Strix uralensis (Ural owl): 141941464
Help
Entry
141941464 CDS
T11361
Symbol
COL1A2
Name
(RefSeq) collagen alpha-2(I) chain
KO
K06236
collagen type I alpha
Organism
sura Strix uralensis (Ural owl)
Pathway
sura04510
Focal adhesion
sura04512
ECM-receptor interaction
sura04518
Integrin signaling
sura04820
Cytoskeleton in muscle cells
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
sura00001
]
09130 Environmental Information Processing
09133 Signaling molecules and interaction
04512 ECM-receptor interaction
141941464 (COL1A2)
04518 Integrin signaling
141941464 (COL1A2)
09140 Cellular Processes
09144 Cellular community - eukaryotes
04510 Focal adhesion
141941464 (COL1A2)
09142 Cell motility
04820 Cytoskeleton in muscle cells
141941464 (COL1A2)
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
00536 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
sura00536
]
141941464 (COL1A2)
Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
sura00536
]
Heparan sulfate / Heparin
Extracellular matrix molecules
141941464 (COL1A2)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Other DBs
NCBI-GeneID:
141941464
NCBI-ProteinID:
XP_074720361
LinkDB
All DBs
Position
1:complement(44508842..44550683)
Genome browser
AA seq
1362 aa
AA seq
DB search
MLSFVDTRILLLLAVTSYLATGQRKQEEGGRQGPRGDKGPQGERGPPGPPGRDGEDGLPG
PPGPPGPPGLGGNFAAQYDPSKAADFGPGPMGLMGPRGPPGASGPPGPPGFQGVPGEPGE
PGQTGPQGPRGPPGPPGKSGEDGHPGKPGRPGERGVAGPQGARGFPGTPGLPGFKGIRGH
NGLDGQKGQPGTPGSKGEPGAPGENGTPGQPGARGLPGERGRVGAPGPAGARGSDGSAGP
TGPAGPIGSAGPPGFPGAPGAKGEIGPAGNVGPSGPAGPRGEIGLPGSSGPVGPPGNPGA
NGLPGAKGAAGLPGVAGAPGLPGPRGIPGPPGPAGPSGARGLAGEPGPAGAKGESGNKGE
PGAAGPAGPPGPSGEEGKRGGNGEPGSAGPPGPAGLRGVPGSRGLPGADGRAGVMGPAGN
RGASGPVGAKGPNGDGGRPGEPGLMGPRGLPGQPGSPGPAGKEGPVGFPGADGRVGPIGP
AGNRGEPGNIGFPGPKGPTGEPGKPGERGNVGLAGPRGAPGPEGNNGAQGPPGVTGNQGG
KGEQGPAGPPGFQGLPGPSGPAGEAGKPGERGLHGEFGVPGPAGPRGERGPPGESGAVGP
AGSIGSRGPSGPPGPDGNKGEPGNVGAAGGPGPAGSGGIPGERGVAGVPGGKGEKGAPGL
RGDTGATGRDGARGLPGAIGAPGPAGGAGDRGEGGPAGPAGPAGARGIPGERGEPGPVGP
SGFAGPPGAAGQPGAKGERGPKGPKGESGPTGAIGPIGASGPPGPAGAAGPAGPRGDAGP
PGMTGFPGAAGRVGPPGPAGISGPPGPPGPAGKDGARGLRGDVGPVGRTGEQGIAGPPGF
AGEKGPSGEAGAAGPPGSPGPQGILGAPGILGLPGSRGERGLPGISGATGEPGPLGVSGP
PGARGPSGPVGSPGPNGAPGEAGRDGNPGNDGPPGRDGAPGFKGERGGPGNPGPSGAVGA
PGPHGQVGPSGKPGNRGDPGPVGAVGPAGAFGPRGLAGPQGPRGEKGEPGDKGHRGLPGL
KGHNGLQGLPGLAGQHGDQGPPGNNGPAGPRGPPGPSGPPGKDGRNGLPGPIGPAGVRGS
HGSQGPAGPPGPPGPPGPPGPNGGGYEVGYDAEYYRADQPSLRPKDYEVDATLKTLNNQI
ETLLTPEGSRKNPARTCRDLRLSHPEWSSGFYWIDPNQGCSADAIRAYCDFATGETCIHA
NPDHIPTKNWYINKNPKDKKHVWFGETINGGSQFEYNDEGVTSKDMATQLAFMRLLANHA
SQNITYHCKNSIAYMDEETGNLKKAVILQGSNDVELRAEGNSRFTFSVLVDGCSRKNNEW
GKTIIEYRTNKPSRLPILDIAPLDIGGADQEFGLDIGPVCFK
NT seq
4089 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgctcagctttgtggatacacggatcttgttgctgctcgcagtaacttcatacctagcg
acaggccaacgtaagcaggaggagggaggcaggcagggccctagaggagacaaagggcca
cagggagaaaggggtccaccaggtccaccaggcagagatggtgaagatggtctaccaggt
cctccaggcccccctggtcctcccggtcttggcggaaacttcgctgctcaatatgatcca
tctaaagcagctgattttggcccaggacctatgggtttaatgggacctagaggcccacct
ggagcatctggaccccctggtcctcctggttttcaaggtgttcctggtgagcctggtgaa
cctggtcaaacaggtccccagggtcctcgtggtccccctggtcctccaggaaagtctggt
gaagacggtcaccctggcaaacctggaagacctggtgagaggggtgttgctggccctcag
ggtgctcgtggtttccctggaactcctggtctgcctggctttaagggaattaggggacac
aatggtctggatggtcaaaagggacaacccggtactcctggcagcaagggagaacctggt
gcccccggtgaaaatggtaccccaggacaacctggtgctcgtggtctccctggagagaga
ggaagagtaggtgcccctggaccagctggtgcacgtggaagtgatggcagtgctggcccc
