Solanum verrucosum: 125814446
Help
Entry
125814446 CDS
T11474
Name
(RefSeq) cellulose synthase-like protein D2
KO
K20924
cellulose synthase-like protein [EC:2.4.1.-]
Organism
sver Solanum verrucosum
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
sver00001
]
09180 Brite Hierarchies
09181 Protein families: metabolism
01003 Glycosyltransferases [BR:
sver01003
]
125814446
Glycosyltransferases [BR:
sver01003
]
Polysaccharide
Structural polysaccharide
125814446
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Cellulose_synt
zf-RING_4
Glyco_trans_2_3
zf-UDP
Glyco_tranf_2_3
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
125814446
NCBI-ProteinID:
XP_049349847
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
1137 aa
AA seq
DB search
MAGRSFKPSDSQQGKPPGVTFARRTSSGRYVNLSRDSLDSEISGLEFANYMVHMPPTPDN
QPFDPSISQRVEEQYVSNSLFSGGYNSATRAHLMDKVIDSEANHPQMAGTKGSSCAIQGC
DGKVMSDGRGDDILPCECDFKICRDCYIDAVKIGDGMCPGCKEPYKNTDLAENDVDPSRQ
PLSLHSNVGMSKNERMLSLMRSANKSALIRSESGLMRSQTGDFDHNRWLFETKGTYGYGN
AIWPKDEVFGNDEDDNIGEHSELLDKPWRPLTRKLKIPAAVLSPYRLLILIRVVVLGLFL
QWRISHPNNDAIWLWYMSIVCEIWFAISWLLDQLPKLCPVNRATDLTVLKEKFETPTSTN
PTGKSDLPGMDIFVSTADPEKEPPLVTANTILSILAADYPVEKLSCYVSDDGGALLTFEA
MAEAASFANIWVPFCRKHDIEPRNPDSYFSLKKDPYKNKVRQDFVKDRRRVKREYDEFKV
RTNGLTDSIRRRSDAYNAREEIKALKLQRERAGDEPLEPIKITKATWMADGTHWPGTWMV
ASPEHSRGDHAGIIQVMLKPPSDEALHGATADSSMIDFTEVDIRLPMLVYVSREKRPGYD
HNKKAGAMNALVRASAVMSNGPFILNLDCDHYIYNSEAIREGMCFMMDRGGDRLCYVQFP
QRFEGIDPNDRYANHNTVFFDVNMRALDGLQGPFYVGTGCLFRRTALYGFDPPRAKDRHP
DCCSCCFGRGKSKAIVADETRGLRMGDIDDEDMDLALFPKRFGNSSVLIDSIPVAEFQGR
PLADHPSVKYGRPPGALTIPRELLDASTVAEAVSVISCWYEDKTEWGNRVGWIYGSVTED
VVTGYRMHNRGWKSIYCVTKRDAFRGTAPINLTDRLHQVLRWATGSVEIFFSRNNAFLAS
PKMKILQRIAYLNVGIYPFTSIFLIVYCFLPALSLFSGQFIVQSLNVTFLVYLLVISLTL
CILALLEIKWSGIALEDWWRNEQFWLIGGTSAHLAAVFQGLLKVVAGIEISFTLTSKSSG
DENDDAFADLYVIKWTSLMIPPITIMMVNLVAIAVGFSRTIYSTIPQWSRLLGGVFFSFW
VLAHLYPFAKGLMGRRGRTPTIVFVWSGLIAITISLLWVAINPPAGNTEIGGSFQFP
NT seq
3414 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggctggaagatccttcaaaccttcagactcgcaacaaggtaagcctccgggcgtgacc
tttgcaaggaggacttcatctggtcgctatgtgaacttgtctagggactccctggatagt
gagatcagtggtttagagtttgcgaactacatggtgcatatgcctccgacacccgataat
caaccttttgatccttccatttcacagagggttgaagagcagtatgtgtcgaattccttg
tttagtggtggatataacagtgctactcgtgcacatttgatggataaggtgattgattcg
gaagcaaatcatcctcagatggctggtactaaagggtcttcttgtgctatacaaggttgt
gatggaaaggtcatgagtgatggcaggggtgatgatatcctcccttgcgaatgtgatttc
aaaatttgtcgggattgttatattgatgcagtcaaaatcggagatgggatgtgtcccggt
tgtaaagagccatacaagaacactgatttagctgagaatgatgtggatccctctagacaa
cctttgtcattgcattcaaatgttgggatgtctaaaaatgaaaggatgttgtcgttgatg
cgatcagctaataagtcggccttaataaggagcgagtcagggttgatgaggagtcaaaca
ggagattttgatcataatagatggttatttgagactaaaggaacatatggatatgggaat
gctatatggccaaaggatgaagtatttggaaatgacgaagatgataacattggtgagcat
