Sphaerodactylus townsendi (Townsend's least gecko): 125432313
Help
Entry
125432313 CDS
T08213
Name
(RefSeq) hornerin-like
Organism
stow
Sphaerodactylus townsendi (Townsend's least gecko)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Reeler
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
125432313
NCBI-ProteinID:
XP_048351690
LinkDB
All DBs
Position
LG05:complement(38938321..39032803)
Genome browser
AA seq
1123 aa
AA seq
DB search
MKHILFFSFLLCGVFVTRVCCLPYGNISLACESMLPNHSVEPQESESPYHISVSSDEYDP
GKEVKVKIEGTPDVGFKWFMLQARDIEENIPVGSFQITDPNTQSLDCYNLSNSALIQTNL
DTKQDVTAHWVSPDAKTIQFIATIFQDPETYWVVVPSVVLFPRNFSEAEDDSKIVGESQS
AQVSPKSRKKSAGITLRINCGQGGSYASSSECTKIYQGSSSGSYSGRQDGSVYQGGIKKG
GCAGGGVSSVYSKYGCRDGGTAYSSSSYGQSVSTVSDTKKTFQHPPSNPYPPERTSITAQ
LANSHYKHIQSTQYGSKVQSQGSQPQSGIRITIQSGPGVRFCDKTSSSYNSQACKQSMQS
STSQSSSYGSQQGGSSNSIGGGRGTANYGGSSGSSNYGGSTGSSNYGGSSGSSNYGGSSG
SSNYGGNSGSSKYGSGKPCGQGYTYDSNPCNQQGGSSQQNYGSSQGGSTSQQSYGGRPGG
SSSQQNYGSSQSGSPYQPSYGAGQGGSYGSNQGGSSGQQGYGSNQSRPPSQQGYGSNQGS
SSSQGNRNPCDGSSYSGTGYSSSNCPQGGSSQQRFGSNQGGSSQQQFGSNQQGSQTYGGR
GRYNSNDCDVGDAKSYGEKALSSANCRGKRSIDTPATSKDFITKIKQAAAHALVRKTRSK
KIRTLVRKARSEKTETATSESNNNDQDGSFMVSAYRQGQCVCPGAQGSFSYKSRNRREAS
SSYGSSSYGQGSSSTYGSSGSSYGQGGQTGSYGGGSSVSYGQGGPYTGGGASYGQGAQSG
SYGSGTYGQGRPSGTYSGSSQYGQGASYGSTQYGQSGQSGAYGGTNQYGQGAHYGSSSQY
GQGGQSGAYGGSNQYGQGGSYGSSSQYGQGRPSESYGGSTQYGQGGQTGSYGGTAQYGQG
QSGGSYSGTSGSYGQGGQSGSGSYGQGQPGGSYSGSSGSYGQGGQSGSGSYGQGQPGGSY
GGTSGSYGQGQQGGSYGGSSGSYAQNSSSSGGNKTSGQGSSGGTQSGIQGSSSSGSKPSG
GQTGCYCPGGVSGSYGGQSSQYGGRQGYNQYGGRQGYGQYGGNTYSGRQGYHGSGQYGGG
RYGGSQYGGKNAAGKHPFSSFLLLFSVLSAFAVSSSTETRWLI
NT seq
3372 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaagcacattctcttcttttcatttctgctctgtggggtcttcgtcacacgagtctgc
tgccttccatatgggaatatttcactagcttgtgaatcgatgttgccaaaccactctgta
gaaccacaggaatccgaatcaccctatcacatttctgtatcatcagatgaatatgaccca
ggaaaagaagtaaaagtgaaaatagaaggaacacctgatgttggatttaaatggtttatg
ctacaggctcgagacattgaagaaaacattccagttggttcatttcagatcacagatcca
aacacgcaaagccttgactgttacaacctttcaaattcagcattaattcaaacaaacttg
gatacgaaacaggacgtaacagcacactgggtttcacctgatgctaaaactattcaattt
atagcaaccatttttcaagaccctgaaacatactgggttgttgttcccagtgtcgtcctc
tttcctagaaatttcagtgaggcagaagatgattccaaaattgttggtgaatctcaatca
gcccaagtatcacccaaaagcaggaagaagtctgcaggtattactctaagaataaactgt
ggccagggtggcagttatgcaagcagcagtgaatgtaccaagatatatcagggttcttcg
tctggctcttattctggcaggcaggatggttcagtgtaccaaggaggaatcaaaaagggt
ggctgcgctggtggtggagtttcaagtgtctacagcaagtatggctgccgtgatgggggt
acagcgtacagtagcagctcatatgggcagtctgtgtcaactgtgtcagataccaaaaag
acttttcagcatcctcctagcaacccctacccaccagaacgtacatcaatcactgcgcaa