actggacctgctggccctattggttctgctggtcctccaggcttcccaggtgctcctggt
gctaagggtgaaatcggacctgctggtaatgttggtccaagtggtcctgctggtccaaga
ggagagattggacttcccggttctagcggtcctgttggccctccaggcaaccctggtgct
aatggtcttccaggggctaaaggtgcagctggtcttcctggtgttgctggtgctcctggt
ctgcccggtccccgtggtattcctggtccccctggccctgctggtcctagtggtgctaga
ggacttgctggtgaaccaggccctgctggtgccaagggagaaagtggtaacaagggtgag
cctggtgctgctggacccgctggccctcctggtcctagtggtgaggaaggcaagagaggc
ggcaatggtgaacctggctctgctggtcccccaggccctgctggtctaagaggtgtgcct
ggatctcgtggtctccctggagctgatggcagagctggcgtcatgggacctgctggtaac
cgtggtgctagtggtcctgttggtgctaagggtcctaatggtgatggtggccgtcctggt
gagcctggtcttatgggtccaagaggtctcccaggtcagcctggaagcccaggccctgct
ggcaaggaaggtcctgttggtttccctggagcagatggtagggttgggccaatcggtcca
gctggtaatagaggtgagcctggcaacattggattccctggaccaaaaggtcccactggt
gaacctggcaaacctggtgaaagaggcaatgttggtcttgctggcccacggggtgctcct
ggtccagagggaaacaacggtgctcaaggtcctcctggagtcactggcaaccaaggtgga
aaaggtgaacaaggtcccgctggccctcctggcttccagggtctgccaggtccctcgggt
ccagccggtgaagctggtaaaccaggcgaaaggggtcttcatggtgaatttggtgtccct
ggtcctgctggcccaagaggtgaacgtggtcctcctggtgaaagtggtgctgttggtccc
gccggctccattggaagccgtggtccatctggcccaccaggccctgatggtaacaagggt
gagcctggcaatgttggtgctgctggtggtcctggtcctgctggctctggtggaatccca
ggagagagaggtgttgctggtgttccaggaggcaagggtgaaaagggtgccccaggtctg
agaggtgatactggtgcaacaggaagagatggtgctcgtggtctccctggtgctattggt
gctcctggccctgctggtggtgctggtgatcggggtgaaggaggtcctgctggtcctgct
ggtcctgctggtgcccgtggtatccctggtgagcgcggtgagcctggtcctgtaggtcct
agtggatttgctggacctcctggtgcagctggtcagcctggtgctaaaggcgagcgtggg
cctaaaggacctaagggtgaaagtggaccaacaggtgctattggcccaattggtgcttct
ggaccaccaggtcccgctggtgctgctggtcctgctggccctcgtggtgatgctggtcct
cccggcatgactggtttccctggtgctgctggaagagttggtcctcctggccctgctggt
atcagtggtccccctggtcctcctggcccagctggcaaagatggtgctagaggtctacgt
ggagatgttggtccagttggccgtactggtgaacaaggtattgctggtccacctggtttt
gctggtgagaaaggtccatctggagaggctggtgctgccggtcctcccggtagcccaggt
cctcagggtattcttggtgctcctggtatccttggtctgcctggctctcggggagaacgt
ggtcttccaggcatctctggggcaacaggtgaacctggccccctgggtgtttctggtcct
cctggtgctcgtggtccctctggtcctgtgggttctcctggtccaaatggtgctcctggt
gaagctggtcgtgatggcaatcctggaaacgatggtcctccaggccgtgatggtgctcct
ggtttcaagggtgagcgtggtggtcctggtaaccctggtcccagtggtgctgtgggtgcc
cctggtcctcatggccaagttggtccttctggaaagcctggaaaccgtggtgaccctggt
cctgttggtgctgtcggtcctgctggtgcttttggtccaagaggtcttgctggcccacaa
ggtccacgtggtgagaaaggtgaacctggtgataaggggcatagaggtctgcctggcttg
aagggacacaatggattgcagggtcttcctggtcttgctggccaacatggtgatcaaggt
cctcctggtaacaatggccctgctggcccaaggggtccacctggtccttctggtcctcct
ggtaaagatggtcgcaatggtctccctggacctattggccctgctggtgtgcgtggctct
catggtagccaaggacctgctggtcctcctggtcctcctggtccccccggtccccctggc
cccaatggtggtggatatgaagtcggctacgatgcagaatactaccgggctgatcagcct
tctctcagacccaaggattatgaagttgatgccactctgaagacattgaacaaccaaatt
gagaccctgctgaccccagaaggctccagaaagaacccagctcgcacctgccgtgaccta
agacttagccacccagaatggagcagcggcttctactggattgatcctaaccaaggctgc
tctgcagatgccattagagcatactgtgactttgccactggtgagacttgcatccatgcc
aaccctgaccatattcccactaagaactggtacatcaacaagaatcccaaggacaagaag
cacgtatggtttggtgaaactatcaatggtggcagccagtttgaatacaatgatgaagga
gtgacctcaaaggatatggccacccaacttgccttcatgcgtctgctggccaaccatgcc
tcccagaacatcacctaccactgcaagaacagcattgcctacatggatgaggaaactggc
aaccttaaaaaggctgttatactgcagggatccaatgatgttgaactacgagctgaaggc
aacagcagattcacattcagcgttcttgtggatggctgctccagaaagaacaatgaatgg
ggcaaaacgatcattgaatacagaacaaataagccatctcgcttgcccatccttgacatt
gcacctttggatattggcggcgctgaccaagaattcggtttggacattggcccagtctgt
ttcaaatga
DBGET
integrated database retrieval system