Staphylococcus argenteus: SAMSHR1132_08180
Help
Entry
SAMSHR1132_08180 CDS
T01767
Name
(GenBank) ATP-dependent helicase/deoxyribonuclease subunit B, putative
KO
K16899
ATP-dependent helicase/nuclease subunit B [EC:
5.6.2.4
3.1.-.-]
Organism
suh
Staphylococcus argenteus
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
suh00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
suh03400
]
SAMSHR1132_08180
Enzymes [BR:
suh01000
]
5. Isomerases
5.6 Isomerases altering macromolecular conformation
5.6.2 Enzymes altering nucleic acid conformation
5.6.2.4 DNA 3'-5' helicase
SAMSHR1132_08180
DNA repair and recombination proteins [BR:
suh03400
]
Prokaryotic type
DSBR (double strand breaks repair)
HR (homologous recombination)
AddAB pathway proteins
SAMSHR1132_08180
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ADDB_N
PDDEXK_1
UvrD_C
AAA_30
SeqA_N
Anamorsin_N
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CCE58672
LinkDB
All DBs
Position
910863..914336
Genome browser
AA seq
1157 aa
AA seq
DB search
MTLHAYLGRAGTGKSTKMLSEIKQKMKQDPLGDPIILIAPTQSTFQLEQAFVNDSELNGS
LRTEVLHFERLSHRIFQEVGSYSEQKLSKAAMEMMIYNIVQEQQQHLKLYQSQAKYYGFS
EKLAEQIQDFKKYAVTPDHLNQFITDNHVQTRTKHKLEDIALIYRDFEQRIQNEFITGED
ALQKFIDCMSKSEWLKKADIYIDGFHNFSTIEYLIIKGLIENAKSVTIILTTDGNQDQFS
LFRKPSEVLRHIEEIANELNITIDRQYFNQQYRFTNQDLKHLEQQFDALQINQESCEGHI
DILESATMREEINEIARRIIVDIRDKHLRYQDIAILYRDEAYAYLFESILPLYDIPFNID
TKRSMTHHPVMEMIRSLIEVIQSNWHVNPMLRLLKTDILTSQIKNSVYLVDLLENFVLER
GIYGKRWLDDDLFNVEHFSKMGRKAHKLTEDERNTFEQVVKLKKDVIDKILHFENQMSKA
NTVRTFATAFYESMEYFELPNQLMTERDELDLNGKHEKAEEIDQIWNGLIQILDDLVLVF
GDEPMSMERFLEVFDIGLEQLEFVMIPQTLDQVSIGTMDLAKVDNKQHVYLVGMNDGTLP
QPVTASSLITDEEKKYFEQQANVELSPTSDILQMDEAFVCYIAMTRARQDVTFSYSLMGS
SGDDKEISPFLKQIQNLYHQLEITNIPRYHEVAPLSLMQHVKQTKIALFEALRSWLDDEI
VADSWLDAYQVIRDSDDLNQGLDYLMSALTFDNETVQLGETLSKDLYGKEINASVSRFEG
YQQCPFKHYASHGLKLNERTKYELQNFDLGDIFHSVLKYISERINGDFKQLDLKKIRQLT
NEALEEILPKVQFNLLNSSAYYRYLSRRIGAIVETTLSALKYQGTYSKFMPKYFETSFRR
KPRANDELIAQTLTTSQGIPINIRGQIDRIDTYTKDDTSFVNIIDYKSSEGSATLDLTKV
YYGMQMQMMTYMDIVLQNKQRLGLTDIVKPGGLLYFHVHEPRIKFKSWADIDEDKLEQDL
IKKFKLSGLVNADQAVIDALDIRLEPKFTSDIVPVGLNKDGSLSKRGSQVADEETIYKFI
QHNKENFIETASNIMDGHTEVAPLKYKQKLPCAFCSYQSVCHVDGMIDSKRYRSVDETIN
PIEAIQNINIDDFGGEQ
NT seq
3474 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgacattacatgcttatttaggaagagctggaacaggtaagtctacgaaaatgttatct
gaaataaaacaaaaaatgaaacaagatccactcggagatccaatcattttaattgcacca
acacaaagtacatttcaattagaacaagcctttgttaacgattcagaattaaatggtagc
ctaagaacagaagtgctgcattttgagcgcttaagtcaccgtattttccaagaagttggt
agttatagtgaacaaaaactatctaaagctgcaatggaaatgatgatttataatattgtt
caagaacagcaacagcatttaaagttataccaatcacaagcgaaatattatgggttcagt
gaaaaattagctgaacaaattcaagactttaaaaaatatgcagtaacacctgatcattta
aatcagtttataactgacaatcatgtacagactcgaacgaaacataaattagaagatatt
gctttaatatatcgtgattttgagcaacgcattcaaaatgaatttattaccggtgaagat
gcattgcaaaaatttattgattgtatgtcaaagtcggaatggcttaaaaaggcagatata
tacattgatggctttcataacttttcaacaattgaatatttaattataaaaggattaata
