Staphylococcus aureus subsp. aureus 71193 (MSSA): ST398NM01_0949
Help
Entry
ST398NM01_0949 CDS
T02043
Name
(GenBank) ATP-dependent nuclease subunit B
KO
K16899
ATP-dependent helicase/nuclease subunit B [EC:
5.6.2.4
3.1.-.-]
Organism
sud
Staphylococcus aureus subsp. aureus 71193 (MSSA)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
sud00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
sud03400
]
ST398NM01_0949
Enzymes [BR:
sud01000
]
5. Isomerases
5.6 Isomerases altering macromolecular conformation
5.6.2 Enzymes altering nucleic acid conformation
5.6.2.4 DNA 3'-5' helicase
ST398NM01_0949
DNA repair and recombination proteins [BR:
sud03400
]
Prokaryotic type
DSBR (double strand breaks repair)
HR (homologous recombination)
AddAB pathway proteins
ST398NM01_0949
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ADDB_N
PDDEXK_1
UvrD_C
AAA_30
Anamorsin_N
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AFH69185
LinkDB
All DBs
Position
872968..876444
Genome browser
AA seq
1158 aa
AA seq
DB search
MTLHAYLGRAGTGKSTKMLTEIKQKMKADPLGDPIILIAPTQSTFQLEQAFVNDPELNGS
LRTEVLHFERLSHRIFQEVGSYNEQKLSKAAMEMMIYNIVQEQQKYLKLYQSQAKYYGFS
EKLTEQIQDFKKYAVTPEHLESFIADKNMQTRTKNKLEDIALIYREFEQRIQNEFITGED
ALQYFIDCMPKSEWLKRADIYIDGFHNFSTIEYLIIKGLIKYAKSVTIILTTDGNHDQFS
LFRKPSEVLRHIEEIANELNISIERQYFNQLYRFNNQDLKHLEQEFDALQINRVACQGHI
NILESATMREEINEIARRIIVDIRDKQLRYQDIAILYRDESYAYLFDSILPLYNIPYNID
TKRSMTHHPVMEMIRSLIEVIQSNWQVNPMLRLLKTDVLTTSYLKSAYLVDLLENFVLER
GIYGKRWLDDELFNIEHFSKMGRKAHKLTEDERNTFEQVVKLKKDVIDKILHFEKQMSQA
ETVKDFATAFYESMEYFELPNQLMTERDELDLNGNHEKAEEIDQIWNGLIQILDDLVLVF
GDEPMSMERFLEVFDIGLEQLEFVMIPQTLDQVSIGTMDLAKVDNKQHVYLVGMNDGTMP
QPVTASSLITDEEKKYFEQQANVELSPTSDILQMDEAFVCYVAMTRAKGDVTFSYSLMGS
SGDDKEISPFLNQIQSLFNQLEITNIPQYHEVNPLSLMQHAKQTKITLFEALRAWLDDEI
VADSWLDAYQVIRDSDHLNQGLDYLMSALTFDNETVKLGETLSKDLYGKEINASVSRFEG
YQQCPFKHYASHGLKLNERTKYELQNFDLGDIFHSVLKYISERINGDFKQLDLKKIRQLT
NEALEEILPKVQFNLLNSSAYYRYLSRRIGAIVETTLSALKYQGTYSKFMPKHFETSFRR
KPRTNDELIAQTLTTTQGIPINIRGQIDRIDTYTKNDTSFVNIIDYKSSEGSATLDLTKV
YYGMQMQMMTYMDIVLQNKQRLGLTDIVKPGGLLYFHVHEPRIKFKSWADIDEDKLEQDL
IKKFKLSGLVNADQTVIDALDIRLEPKFTSDIVPVGLNKDGSLSKRGSQVADEATIYKFI
QHNKENFIETASNIMDGHTEVAPLKYKQKLPCAFCSYQSVCHVDGMIDSKRYRTVDETIN
PIEAIQNINIDDEFGGEQ
NT seq
3477 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgacattacatgcttatttaggtagagcgggaacaggtaagtctacgaaaatgttgacc
gaaataaaacaaaaaatgaaagcagatccgcttggagatccaatcattttaattgcgcca
actcaaagtacatttcaattagaacaagcctttgtcaatgatccggaattaaatggtagt
ttaagaacagaagtgttgcattttgaacgattaagtcatcgtattttccaagaagttggt
agttataatgaacaaaaactatctaaagctgctatggaaatgatgatttataacattgtt
caagaacaacaaaagtatttaaaactttatcaatcacaagcaaaatattatgggtttagt
gaaaaattaacagaacaaattcaagattttaaaaaatatgcagtaacgcctgaacattta
gaaagctttattgctgataaaaatatgcaaactcgaactaaaaataagttagaggatatt
gctttaatataccgtgagttcgaacaacgcattcaaaacgagtttattacgggtgaggat
gcattacaatattttattgattgtatgccgaaatcagagtggctaaaacgtgctgatata
tatattgatggttttcacaacttttcaacgattgagtatttaataatcaaaggattaatt
