Staphylococcus aureus subsp. aureus M013 (CA-MRSA): M013TW_0550
Help
Entry
M013TW_0550 CDS
T01744
Symbol
sdrE
Name
(GenBank) MSCRAMM family adhesin SdrE
KO
K14194
serine-aspartate repeat-containing protein C/D/E
Organism
suu
Staphylococcus aureus subsp. aureus M013 (CA-MRSA)
Pathway
suu05150
Staphylococcus aureus infection
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
suu00001
]
09160 Human Diseases
09171 Infectious disease: bacterial
05150 Staphylococcus aureus infection
M013TW_0550 (sdrE)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SdrD_B
SdrG_C_C
CarboxypepD_reg
Big_8
SpaA
bMG3
YSIRK_signal
MetallophosN
Ig_DR_A0283-like
Gram_pos_anchor
CarbopepD_reg_2
NOMO1-like_9th
Big_6
Ig_J
DUF2606
CompInhib_SCIN
NOMO_3rd
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AEV77622
LinkDB
All DBs
Position
608353..611730
Genome browser
AA seq
1125 aa
AA seq
DB search
MINRDNKKAITKKGMISNRLNKFSIRKYTVGTASILVGTTLIFGLGNQEAKAAENTSTEN
AKQDDATTSDNKEVVSETENNSTTENNSTNPIKKETNTDSQPEAKEESTTSSTQQQQNNV
TATTETKPQNIEKENVKPSTDKTATEDTSVILEEKKAPNNTNNDVTTKPSTSETQTKPTT
PQESTNIENSQPQPTPSEVDNQVTDATNPKEPVNVSKEELKNNLEKLKELVRNDSNTDRS
TKPVATAPTSVAPKRVNAKMRFAVAQPAAVASNNVNDLIKVTKQTIKVGDGKDNVAAAHD
GKDIEYDTEFTIDNKVKKGDTMTINYDKNVIPSDLTDKNDPIDITDPSGEVIAKGTFDKA
TKQITYTFTDYVDKYEDIKSRLTLYSYIDKKTVPNETSLNLTFATAGKETNQNVTVDYQD
PMVHGDSNIQSIFTKLDEDKQTIEQQIYVNPLKKTATNTKVDIAGSQVDDYGNIKLGNGS
TIIDQNTEIKVYKVNSNQQLPQSNRIYDFSQYEDVTSQFDNKKSFSNNVATLDFGNIDSA
YIIKVVSKYTPTSDGELDIAQGTSMRTTDNYGYYNYAGYSNFIVTSNDTGGGDGTVKPEE
KLYKIGDYVWEDVDKDGVQGTDSKEKPMANVLVTLTYPDGTTKSVRTDANGHYEFGGLKD
GETYTVKFETPAGYLPTKENGTTDGEKDSNGSSVTVKINGKDDMSLDTGFYKEPKYNLGD
YVWEDTNKDGIQDANEPGIKDVKVTLKDSTGKVIGTTTTDASGKYKFTDLDNGNYTVEFE
TPAGYTPTVKNTTAEDKDSNGLTTTGVIKDADNWTLDSGFYKTPKYSLGDYVWYDSNKDG
KQDSTEKGIKDVTVTLQNEKGEVIGTTKTDENGKYRFDNLDSGKYKVIFEKPAGLTQTGT
NTTEDDKDADGGEVDVTITDHDDFTLDNGYFEEDTSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDS
DSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDS
DSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDAGKHTPVKPMSATKD
HHNKAKALPETGSENNGSNNATLFGGLFAALGSLLLFGRRKKQNK
NT seq
3378 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgattaacagggataataaaaaggcaataacaaaaaagggtatgatttcaaatcgctta
aacaaattttcgattagaaagtatactgtaggaactgcatcgattttagtaggtacgaca
ttgatttttggtctagggaaccaagaagctaaagctgctgaaaacactagtacagaaaat
gcaaaacaagatgatgcaacgactagtgataataaagaagtagtgtcagaaactgaaaat
aattcgacaacagaaaataattcaacaaatccaattaagaaagaaacaaatactgattca
caaccagaagctaaagaagaatcaactacatcaagtactcaacaacagcaaaataacgtt
acagctacaactgaaactaagcctcaaaacattgaaaaagaaaatgttaaaccttcaact
gataaaactgcgacagaagatacatctgttattttagaagagaagaaagcaccaaataat
acaaataacgatgtaactacaaaaccatctacaagtgaaactcaaacaaaaccaactaca
cctcaagaatctacaaatattgaaaattcacaaccgcaaccaacgccttcagaagtagac
aatcaagttacagatgcaactaatccaaaagaaccagtaaatgtgtcaaaagaagaactt