cttgccaactctcactataagcatattcagagcactcaatatggcagcaaagtacagagc
cagggttcacaaccgcaaagtggcatccgtattaccattcagagtggaccaggcgtgcgg
ttctgtgataagacctcttcttcttacaacagccaagcctgtaaacagagtatgcagtct
tccacatcgcagagcagttcttatggatcacagcagggcggatcctctaattcaattggt
ggtggccgtggaaccgcaaattatggtggcagcagcggatcttcaaattatggcggcagc
actggatcctcaaactatggtggcagcagtggatcctcaaactatggtggcagcagtgga
tcttcaaactatggtggcaatagtggatcctcaaagtatggcagtggcaagccttgcgga
caggggtatacatatgatagcaatccttgcaatcagcagggtggatcatcacaacaaaat
tatggaagtagccagggtggatcaacatctcaacaaagttatggaggcaggccgggtggc
tcatcatcccaacaaaattatggaagcagtcagagtggatcaccgtaccagccaagttat
ggagccggccagggaggaagttatggaagtaaccagggtggatcatcagggcagcaaggc
tatggaagcaaccagagtagaccaccgtcccagcagggttatggaagtaaccagggcagt
tccagttctcaaggaaaccgcaatccttgtgatgggagcagttattctggtacaggatat
agcagtagcaactgcccacagggtggatcttcccagcaacggtttggtagcaaccagggt
ggatcttcccagcaacagtttggtagcaaccagcagggttctcagacttacggaggacga
ggacgctacaacagtaatgactgcgatgttggtgatgccaaaagttacggtgaaaaggct
ctgagctcggcaaactgtagaggcaaaaggtctattgatactccagctacatctaaagat
ttcatcacaaagattaaacaagccgcagctcatgctttagtacgaaaaacgcgaagtaaa
aaaatccgtactctagtcagaaaggctcggagtgaaaaaactgaaacggctacttctgaa
agcaataacaatgaccaggatggatcatttatggtatctgcctatagacagggacaatgt
gtttgccctggtgcacagggctctttttcttacaaatctagaaataggagagaagcatct
tcctcctatggcagcagttcttatggccagggttcatcttccacatatggcagcagcggg
agctcttacggacagggtggacagactggatcatatggtggtggcagctctgtatcatat
gggcagggtggaccatatactggtggtggtgcttcatatggacagggtgcacagagtgga
tcatatggcagtggaacatatgggcagggtagaccaagtggcacatacagtggcagcagt
caatatggacagggtgcatcatatggcagcacccaatatggacagagtgggcagagtgga
gcatacggaggcaccaaccaatatggacagggtgcacattatggaagcagttctcaatac
ggacagggtggacagagtggggcatatggaggcagcaaccaatatggacagggtgggtca
tatggaagcagttctcaatatggacagggtagaccgagtgagtcatatggtgggagcact
cagtatggacagggtggacaaactggatcatatgggggcaccgcccaatatggacagggt
caatcaggtggatcatatagtggcaccagtggatcttatggacagggtggacagagtggc
agtggatcatatgggcagggtcaaccaggtggatcatatagtggcagcagtggatcatat
ggacagggtggacagagtggcagtggatcatatggacagggtcaaccaggtggatcatac
ggtgggaccagtggatcatatggacagggtcaacaaggtggatcatatggtggcagcagt
ggatcatatgcacagaactcctcttcctctggaggcaataagactagtgggcagggatcc
tcaggaggaacccagtctggtattcagggatcgtcatcttcaggaagcaagccatctgga
gggcagaccggctgttactgcccaggcggggtttctggatcatatggtggacaaagtagc
caatatggtggtagacaaggttacaaccaatatggtggtagacaaggttacggccaatat
ggtggaaacacgtatagtggtagacaaggatatcatggaagcggacagtatggtggtgga
cgatatggtggcagccagtatggggggaaaaatgctgctgggaaacacccattctccagc
ttcttgctgcttttcagtgttctgagcgcctttgcggtctcttcttcaactgaaactaga
tggctgatatga
DBGET
integrated database retrieval system