aaatatgcgaagagtgtcacaattatattgacgacagatggtaaccacgatcaattcagt
ttatttagaaaaccatcggaagtgttacgacatattgaagaaatagcaaatgaactcaat
atttctattgaacgtcaatatttcaaccaattatatcgctttaataatcaagatttaaag
catcttgaacaagaatttgatgcgcttcaaatcaatcgagtggcatgtcaaggtcatatc
aatattttagaatctgcgactatgagagaggaaataaatgaaattgcacgacgtatcatc
gttgatattcgtgataagcaattacgatatcaagatattgctattttatatcgtgacgag
tcttatgcttatttatttgattccatattaccgctttataatattccttataacattgat
acaaagcgttcgatgacacatcatccggtcatggaaatgattcgttcattgattgaagtt
attcaatctaattggcaagttaatccaatgctacgcttattgaagactgatgtgttaacg
acatcatatctaaaaagtgcatacttagttgatttacttgaaaattttgtacttgaacgt
ggtatatacggtaaacgttggttagatgatgagctatttaatatcgaacattttagcaaa
atggggcgtaaagcgcataaactgaccgaagatgaacgtaacacatttgaacaagtcgtt
aagttaaagaaagatgtcattgataaaattttacattttgaaaagcaaatgtcacaagcg
gaaactgtaaaagactttgcaactgctttttatgaaagtatggaatattttgaactgcca
aatcaattgatgacagagcgagatgaacttgatttaaatggtaatcatgaaaaggcggaa
gaaattgatcaaatatggaatggcttaattcaaatccttgatgacttagttctagtattt
ggagatgaaccaatgtcgatggaacgtttcttagaagtatttgatattggtttagaacaa
ttagaatttgttatgattccgcaaacattggaccaagttagtattggtacgatggatttg
gctaaagtcgacaataagcaacatgtttacttagttggaatgaatgatggtacgatgcca
caaccagtaactgcgtcaagcttgattacagatgaagaaaagaaatactttgaacagcag
gctaatgtcgagttaagtccaacatcagatattttacagatggatgaagcatttgtttgt
tatgttgctatgactagagctaagggagatgttacattttcttatagtctaatgggatca
agtggtgatgataaggaaatcagcccgtttttaaatcaaattcaatcattgttcaaccaa
ttggaaattactaacattcctcaataccatgaagttaacccattgtcactaatgcaacat
gctaagcaaaccaaaattacattatttgaagcattacgtgcttggttagatgatgaaatt
gtggctgatagttggttagatgcttatcaagtaattagagatagcgatcatttaaatcaa
ggtttagattatttaatgtcagcattaacgtttgacaatgaaactgtaaaattaggtgaa
acgttgtctaaagatttatatggtaaggaaatcaatgccagtgtatctcgatttgaaggt
tatcaacaatgcccatttaaacactatgcctcacatggtctgaaactaaatgagcgaacg
aagtatgaacttcaaaactttgatttaggcgatattttccattccgttttaaaatatata
tctgaacgtattaatggcgattttaaacaattagacctgaaaaaaataagacaattaacg
aatgaagcattggaagaaattttacctaaagttcagtttaatttattaaattcttcagct
tactatcgttatttatcaagacgcattggcgctattgtagaaacaacactaagcgcatta
aaatatcaaggcacgtattcaaagtttatgccaaaacattttgagacaagttttagaagg
aaaccaagaacaaatgacgaattaattgcacaaacattaacgacaactcaaggtattcca
attaatattagagggcaaattgaccgtatcgatacgtatacaaagaatgatacaagtttt
gttaatatcattgactataaatcctctgaaggtagtgcgacacttgatttaacgaaagta
tattatggtatgcaaatgcaaatgatgacatatatggatatcgttttacaaaataaacaa
cgccttggattaacagatattgtgaaaccaggtggtttattatacttccatgtacatgaa
cctagaattaaatttaaatcttgggcagatattgatgaagataaattagaacaagattta
attaaaaagtttaagctgagtggtttagtgaatgcagaccaaactgttattgatgcattg
gatattcgtttagaacctaaattcacttcagatattgtaccagtcggtttgaataaagat
ggttctttgagtaaacgaggcagccaagttgcagatgaagcaacgatttataaattcatc
caacataataaagagaattttatagaaacagcttcaaatattatggatgggcatactgaa
gttgcaccattaaagtacaaacaaaaattgccatgtgctttttgtagttatcaatcggta
tgtcatgtagatggcatgattgatagtaagcgatatcgaactgtagatgaaacaataaat
ccaattgaagcaattcaaaatattaacattgatgatgaatttgggggtgagcaatag
DBGET
integrated database retrieval system