aaaaataatcttgagaaattaaaagaattagttagaaatgatagcaatacagatcgttca
actaaaccagttgctacagctccaacaagtgttgcaccaaaacgtgtaaacgcaaaaatg
cgctttgcagttgcacaaccagcagcagttgcttcaaacaatgttaatgatttaattaaa
gtgacgaagcaaacaatcaaagttggcgatggtaaagataatgtggcagcagcgcatgac
ggtaaagatattgaatatgatacagagtttacaattgacaataaagtcaaaaaaggcgat
acaatgacgattaattatgataagaatgtaattccttcggatttaacagataaaaatgat
cctatcgatattactgatccatcaggagaggtcattgctaaaggaacatttgataaagca
actaagcaaatcacatatacatttacagactatgtagataaatatgaagatataaaatca
cgcttaactctatattcgtatattgataaaaaaacagttccaaatgagacaagtttgaat
ttaacatttgctacagcaggtaaagaaacaaatcaaaatgtcactgttgattatcaagat
ccaatggttcatggtgattcaaacattcaatctatctttacaaaattagatgaagataag
caaactattgaacaacaaatttatgttaatcctttgaaaaaaacagcaactaacactaaa
gttgatatagctggtagtcaagtagatgattatggaaatattaaactaggaaatggtagc
accattattgaccaaaatacagaaataaaggtttataaagttaactctaatcaacaattg
cctcaaagtaatagaatctatgattttagtcaatacgaagatgtaacaagtcaatttgat
aataaaaaatcatttagtaataatgtagcaacattggattttggcaatattgattcagct
tatatcattaaagtagttagtaaatatacacctacatcagatggtgagctagatattgct
caaggtactagtatgagaacaactgataattatggttattataattatgcaggatattca
aacttcatcgtaacttctaatgacactggtggtggtgacggtactgttaaacctgaagaa
aagttatacaaaattggtgactatgtatgggaagacgttgataaagacggtgttcaaggt
acagattcaaaagaaaagccaatggcaaacgttttagttacattaacttacccggacggt
actacaaaatcagtaagaacagatgctaatggtcattacgaattcggtggtttgaaagac
ggagaaacttatacagttaaattcgaaacgccagctggatatcttccaacaaaagaaaat
ggaacaactgatggtgaaaaagactcaaatggtagttctgtaactgttaaaattaatggt
aaagatgatatgtctttagacactggtttttataaagaacctaaatataatcttggtgac
tatgtatgggaagatacgaataaagatggtatccaagatgctaatgaacctggtatcaaa
gatgttaaggttacattaaaagatagtactggaaaagttattggtacaactactactgat
gcctcgggtaaatataaatttacagatttagataatggtaactatacagtagaatttgaa
acaccagcaggttacacgccaacggttaaaaacactacagctgaagataaagattctaat
ggtttaacaacaacaggtgttattaaagatgcagataattggacattagacagtggtttc
tataaaacaccaaaatatagtttaggtgattatgtttggtacgacagtaataaagacggc
aaacaagattcaactgaaaagggtattaaagatgtgacagttacattgcaaaacgaaaaa
ggcgaagtaattggaacaactaaaacagatgaaaatggtaaatatcgtttcgataattta
gatagcggtaaatataaagttatttttgaaaagcctgctggcttaacacaaacaggtaca
aatacaactgaagatgataaagatgcagatggtggcgaagttgacgtaacaattacagat
catgatgatttcacacttgataacggatacttcgaagaagatacatcagacagtgactca
gactcagattcagacagcgattcagattcagacagtgattcagactcagacagcgactca
gattcagatagtgattcagactcagatagcgactcagactcagatagcgattcagactca
gacagcgactcagattcagatagcgactcagactcagacagcgactcagactcagacagt
gactcagattcagatagcgactcagactcagacagtgactcagactcagatagcgattca
gattcagacagtgactcagattcagacagtgactcagattcagatagcgattcagattca
gacagcgactcagactcagacagtgactcagattcagatagcgactcagactcagatagc
gattcagattcagatgcaggaaaacatacacctgtgaaaccaatgagtgctactaaagac
catcacaataaagcgaaagcattaccagaaacaggtagtgaaaataacggctcaaataac
gcaacgttatttggcggattattcgcagcattaggttcattattgttattcggtcgtcgc
aaaaaacaaaacaaataa
DBGET
integrated database retrieval system
