Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1: SYO3AOP1_1560
Help
Entry
SYO3AOP1_1560 CDS
T00715
Name
(GenBank) diguanylate cyclase/phosphodiesterase
Organism
sul
Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
EAL
GGDEF
SDF
GGDEF_2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ACD67158
LinkDB
All DBs
Position
1606457..1608859
Genome browser
AA seq
800 aa
AA seq
DB search
MERVLKVRSFANKIILLFILIFFISSIFALFLVSYYVYDSELGKAKKGIELAIKIRKESS
QQILDMYSKSLPNMINESMDNDYLLYITDKIPDFLKNNYKYYLKDKVIYFKFKKDGKKYA
AAVDEKLLNSQIMSKYGIVSIYNPNFFLATDTNLNLNNICAYSKYENSNFYLAGCIKKET
ILKMAFTEGFKIVIISGGSFLFFVLLFYFIARRLILFPLNYIKYKLNELEKKDIRYVKFY
LHKFGSDELAKISEKFEEFRIRLIKSQDKIYLVFHTVTKILSATNEFNKFSKFVLNNLDK
ILNLKGSYLIYQYNSEEVKSFSDKYLQDQKNSLELGNFNEIILKRDIDSDSYIEFHGFRK
DKLNEEDLEYLEIILSNLIYVIKLYRTANYDFLTRVFNRRKMMELIQKNIENSKKFAILM
LDMDDFKRINDTFGHDLGDEILKEIVKILKNIRRQQDIIGRYGGEEFIILSPDADGKEAL
NIAEDIRKAISEKPVVVRDNKIYISVSIGIAEFPIHGNSPSELLKAADIALYKAKKEGKN
KAVYLIPEEVKKIISLEFEFKDAILDAIKNDRFVPFFQPIVEAKTGNIYGYEVLARIYDE
KENKYIPAYQFINNAIKYGLVEEIDKIIQEKAIKYFSEKKLNKCLFLNMSKNFIYKSGNL
ENLYNLCVSNGLKPENVYLEITEEEAILDFKNVKELIQYGKSLGFRYAIDDFGAGYSNFV
YLKHFNVDIIKIDGSLVANIHQDLDNQIIVENIIRIAKHKNIKVLAEMVELEEEKDILIK
LGVDYLQGYLFGKPEKEVKE
NT seq
2403 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtggaaagagttctaaaggtaaggtcttttgctaataagattattctgctttttatttta
atattttttatttcttcaatctttgctttatttttagtctcttattatgtatatgacagt
gaacttggaaaggcaaaaaaaggaatcgaattggctattaaaattagaaaggagtcaagt
cagcaaatattagatatgtattctaaatcattacctaacatgattaacgaatcaatggat
aatgattatttgttatacataactgataaaattcctgattttctaaaaaacaactacaag
tattatttaaaggacaaagtaatatactttaaatttaagaaagatggtaaaaaatacgct
gcagctgtagatgaaaaacttttaaacagtcaaattatgtctaagtatggtatagtttca
atttataatccaaatttcttcttagctacggataccaatcttaatttaaacaatatttgt
gcttactctaaatatgaaaattcaaatttttatttagctggttgtattaaaaaggaaacc
attctaaaaatggcttttactgaaggttttaaaatagttattattagcggcgggtcattt
ttattttttgttttactattttattttatagcaagaagattaattttatttccattgaat
tacatcaaatacaagcttaatgagcttgaaaagaaagatattagatatgtaaagttttat
ttacacaagtttggttcagatgaacttgccaaaatttcagaaaaatttgaagaatttaga
attagattaataaaatctcaagacaaaatttaccttgtatttcatacagtaaccaaaata
ttatcagcaacaaatgaattcaataaattttctaaatttgtcttaaataatttagataaa
attttaaatctaaaaggaagttatttgatttatcaatataattcagaagaagttaaatct
ttttctgacaagtatttacaagatcaaaaaaatagtcttgaacttggaaattttaatgag
attatcttaaaaagagatatagatagtgattcatatattgaatttcatgggtttagaaaa
gataaactgaatgaagaagatttagaataccttgaaataatcttatcaaaccttatctat
gtaataaaactttacagaactgcaaactatgactttcttacaagagtttttaatagaaga
aagatgatggaacttatccaaaagaatatagaaaattctaaaaaattcgctatactgatg
cttgatatggatgattttaaaaggattaatgacacgtttggtcatgaccttggagacgaa
attttaaaagaaattgttaaaattttaaaaaatataagaagacagcaggatattataggt
aggtatggaggagaggagtttattatcctaagtccagatgccgatggtaaagaagcatta
aatatagcagaagatattagaaaagccatttcagaaaagccggtagtagtaagagataat
aaaatttatatatctgtcagcataggtatagctgagtttccaattcatggaaatagtcca
agtgaacttttaaaagctgccgatattgctctttataaagcaaaaaaagaaggcaaaaat
aaagctgtttatttaatacccgaagaagtaaaaaaaattattagtttagagtttgaattt
aaagatgcaatattagatgctataaaaaatgacagatttgttccatttttccagcctata
gttgaagcaaaaactggaaatatatatggttatgaagttttagcgagaatttacgatgag
aaagaaaataaatacattccagcatatcaatttataaataatgctattaagtacggactt
gttgaagagatagataaaataattcaagaaaaagcaattaagtatttttcagaaaagaaa
ttgaataaatgcttattcttaaatatgtccaaaaattttatttataaaagtggaaactta
gaaaatctatataacctttgcgtatcaaatggtttaaaacctgaaaatgtttatttagag
ataacagaagaagaagctattttagattttaaaaatgtaaaagaattaatccagtacgga
aaatccttaggatttagatacgcaatagatgattttggtgccggatattctaattttgta
tatctaaaacattttaatgttgatataatcaaaatagatggttcattggttgcaaatatt
catcaagatttagacaaccaaattatagttgaaaatattataagaattgccaaacataaa
aatattaaagtgttggcagaaatggttgaattagaggaagagaaagatattcttataaaa
cttggggtagattatttgcaaggatatctatttggaaaaccagaaaaagaagttaaggag
taa
DBGET
integrated database retrieval system