaagcaaagtta
aatcttgctgggggaacagttacagcttctaatattcaacttgctaatggtcattaccaa
acattagttaatagttatggtgtacaattaaaacgtttaaatcaacaattatcaggtaaa
tttgcaggtcagttaaaagttgctggtattgttgggtctgcgaaattagctaatattcgt
gctactggtcaagtgcagtttagtcgaggtattccgggaattaattctcctttaaatgct
gtagtttcttggaatggtcaacaattaactattccccaagcaagaactccaaatttaacc
gccagtggttatattttagccgatgctaaacaaccaggtataccagaaattactcaatta
aatctcaatgttcaaacgcaaaattatgacctcaaacaattacctttgcaattacctaat
gctgtaaatgtaggcggaaaagccgattttacaggacaaattaccgggaaaatcacagca
ccgaatgttattggatctttgggtttgcgaaatttgcaagtgcaaagcaaaatacaaaag
tttgcctttgaaccattattaactggtaacattaatttagtgcaaggaaggggtttaagt
ttagatgttgctggtaaaagagacagactagcagctaaattaaatgctaataatcaacct
aacgcttttttagtacagtggcaacaagcattagttacaggtcaatctcaaggcgaaaat
tgggcagttaaagttaataattttcccttacaagtgttaaatttaaacttaaatttaaac
ttacctaataatccgattttgggacaaggtgcattagctggtttgttaacgggagattta
caaataaatcaaaaaacattagcaacgcggggaaatattgcgatcgccaaaccgcaactt
ggtagaattaaaggcgatcgcttcaccaccgaatttcaatacaacaataatttaaccacc
ttaacaaacagcgaatttatcaacgctcaaagtcgctacctgtttgacgctaacctcaaa
caaactcctcaaggtccccaagtacaagccaaaattaacatcaaccaaggcaaaattcaa
gatttactcaccgttgcccaaatatttgaaatccaagatttacaaagaggtttaacacct
ccaacctacggtacagcagcagatttaaccaccaacccgcgaggtttagcaaatcaaact
ttattcaatcaaattcaacgtttagcagaaattgatgcactcctagcagcagaagaacaa
aaacggctagaatcaaaacccataccagatttaaaagacttaaaaggaacttttaacgga
gaaattgccatcaacaccgctacaaaaaacggactaacagcacaatttgacttacaagga
caaaactttacttggggtcgagaaacagaacctaatcggttttatcgtgccgaaaaagtc
attgctaaaggtgcttttgaaaaaggtgttttgcggttacaacctttgagcatcgaagcg
aaagatagactcatagcctttataggtaatgttggtggtgaagaacaatcaggaaaatta
acagtcgaaaaattcccaattcaactattaaataactttgtcaaaatcccagtaggaatt
agtggtaatctcaacattgatgctgctatagctggtagtatagccaacccccaagctaga
ggagaattaaaaatcacagaaggaacactcaatcaaaaaccaatacagtcagccaacgca
ggttttagttatgctgatggacgtttgaaatttggtagtcaagtcatagcagtaggaaac
gaaccagttaacattactggtgatattccctataaattaccatttgcatcagtaacacca
gacaacaatcaaattaccctagatgtcaaagtcaaagatgaaggtttaggattattaaat
ctgttcactaatcaaataacatttgaaagcggtaagggagaagtagatttaactgtgagg
ggaaacagaaaacaaccatcagttaaaggtactgcctctcttaataacgccacatttgca
gcccaagctttacaaggtaaactaaccaatgtgtctggaaaagccgaatttgattttaat
aaagtagtagtagaaaacctccaagggcagtttagcaatggtaaaatagaagccacagga
gaaataccaattttcaacagtcaaaacatccaaatagataaaccattgagtgtgaaacta
gaacaattagtattaaatctcaagggattatatcaaggtggtgcaagtggtaatttagaa
attacaggttcagtattacaaccagcaattggtggtgagatagaattatccaatggtcaa
gttttactaacagaatctgatacaaaaaccttatctcaaacaggttctgatttatcaatt
tttgcagccagtaaacaaaacaaaaccagtgatgttgaaagcggaataaccagattaaat
aatttgcaaatcaagctaggaaacagtgtagaaatagctcgtccacctgttttcaacttc
ctcgcaactggtgatttaaatgtgagtggtactttaaataatcctatacccgctggaact
atcagattaaccaaaggtggcgtaaatttgtttaccacccaattcaatttagctcgtaac
tataaacatactgcaacttttagaacttctgatcctcgtgatcctgagttagatattaaa
atgtttgctaaagtattagatggaatccaaacaattgatctcagcagacaagtttctaca
gggttatcagaattagaaaccgtccgcgtcgaagcaatagttaaaggtcccgctagtcaa
ctaaatgagaatttagaattgaaaagtagtccctcacgttcacaaacagaaattgttact
ttgttaggaggtgggtttgtagacacccaaggacgtggtgacacaacattgggtttaatt
aatattgctggttcggctgtttttaataactttcaagctgcatttagccaaattggtgat
gcttttggtttaagtgaactgcggatatttcctaccattctttctgatagacccgaagca
ggtaaaagcaactcgactatagaattagcattagaagccggtgtggatatttctagtaaa
ttttctttttctacgatcaaaattttaaccgctagtgaccccttccaatggggtattaat
tacagaattaatgacgattttcgggttcgtgcttccacaaatttcactgatgatagtcgg
gcgatcattgagtttgaaagaagattttag
DBGET
integrated database retrieval system