Solanum verrucosum: 125813928
Help
Entry
125813928 CDS
T11474
Name
(RefSeq) cellulose synthase-like protein D3
KO
K20924
cellulose synthase-like protein [EC:2.4.1.-]
Organism
sver Solanum verrucosum
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
sver00001
]
09180 Brite Hierarchies
09181 Protein families: metabolism
01003 Glycosyltransferases [BR:
sver01003
]
125813928
Glycosyltransferases [BR:
sver01003
]
Polysaccharide
Structural polysaccharide
125813928
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Cellulose_synt
zf-RING_4
Glyco_trans_2_3
zf-UDP
Glyco_tranf_2_3
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
125813928
NCBI-ProteinID:
XP_049349364
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
1141 aa
AA seq
DB search
MEMASKSFKASRSSLSTSSDLPDPQHGKPPLPPHVTFQRRTSSGRYVNYSRDDLDSELSS
SDYMNYMVHLPPTPDNQPMDSISQKVEEQYVSNSLFTGGFNSVTRAHLMDKVIESEANHP
QMAGAKGSSCAIPGCDAKVMSDERGIDIVPCECDFKICRDCYLDAVKTGDGICPGCKEQY
KVTDWEEANGNDRPLPLTGPGGMSRMERRLSIMKSTKSGLIRSHTSEFDHNRWLFETKGT
YGYGNAIWPKEGGFVNGKDDDIMEPTELMSKPWRPLTRKLKIPAAILSPYRLLIVVRFVV
LGLFLAWRVNHPNKDAVWLWGMSVVCEIWFAFSWILDQLPKLCPINRATDLSVLKEKFET
PTPGNPTGRSDLPGVDMFVSTADPEKEPPLVTANTILSILAADYPVEKLACYVSDDGGAL
LTFEAMAEAASFANIWVPFCRKHKIEPRNPESYFNLKKDPYKNKVKQDFVKDRRRAKREY
DEFKVRINSLPDSIRRRSDAYHAREEIKAMKQQRQKTDDEPLENVKIPKATWMADGTHWP
GTWLNSGPEHSKGDHAGIIQVMLKPPSDDPLYGNNEDGIIDLTDVDIRLPMLVYVSREKR
PGYDHNKKAGAMNALVRASAVMSNGAFILNLDCDHYIYNSQAIREGMCFMMDRGGDRLCY
VQFPQRFEGIDPSDRYANRNTVFFDGNMRALDGLQGPMYVGTGCLFRRVALYGFDPPRSK
DHQSGCCSCCYGRKKKHINTSEEHRALRRGDSDDEEMNLSLAPKAFGNSAVLIDSIPVAE
FQGRPLADHPAVKNGRPPGALTIPREHLDASTVAEAISVISCWYEEKTEWGQRVGWIYGS
VTEDVVTGYRMHNRGWKSVYCVTKRDAFRGTAPINLTDRLHQVLRWATGSVEIFFSRNNA
LFSSSKMKFLQKIAYLNCGIYPFTSIFLIVYCFLPALSLFSGQFIVQTLNVTFLVYLLII
TVTLCLLAVLEVKWSGIELEEWWRNEQFWLIGGTSAHLAAVLQGLLKVVAGIEISFTLTS
KSAGDEEDDDFADLYLVKWTSLMIPPITIMMVNLIAIAVGFSRTIYSVIPQWSRLLGGVF
FSFWVLAHLYPFAKGLMGRRGRTPTIVFVWSGLIAITISLLWVAINPPAGTTQIGGSFQF
P
NT seq
3426 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaaatggcttcaaaatcattcaaagctagtagatcatctctgtcaacatcctcagat
ttgcctgatccacagcatggcaaacctccacttcctccacatgtgactttccaacggcgg
acttcctcaggccgatatgtgaactactcaagggatgatcttgatagtgaacttagcagc
agtgactatatgaactatatggtacatctccctccaactcctgacaatcagcccatggat
tctatttctcagaaggtcgaagagcagtatgtatccaattcactgttcacgggtggtttt
aattctgttacacgtgctcatcttatggacaaggtgattgaatcagaggcgaatcatccc
caaatggcgggtgcaaaagggtcgtcgtgtgctatccctggatgtgatgctaaagtgatg
agtgatgaaaggggcattgatattgttccatgtgaatgtgatttcaagatatgcagagac
tgttacctggatgctgtcaaaactggtgatggtatatgcccggggtgtaaggagcaatat
aaagtcactgactgggaggaagctaatggaaacgatcgtccgcttcctctcactggtcca
ggtgggatgtcaaggatggagagaaggttgtcaattatgaaatcaactaagtcgggattg
attaggagccatacctcagagtttgatcacaaccgttggttgtttgaaacaaagggaaca
tatgggtatggaaacgctatatggccgaaagaaggtggatttgtaaatggaaaagatgat
