Staphylococcus aureus subsp. aureus M013 (CA-MRSA): M013TW_0549
Help
Entry
M013TW_0549 CDS
T01744
Symbol
sdrD
Name
(GenBank) MSCRAMM family adhesin SdrD
KO
K14194
serine-aspartate repeat-containing protein C/D/E
Organism
suu
Staphylococcus aureus subsp. aureus M013 (CA-MRSA)
Pathway
suu05150
Staphylococcus aureus infection
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
suu00001
]
09160 Human Diseases
09171 Infectious disease: bacterial
05150 Staphylococcus aureus infection
M013TW_0549 (sdrD)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SdrD_B
CarboxypepD_reg
SpaA
SdrG_C_C
bMG3
Big_8
CarbopepD_reg_2
Ig_DR_A0283-like
MetallophosN
NOMO1-like_9th
YSIRK_signal
EMC7_beta-sandw
Gram_pos_anchor
Big_6
Ig_J
DUF1416
EMP24_GP25L
NOMO_3rd
TTR-52
MG4
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AEV77621
LinkDB
All DBs
Position
603908..607954
Genome browser
AA seq
1348 aa
AA seq
DB search
MLNRENKTAMTRKGMVSNRLNKFSIRKYTVGTASILVGTTLIFGLGNQEAKAAEVTNKEM
KEDATSVNNDQVSKKVDTEQLNNGGNTSKVDTEQLKDENINKVANQKEVTRVENSVASEK
NNNSKPSENGKLQTSDVKKTEDNNATSDDQVTTTVNSQQLNTDNTTSNETMSSAPINVSK
DNLKINSEVVKNVVENSDNTDNANGSDVIMPKSTAPKRLNTRMRIAAVQPSSTDSKNVNN
LITSTTTLTVVDADNSKTIVPAQDYLSLKSQITVDDKVKSGDYFTIKYSDTVQVYGLNPE
DIKNIGDIKDPNNGETIATAKHDTVNNLITYTFTDYVDRFNSVKMGINYSVYMDADTIPV
DKKDVPFSVTIGNQTTTTTADITYPAYKEADNNSIGSAFTETVSHAGNAEDPGYYNQVVY
VNPMDKDLKGANLKVEAYHPKYPTNIGQINQNVTNIKIYRVPEGYTLNKGYDVNANDLVD
VTDEFKNKMTYGSNQSVNVDFGDITSAYVVMVNTKFQYTNSESPTLVQMATLSSTGNKSV
STGNALGFTNNQSAGAGQEVYKIGNYVWEDTNKNGIQELGEVGVKGVTVVAYDNKTNKEV
GRTITDEKGGYLIPNLPNGDYRVEFSNLPQGYEVTPSKQGNNEELDSNGLSSVITVNGKD
NLSADLGIYKPKYNLGDYVWEDTNKNGIQDQDEKGISGVTVTLKDENGNVLKTVTTDADG
KYKFTDLDNGNYKVEFTTPEGYTPTTVTSGSDIEKDSNGLTTTGVINGADNMTLDSGFYK
TPKYNLGNYVWEDTNKDGKQDSSEKGISGVTVTLKNENGEVLQTTKTDKDGKYQFTGLEN
GTYKVEFETPSGYTPTQVGSGTDEGIDSNGTSTTGVIKDKDNDTIDSGFYKPTYNLGDYV
WEDTNKNGVQDKDEKGISGVTVTLKDENDKVLKTVTTDENGKYQFTDLNNGTYKVEFETP
SGYTPTSVTSGNDTEKDSNGLTTTGVIKDADNMTLDSGFYKTPKYSLGDYVWYDSNKDGK
QDSTEKGIKDVKVTLLNEKGEVIGTTKTDENGKYRFDNLDSGKYKVIFEKPAGLTQTGTN
TTEDDKDADGGEVDVTITDHDDFTLDNGYFEEETSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSD
SDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSD
SDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSD
SDSDSDSDSDSDSDSDNDSDSDSDSDSNAGKHTPAKPMSEVKDHHNKAKALPETGSENNN
SNNGTLFGGLFAALGSLLLFGRRKKQNK
NT seq
4047 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgctaaacagagaaaataaaacggcaatgacaagaaaaggcatggtatccaatcgatta
aataaattttcgattagaaagtacacagtgggaacagcatcaattttagtaggtacaaca
ttaatttttggtctggggaaccaagaagcaaaggctgcagaagtaaccaacaaggaaatg
aaggaagatgcaacatcagtaaataatgatcaagtgtctaaaaaagttgatacagagcaa
ctaaataatggcggtaatactagtaaagttgatacagagcaactaaaagatgagaatatt
aataaagttgctaatcaaaaagaagtaactagagtagaaaatagtgtcgcttcagaaaaa
aataataactctaagccatctgaaaacggaaaattacaaacgtctgatgttaaaaaaact
gaagataataatgcaacttcagatgatcaagttactactactgttaattcacagcaatta
aatactgataatacaacttcaaatgaaacaatgtcgtcagcaccaattaatgtaagtaaa
gataacttaaaaattaatagtgaagtagttaaaaatgtagtagaaaatagcgataacact
gacaatgcaaatggttcagatgtgattatgccaaaaagtacagcacctaaacgtttgaat
acaagaatgcgtatagcagcagtacaaccatcatcaacagactctaaaaatgttaataat
ttaattacttcaactacaactttaactgtagtcgatgcagataatagtaaaactattgta
cctgctcaagattatctatcattgaaatctcaaattacagttgatgacaaagttaaatcg
ggtgattatttcacaattaaatattcagatactgttcaagtatatggtttgaatccagaa