gagaacgcgaaaagtgtaaccattatattgacaacggacggtaatcaagatcaattcagt
ttgtttagaaagccttcagaagtattgagacatattgaggaaattgccaatgaattaaat
attacaatagatcgtcaatattttaatcaacaatatcgatttacgaatcaagatttaaaa
catcttgagcagcaattcgatgcactacaaattaatcaagagtcatgcgaagggcatatt
gatattttagaatctgccacaatgagagaagaaataaatgaaattgcgaggcgaatcatt
gtagatatacgagataagcacttaagatatcaagatatcgctattttatatcgtgacgaa
gcatatgcttatttatttgagtcaattttaccgctttatgatattccatttaacattgat
acgaagcgctcgatgacgcaccatccagttatggaaatgattcgttcacttattgaagtt
attcaatcaaattggcatgttaatccaatgttacgcttgcttaaaacggatatattaact
tctcaaattaaaaatagtgtttacttagtagatttacttgaaaattttgtattggaaaga
ggtatatatggcaagcgttggttagatgatgatttatttaatgttgaacattttagtaaa
atggggcgaaaagcacataaattgacagaggacgaacgtaacacatttgaacaagttgtt
aaattgaaaaaagatgtaatcgataaaattttgcattttgaaaatcaaatgtcaaaagca
aatactgtaagaacattcgcaactgcgttttatgagagtatggaatattttgaattacca
aatcaattaatgacagagagagacgagcttgatttgaatggtaagcatgagaaggcagaa
gaaatagatcaaatttggaatggcttaattcaaatccttgacgacttagttctagtattt
ggagatgaaccgatgtctatggaacgttttttagaagtatttgatattggtttagaacaa
ttagaatttgttatgataccgcaaacattggaccaagttagtattggtacgatggatttg
gctaaagtagacaataaacaacatgtttatttagtaggtatgaacgacggtaccttgcca
cagccagtaactgcgtcaagcttgattacagatgaagaaaagaaatactttgaacaacaa
gcaaatgttgagctaagtccaacatcagatatattgcaaatggatgaagcttttgtttgt
tatatagctatgacaagagcgagacaagacgtaacattttcatatagtttaatgggatca
agtggtgatgacaaagaaattagtccatttttaaagcaaattcaaaatttatatcatcaa
cttgaaattacaaatattccacgttatcacgaagtagcaccgttatcacttatgcaacat
gttaagcaaacaaaaattgcattatttgaagcattacgatcatggttagatgatgaaatt
gtcgccgatagttggttagatgcataccaagtgattcgcgatagtgatgatttaaatcaa
ggactagattatttaatgtcagcattaacttttgataatgaaactgtacaattaggcgaa
acactttcaaaagatttatacggtaaagaaatcaatgccagtgtctcccgttttgagggc
taccaacaatgtccatttaaacattatgcttcgcatggtttgaaattaaatgaacgaaca
aaatatgaacttcaaaactttgatttaggtgacattttccactctgttttaaaatatatt
tctgagcgcatcaacggtgattttaaacagctagatcttaaaaaaattagacaattaacg
aatgaagcattggaagaaattttacctaaagttcagtttaatttgttaaattcttcggca
tattatcgttatttatctcgacgcataggtgcaattgttgaaacaacgcttagtgcttta
aaatatcaaggcacatattctaaatttatgccaaaatattttgaaacgagttttagaagg
aagccaagagcaaacgatgagttaatagcacaaacattaacgacgtcacaaggtatacca
atcaatattagaggacaaattgaccgtatcgatacgtatacaaaagatgacacaagtttt
gttaatattattgactataaatcatctgagggaagtgcgacactcgatttaacgaaagta
tattatggaatgcaaatgcaaatgatgacatatatggatatcgttttacaaaataaacag
cgtcttggattaacagatattgtgaaaccagggggattattatatttccatgtacatgaa
cctagaattaaatttaaatcatgggcagatattgatgaagataaattagaacaagactta
attaaaaagtttaagcttagtggtttagtgaatgcagaccaagctgttatcgatgcatta
gatattcgtttagaacctaaatttacatcagatatagtgccggttggtttgaataaagat
ggctcgttaagtaaaaggggtagtcaagtagcagatgaagagactatctataaatttatc
cagcacaataaagagaattttatagaaactgcttcaaatataatggatgggcatactgaa
gttgcgcctttgaaatataaacaaaaattgccatgtgcattttgtagttatcaatcggta
tgtcatgttgatggcatgatagatagtaaacgataccgttcagttgatgaaacgataaat
ccaatagaagcgattcaaaatataaacattgatgattttgggggtgagcaataa
DBGET
integrated database retrieval system