gatattatggagcctactgaactgatgagcaaaccatggaggccacttacgcgcaaattg
aaaattcctgctgctatcctaagtccttatagacttttgatcgtcgttcggtttgttgta
cttggacttttcttggcatggagagtgaatcatcccaacaaagatgcagtttggttgtgg
gggatgtctgttgtttgtgaaatatggtttgctttctcttggattcttgatcaattgccc
aagctttgcccgatcaaccgtgctactgatcttagtgtcttgaaagaaaaatttgaaaca
cctaccccaggcaatcctactgggagatctgatctccctggtgttgatatgtttgtctct
accgctgatccagagaaggaaccccctcttgtgactgctaatactatattgtccattcta
gctgcagattatcctgtagaaaagcttgcttgttatgtttctgatgatggaggtgccctt
ttgacctttgaggcaatggcagaagctgcaagttttgctaatatatgggtgccattttgt
cgtaaacataaaattgaacctagaaatccagaaagttacttcaatttaaagaaggatcct
tacaaaaacaaggtaaagcaagactttgttaaggatcgtaggcgggcaaagcgtgagtat
gatgagtttaaggttcgtatcaatagcttgccggattccattcgccgtaggtctgatgct
tatcatgcaagggaagaaattaaggccatgaagcaacagaggcagaagaccgatgatgaa
cctttagagaatgtaaagatcccaaaagctacgtggatggcagatggaacccattggcct
gggacatggttgaattctggaccggagcattccaagggtgatcatgctggaataatacaa
gtgatgttgaaacctccaagtgatgatccactatatggtaacaatgaagatgggattatt
gacctgactgatgttgatatccgtcttcccatgcttgtttatgtttcccgtgagaagcgt
cctggctatgatcacaacaagaaagcaggtgctatgaatgccctggttcgagcatctgcg
gttatgtccaatggtgcatttattcttaaccttgattgtgaccattacatttacaactcc
caggctatcagggaaggtatgtgttttatgatggataggggaggggatcgtctttgctat
gttcagttccctcagaggtttgagggcattgacccatctgataggtatgccaatcgcaat
actgtctttttcgatggtaacatgagggcccttgatggactacagggtccaatgtatgtg
ggaactggatgtctctttcgaagggtagccctttatggttttgaccctcctcgctccaag
gatcaccagtccggttgctgtagctgctgctatggtcgcaaaaagaagcatattaataca
tcagaagaacatcgggccttgcgacgaggtgattcagacgatgaagaaatgaacctctca
ctggctcccaaggcttttgggaactcagcagtccttattgattcaattcctgtggcagag
ttccaaggtcgtcctttggcagatcacccagctgtgaagaatggacggcctcctggtgct
ttgaccattcctcgagagcatcttgatgcatcaacagttgcagaggcaatcagtgtcatc
tcctgctggtatgaggaaaagacagagtggggacaacgtgtcggatggatttatggttca
gttactgaagatgttgtgacaggatacaggatgcacaacagaggttggaagtcagtttat
tgtgttaccaaacgtgatgcattccgtgggactgcccctattaatctcactgataggctt
catcaggtccttcgatgggctactggttcagttgaaatcttcttctcccggaacaatgcc
cttttctccagctcaaaaatgaaattcttacagaaaattgcttacctcaattgtggaatc
tatcccttcacatcaatcttcttaatcgtctactgtttccttccagcactgtccctgttc
tccggtcagttcattgtccaaacactcaatgtcacctttcttgtgtacctcctgattatt
acagtcaccctctgcctgcttgcggtgctcgaggtcaagtggtcaggcattgagttggaa
gagtggtggaggaatgagcagttctggctgatcggaggtacaagtgctcacttggctgct
gtgcttcaggggctcctaaaagttgttgctgggattgaaatttctttcaccttgacgtca
aaatcagctggtgatgaagaagacgatgactttgctgatctgtatctcgttaagtggaca
tccctcatgattccaccaattacaatcatgatggtgaacttgatagcaatagcagttggt
tttagcaggacaatatacagtgttataccacaatggagccgtttactaggaggtgtattc
ttcagtttttgggttttagcacatctctatccctttgcgaaaggtcttatgggcagaaga
ggcaggacaccaaccattgtctttgtatggtcaggacttatcgcgatcaccatatccctt
ctttgggtggcgattaatcctccagcaggcactacccaaattggaggatcattccagttc
ccatga
DBGET
integrated database retrieval system