gatattaaaaatattggtgatataaaagatccaaataatggggaaacaattgcgactgca
aaacacgatactgtaaataatttaattacatatacatttacagattatgttgatcgattt
aattcagtgaaaatgggaattaattactcagtttacatggatgcagatacaattcctgta
gacaagaaagatgttccttttagtgtaactattggaaatcaaactacaactactacagca
gatattacttatccggcttataaagaagctgataataattcaatagggtcagcttttaca
gaaacagtttctcatgcaggaaatgctgaagatcctggttattataaccaagtagtttat
gtgaatcctatggataaagatttaaaaggggctaatttaaaagttgaagcgtatcatccg
aaatatccgactaatattggtcaaattaatcaaaacgttactaatataaaaatatatcgt
gttcctgaaggatatacattgaataagggatacgacgttaatgctaatgatttagtagac
gtaaccgatgaatttaaaaataaaatgacctatggatcaaatcaaagtgttaatgttgat
tttggtgatattacatcagcatatgttgtaatggttaatacaaaattccaatatacaaat
agcgaaagcccaacacttgttcaaatggctactttatcttcaacaggtaataaatccgtt
tctactggtaacgctttaggattcactaataaccaaagtgccggagctggtcaagaagta
tataaaattggtaactacgtatgggaagatacaaataaaaacggtattcaagaattaggg
gaagttggagtaaaaggtgtaacagtggttgcatatgacaataaaactaataaagaagtt
ggaagaacaattactgatgaaaaaggtgggtatttgattccaaacttacctaatggagat
taccgtgtagaattttcaaatttaccacaaggttatgaagtaaccccttcaaaacaaggt
aataacgaagaattagattcaaacggtttatcatcagttattacagttaatggcaaagat
aatttatctgctgacttaggtatttacaaacctaaatacaatctaggcgactatgtatgg
gaagatacaaataaaaatggtatccaagatcaagatgaaaaaggtatatctggcgtaacg
gtaacattaaaagatgaaaacggtaacgtgttaaaaacagttacaacagatgctgatggc
aaatataaatttactgatttagataatggtaattataaagttgaatttactacaccagaa
ggctatacaccgactacagtaacatctggtagcgatattgaaaaagactctaatggttta
acaacaacaggtgttattaatggtgctgataacatgacattagatagtggattctacaaa
acaccaaaatataatttaggtaattatgtatgggaagatacaaataaagatggtaagcag
gattcatctgaaaaaggtatttcaggcgtaacagttacattgaaaaatgaaaacggtgaa
gttttacaaacaactaaaacagataaagatggtaaatatcaatttactggattagaaaat
ggaacttataaagttgaattcgaaacaccatcaggttacacaccaacacaagtaggttca
ggaactgatgaaggcatagattcaaatggtacatcaacaacaggtgtcattaaagataaa
gataacgatactattgactctggtttctacaaaccgacttacaacttaggtgactatgta
tgggaagatacaaataaaaacggtgttcaagataaagatgaaaagggcatttcaggtgta
acagttacgttaaaagatgaaaacgacaaagttttaaaaacagtaacaacagatgaaaat
ggtaaatatcaattcactgatttaaacaatggaacttataaagttgaattcgagacacca
tcaggttacacaccaacttcagtaacttctggaaatgatactgaaaaagattctaatggt
ttaacaacaacaggtgtcattaaagatgcagataacatgacattagacagtggtttctat
aaaacaccaaaatatagtttaggtgattatgtttggtacgacagtaataaagacggcaaa
caagattcaactgaaaaaggtattaaagatgttaaagttactttattaaatgaaaaaggc
gaagtaattggaacaactaaaacagatgaaaatggtaaatatcgtttcgataatttagat
agcggtaaatataaagttatttttgaaaagcctgctggcttaacacaaacaggtacaaat
acaactgaagatgataaagatgcagatggtggcgaagttgacgtaacaattacggatcat
gatgatttcacacttgataacggatacttcgaagaagaaacatcagatagtgactcagat
tcagacagcgattcagactcagacagcgactcagactcagatagcgactcagacagtgat
tcagactcagatagcgattcagactcagacagcgactcagattcagacagtgattcagac
tcagatagcgactcagattcagatagcgattcagattcagatagcgactcagattcagac
agcgactcagattcagatagcgactcagactcagacagcgactcagattcagatagcgac
tcagactcagacagtgactcagactcagatagcgattcagattcagacagcgattcagac
tcagacagtgattcagactcagatagtgattcagactcagatagcgactcagattcagat
agcgattcagactcagacagtgattcagactcagatagcgactcagactcagacagtgac
tcagattcagatagcgattcagattcggatagcgactcagattcagataacgattcagat
tcagatagcgattcagactcaaatgcaggtaaacatacaccggctaaaccaatgagtgaa
gttaaagaccatcacaataaagcgaaagcattaccggaaacaggtagtgaaaataataat
tcaaataatggcacattattcggtggattattcgcggcattaggatcattattgttattc
ggtcgtcgtaaaaaacaaaataaataa
DBGET
integrated database retrieval system
