Sulfurospirillum sp. 1612: SFB89_11450
Help
Entry
SFB89_11450 CDS
T11274
Name
(GenBank) PelD GGDEF domain-containing protein
KO
K21009
polysaccharide biosynthesis protein PelD
Organism
sulu Sulfurospirillum sp. 1612
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
PelD_GGDEF
GAF_3
SMR11_SMR16
GGDEF_2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WVV36340
LinkDB
All DBs
Position
complement(2278117..2279406)
Genome browser
AA seq
429 aa
AA seq
DB search
MKKNKKRRVDHESLNDNLFNRISQYPIFETIAIFLLYVAIGYLIDPHDICMLNSEVSYMT
ILLIVVTLFHGLEGGLLLIGLFAVCMWYFYPEFYYVQFLMGMIITLICGEFYYFWNKKIR
KYKISSDYQETKLLELSKSFYALKISHDQLEKNYVFKPMSLRNSIRYIKQMSQNEDRYFK
EFLSLIENTFQINIATLLYKSRTDKTLQVVAQSEGTQEQGHLNLQDPLVKMSLESKRPVY
ISDHAKTQSQYIAAIPTVYQDKIEGMLLIEKMPFMSFNKENLIAISIMFDYFFSQIRIQD
ELDGFTDLEIIEDLSFRLECARLIQMQERYQVNSSALVIKTDDALMGERLYSMICRLLRS
LDKVTAVKGPQYYKIVMIFPFANKDMIEGFMKRLLTRFDDIDADDFEQLTFDMSQIELMD
KFLRLEHAK
NT seq
1290 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaaaaataaaaaaagacgcgttgatcatgagtctttaaacgataatttatttaat
agaatatctcaatatcctatctttgaaacgattgcgatatttttattatatgtggccatt
gggtatttgattgatcctcatgatatttgtatgctcaattcagaagtgtcatatatgacc
attcttttgattgtcgtcacactgttccatggcttagaaggggggctcttgctcattggc
ctctttgccgtttgtatgtggtatttttatcctgaattttattatgtccagtttttgatg
ggtatgattattactctgatttgtggcgaattttactatttttggaataaaaaaatcaga
aaatataaaatcagttcggattatcaagaaaccaaactattagagcttagcaagtccttt
tatgctcttaaaatctcacacgatcaattagaaaaaaactatgtatttaagccgatgagt
ttgcgtaactcgatccgatacatcaagcagatgagccagaatgaagatcgctattttaaa
gaatttctcagcctcatagaaaatacctttcaaatcaacatcgcgacattactgtataaa
agtagaaccgataagactttgcaggtggtggcacaatcagaaggcacgcaagagcagggg
cacctcaatttgcaagatccccttgtgaaaatgagtctggaatcaaaaagaccggtttat
atcagtgaccatgccaaaacgcaaagtcagtatatcgctgccattccaaccgtatatcaa
gataaaatagagggaatgttactgatagaaaagatgccatttatgtcttttaacaaagag
aatttgattgctatttctatcatgtttgactatttcttttcgcaaatccggattcaagat
gaactggatggttttacggatttagagataatcgaggatttaagtttccgattagaatgt
gcgcgtttgatacagatgcaagagcgctatcaggtcaattctagcgcccttgttatcaaa
accgatgatgccctcatgggagagcgattgtattcgatgatttgcagattgttgcgatca
ctcgataaggtaacggctgtgaagggaccgcaatattataaaattgtcatgatatttcct
ttcgccaataaagatatgatcgaagggtttatgaagcgacttttgacacgatttgatgat
attgatgcggatgattttgagcaactcacttttgatatgtcacagattgaactgatggat
aaattcttaagattagaacatgcaaaatga
DBGET
integrated database retrieval system