tctgaacttctcgacaagccttggaggccacttacgcgtaagctgaaaatacctgctgca
gtactcagcccataccggcttttgattttaattcgtgttgttgtacttggattatttctt
caatggaggatcagccatcccaacaatgatgctatatggctgtggtatatgtcaatagtc
tgtgagatttggtttgcaatttcatggctgcttgatcagcttccaaagttatgtccagtc
aatcgtgctaccgatcttactgtcttaaaagaaaagtttgaaactccgacctcaaccaat
cccactggaaaatctgatcttccaggaatggatatatttgtttctacagcagatccagag
aaagagccgccactcgttacagcaaacacaatactatctattcttgctgctgattaccct
gttgaaaaactttcttgctatgtatctgatgatggaggtgctcttttgacttttgaagca
atggcagaagctgcaagttttgccaacatttgggtcccattttgtcgtaaacatgatatt
gaaccgaggaacccggatagttacttcagcttgaagaaagatccttacaagaacaaagta
cgtcaagatttcgtcaaggatcgtagacgtgtgaagcgcgaatatgatgaatttaaggtt
cgaacgaatggccttactgattctattcgccggcgttctgatgcctacaatgctcgagag
gaaattaaggctttgaagcttcagagagagagagctggagatgaacctttggaacctatc
aagataactaaggccacttggatggcagatggaactcactggcccggaacttggatggta
gcttctcccgagcactctcggggtgatcatgcaggaatcatacaggtgatgttaaaacct
ccaagtgatgaagccttgcatggtgcgacagctgatagcagtatgattgattttacggaa
gttgatattcggctccccatgctggtgtatgtttctcgtgagaagcgtcctggctatgat
cacaacaagaaggctggagctatgaatgcattggtccgagcatcagctgtcatgtccaat
ggccctttcattctaaaccttgactgtgatcactacatctacaactcagaggcaataagg
gagggcatgtgttttatgatggaccggggtggggatcgtctttgttatgtccagttccct
cagcggtttgaggggattgatcccaatgatcgttatgcaaatcacaatactgttttcttt
gatgtgaatatgcgtgcactggatggacttcagggtcctttttatgtgggcactggttgc
ctcttccgccggactgctctgtatggttttgatcccccacgagcaaaggaccgccaccct
gattgctgcagttgttgctttgggaggggtaagagtaaggccattgttgctgatgaaacg
aggggacttagaatgggagacattgatgatgaggatatggatcttgctttgtttcctaaa
agatttggaaactctagtgtcctcattgattcaatcccggtggctgaattccaaggtaga
ccgctcgctgatcatccttctgtaaagtatggacgacctcccggtgcactaactattcca
agagaacttcttgatgcttccactgttgctgaagcagtcagtgtcatttcgtgttggtat
gaagacaaaactgaatggggcaatcgagttggatggatttacggatctgttactgaagat
gtggtaacaggatacaggatgcataatagaggttggaaatcgatatactgtgtgacaaaa
agagatgcattccgtggcactgcaccaatcaatctcactgataggcttcaccaagtccta
cgatgggctactggttccgttgagatcttcttctcacgcaataacgcctttcttgctagt
ccaaagatgaaaattttacaacggattgcttacctcaacgttggcatctacccgttcact
tcaatattcctgattgtctactgcttcctcccagcactctcacttttctccggtcaattc
attgttcagagccttaatgtcacatttctcgtgtacctccttgtcatctcattaactctc
tgcattctagctttgctcgagatcaagtggtctggcattgctttggaagattggtggcgt
aatgagcagttttggttaatcggaggcacgagtgcacatcttgcagctgtgtttcaaggt
ctactaaaagtggttgctggcattgaaatctcattcactctgacatcaaaatcatccggt
gatgaaaatgacgatgcatttgctgatctctacgtcatcaaatggacatcattgatgatt
cctcctataacaatcatgatggttaacttagttgcgatagcagttggcttcagcagaact
atatacagcacaataccacaatggagccgtctgttaggaggcgttttcttcagcttttgg
gtgttggctcatctctatcctttcgcgaaaggacttatgggacgaagaggaagaacacca
accatcgtgttcgtttggtccgggctcattgccatcaccatttccctcctttgggttgca
attaaccctcctgcaggtaacactgaaattggaggttcatttcagttcccttaa
DBGET
integrated database retrieval system