KEGG   Scyliorhinus torazame (cloudy catshark): 140405511
Entry
140405511         CDS       T11303                                 
Symbol
col2a1a
Name
(RefSeq) collagen, type II, alpha 1a isoform X1
  KO
K19719  collagen type II alpha
Organism
stoz  Scyliorhinus torazame (cloudy catshark)
Pathway
stoz04510  Focal adhesion
stoz04512  ECM-receptor interaction
stoz04518  Integrin signaling
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:stoz00001]
 09130 Environmental Information Processing
  09133 Signaling molecules and interaction
   04512 ECM-receptor interaction
    140405511 (col2a1a)
   04518 Integrin signaling
    140405511 (col2a1a)
 09140 Cellular Processes
  09144 Cellular community - eukaryotes
   04510 Focal adhesion
    140405511 (col2a1a)
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   00536 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:stoz00536]
    140405511 (col2a1a)
Glycosaminoglycan binding proteins [BR:stoz00536]
 Heparan sulfate / Heparin
  Extracellular matrix molecules
   140405511 (col2a1a)
SSDB
Motif
Pfam: Collagen COLFI VWC VWC2L_2nd
Other DBs
NCBI-GeneID: 140405511
NCBI-ProteinID: XP_072350148
LinkDB
Position
X:34685593..34791749
AA seq 1492 aa
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NT seq 4479 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
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DBGET integrated database retrieval system