Solanum verrucosum: 125807308
Help
Entry
125807308 CDS
T11474
Name
(RefSeq) pumilio homolog 2-like
KO
K17943
pumilio RNA-binding family
Organism
sver Solanum verrucosum
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
NABP
PUF
PUF_NOP9
CAS_CSE1
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
125807308
NCBI-ProteinID:
XP_049342959
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
991 aa
AA seq
DB search
MLSEFGPSPMLGNNENSFGDEFEKEMGMLLREQRRQEADDHEKELNLYRSGSAPPTIEGS
LSAVGGLFNNNGFRSEEELRSDPAYLSYYYANVNLNPRLPPPLLSKEDWRFAQRMQGGSS
AIGDRRKVNKNDNGSSSGRSLFAMPPGFNSIKAENENESDKLQGSVEWGGDGLIGLPGLG
LGSKQKSIAEIFQDDMSRVTPAPGPPSRPASRNAFDESSDNLGSAEAELSHLRHEFSTSD
PLRSVSNGQGSSAAQHVGAPASFTYAAALGASLSRSTTPDAQRIARAPSPSLTPIGGGRV
ATSEKRSVNSPNSFNGVSHTAESADLLAALSSMNLSNGSQNNSQQHAYLKRSESAQFNMS
SKSHSAKGPYIDTGAGNKSDLNSSNLHDDLHRSAVASNNSYVKGSQTSTLNGGGGVLSQY
QHMDSPSNYGLGSHSVNPVTSHLGNYNLPPLFETAAAASGMALPGMDSRMLGASHLNSGV
SEQNLGRMGNQMSGSALQASFMDPMYLQYLTAEYVAQVAALNDPSMDRNYMGNSYMDLLQ
KAYLGNALSPKSQYGVPLSSKGSGSSHHGYYANPAFGVGLSYPGSPLASPVVPNSPVGPG
SPMRHGDYNMRFPGAMRNITSGVIGSWHLDNMENSFASSLLEEFKSNKTRCFELSEIAGH
VVEFSADQYGSRFIQQKLETATPEEKNMVFQEIIPQALTLMTDVFGNYVIQKFFEHGMAS
QRRELASKLFSHVLTLSLQMYGCRVIQKAIEVVDVDQKIKMVEELDGHVMRCVRDQNGNH
VVQKCIECVPEEHIQFIISTFFGQVVNLSTHPYGCRVIQRVLEHCCDAITQSKVMEEILG
SVSMLAQDQYGNYVIQHVLEHGKPHERSAIIKELAGKIVQMSQQKFASNVVEKCLAFGGA
SERQLLVDEMLGTTDENEPLQAMMKDQFANYVVQKVLETCSDQQRELILSRIKVHLNALK
KYTYGKHIVARVEKLVAAGERRIAAQSPNLA
NT seq
2976 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgctatctgaatttggtccaagtccaatgcttggaaacaatgagaattcgtttggtgat
gagtttgagaaagagatgggaatgttacttcgtgaacagaggagacaagaagctgatgat
catgaaaaggagctgaatttgtatagaagtgggtcagctccacctactattgagggttct
ttaagtgcagtaggtgggttgtttaacaataatgggttcaggtctgaagaggagcttagg
tctgatcctgcttacttatcgtactattacgcgaatgttaatcttaaccctaggttacct
ccaccactgttgtctaaggaggattggaggtttgcacagaggatgcaaggagggagttct
gcaattggggataggaggaaggtgaacaagaatgataatgggagtagtagtgggaggtca
ctctttgctatgcctccggggtttaactcgataaaagctgagaacgagaatgagtcagac
aaattgcagggttcagtagagtggggtggtgatgggctgattgggttaccaggactagga
ctaggtagtaaacagaagagcattgctgaaatatttcaggatgacatgagccgtgtgact
cctgctcctggtcccccttcacgaccagctagccgcaatgcttttgatgaaagtagtgat
aacttgggttcagcagaagctgagctgtctcacctccgtcatgagttttcaacttcagat
cctttaaggtcagtatctaatggacaaggctcatctgctgctcaacatgttggggcgcct
gcttcctttacatatgctgctgctttgggggcttccttatcaagaagcactactcctgat
gcccagcgcattgctagggctcctagcccttccctcactcctatcggtggaggaagggta
gccacttctgagaagaggagcgttaatagtccaaattcatttaatggtgtctctcacacc
gccgagtctgcagatctgcttgctgctttgtctagcatgaatctttcaaatggtagtcag
aataactctcagcagcatgcatatctgaagagatctgaatctgctcagtttaatatgtcg
tctaaatctcactctgctaaaggaccatatattgacactggtgctggcaacaagtcagac
cttaacagttctaacctccatgacgatctgcacagatctgcagttgcctctaataattct
tatgtgaaaggatctcaaacgtccacactgaatggtggaggtggtgtactttctcaatat
cagcatatggatagtccttccaattatggtttaggtagtcattccgtcaatccagtgaca
agccatcttggcaactataatctgcctcctttgtttgaaactgctgctgccgcgtctggg
atggctttacctggaatggactctcgaatgctaggggcatctcatttgaactctggggtc
tcagagcagaatctcggcagaatgggaaatcaaatgtctgggagtgctttacaggcatcc
ttcatggatcctatgtatcttcagtacttgacagctgaatatgttgcacaggttgccgca
ctgaatgatccttcgatggataggaactacatgggcaattcctatatggacttgcttcag
aaagcttatcttggtaatgcattatctccgaagtcacaatatggtgtcccactcagcagt
aaaggtagtggttcaagtcatcatggctattatgccaatcctgcatttggagtcggttta
tcatatcctggaagtcccttggcaagtcctgtcgttccaaactctccagttggtcctggt
agtccaatgaggcacggtgattataatatgaggttccctggtgcaatgagaaacataact
tcaggtgtaataggatcatggcacttggataacatggaaaacagctttgcttcctctcta
ttggaagagttcaagagtaataagaccaggtgttttgagctttcagaaattgctggtcat
gttgtcgagttcagtgcggatcagtatggtagccggttcatccaacaaaaactggaaact
gccacccctgaggagaaaaacatggtttttcaggaaattattccccaagctcttactttg
atgactgatgtttttggtaattacgtaatccagaagttttttgaacatggaatggcatct
cagaggagagaattggctagcaagctctttagccatgtattaacactgagccttcagatg
tatggttgccgcgtgattcagaaggcaatagaagtggtagatgtggaccagaagattaaa
atggttgaggagcttgatggtcatgtcatgcgttgtgtacgagatcagaatgggaatcat
gtcgtccagaagtgtattgaatgtgtaccagaagaacacattcaattcatcatctctaca
ttttttggtcaagttgtgaatctctccacccatccatatggctgtcgtgtaattcagaga
gtattggaacactgctgtgatgcaattacacaaagtaaagtgatggaagaaattctggga
tctgttagcatgttggcacaagatcaatatggtaattatgttattcagcatgtactggag
catgggaagccacacgagcgttctgctattattaaggaactagctgggaagattgtgcaa
atgagccagcagaagtttgcctctaatgttgttgagaagtgtctagcttttggtggtgcc
agcgaaaggcagctcctggtggatgagatgctcggcacgactgatgaaaatgaacctctt
caggcaatgatgaaagatcagtttgcaaattatgttgtacagaaagttttggaaacgtgc
agtgatcagcaacgtgagctgatcctttctagaataaaggttcacttgaatgctctgaag
aaatacacttatggaaaacacattgttgctcgtgttgagaaacttgttgcagctggagaa
cgaagaattgctgctcagtctccaaatcttgcttag
DBGET
integrated database retrieval system