Shewanella vesiculosa: KDH10_000041
Help
Entry
KDH10_000041 CDS
T08322
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor
KO
K02014
iron complex outermembrane recepter protein
Organism
svm
Shewanella vesiculosa
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
svm00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
svm02000
]
KDH10_000041
Transporters [BR:
svm02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
KDH10_000041
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
Plug
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UJL42879
LinkDB
All DBs
Position
46407..49019
Genome browser
AA seq
870 aa
AA seq
DB search
MRPSIFKKNVLATQIAILFGSIVSVGAIAAEEITVDDNIEKIEVRGMRASMKASINEKRF
ANSVVDSVTAEDIGKFPDGDVGESLGRIPGVAVNRQFGQGQQVSIRGASSQLTSTLLNGH
SVASTGWFDQQAIDRSFNYSLLPPQMISGIEVYKSSQADLPEGGIGGTVIVKTRKPLDLE
SNTVFLSAKGDYGTISEETDPELSGLYSWKNENENFGFLISGAGANTQYQRNGIETLLGW
GEIVPSTFQQDRERTALNVAAQYRANDALEFGLTYTGLSLKADNANTSIFLFPTQQGVST
CNQTNAAGVCTDITHTGVDAFAWNQTWAREAEMTSDTLDFNFAYDNENFKIEGSIGNTKA
DGGTSLTSNYGNSIGKPSDFAGHYDATGNIIDIDIANKNFSAEDYNGQLSGAGWALKKQP
NTDEETYAQFDVTVPTDLGAISSIKTGIRYADHDVTQQTDAAIVGDIAVHDASYYFDGTM
SSGAGFTLPKPNFDNMINDAKAAINGFTRDKSGYGTLNEKNLSVYAMANFESEGIRGNFG
LRYISTDIESDYYALSSTGQFADATSTDSASYSDVLPSLNVAFDLAPDLILRTSASQVMS
RPNYAELFATSTLPGLNDGTPGNEKLNRGSVSLDPFKATQADLSLEWYFSDSGLAAATYF
IKDVSSFISTRQKLNQQIGINDNDLAAQGQSACGVGVYDCWTVSEKYNATGGRIEGLELQ
LQDSYENGLGYSINYTYADAGSPAENYPDQVGVFSDSSKHTVNLVGYYEMDAFSARLAYN
WRSEYMMRELPGFYGNRQHEDYGTLDLSTTYSVTDWMDITFEAVNLTEEDSIQTGVAPLD
SEVIAEFKADYPVWSFEGEARYKVGVAFRF
NT seq
2613 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcgaccatctatctttaaaaaaaatgtacttgctactcaaattgcgattctgtttggc
agtatagtgtcagtgggtgctattgcagcagaagaaattactgttgatgataacattgaa
aaaattgaagttcgtgggatgcgtgcctccatgaaagcttcaattaacgaaaaacgtttt
gctaattctgtagtggattcagtaacggcagaagatattggtaagtttcctgatggcgat
gtcggtgagtcattaggtcgtatccctggggttgcagtaaaccgccagtttggtcaaggt
cagcaggtttctattcgtggtgcctcgagccaattgactagcacattgttaaacggacat
tcagttgcatctactggttggtttgatcagcaagccattgaccgtagttttaactattcg
ttactaccaccgcaaatgatcagtggtatcgaagtgtataaatcttcgcaagctgattta
cctgaaggtggtatcggtggcacggtaatcgttaagactcgtaagccattagacttagag
tcaaacacagtatttttaagtgccaaaggtgactatggcacgatttcagaagaaactgat
cctgaattatctggcctatatagctggaaaaatgaaaacgaaaacttcggtttcttaatc
tctggtgctggtgcgaacacccagtatcagcgtaatggtattgaaaccttgctaggttgg
ggtgaaattgttccttctacctttcaacaagaccgtgaacgcacagcgttaaacgtcgcc
gcgcaataccgtgctaatgatgcattagagtttggcttaacctacacaggtttaagtcta
aaggctgataatgccaacacatccattttcttattcccaactcagcaaggtgttagcact
tgtaatcaaactaacgctgcgggtgtgtgtacagatattactcatacaggtgtggatgct
ttcgcttggaaccaaacctgggctcgagaagctgaaatgacttctgatacccttgatttt
aatttcgcttatgataatgaaaatttcaaaattgaaggtagtatcggtaataccaaggca
gatggtggtaccagtttaacctctaactacggtaactcaatcggtaagccttcagatttt
gctggccactatgatgcaacgggcaatatcattgacatcgatattgctaataaaaacttt
agtgctgaagactacaatggccaattatctggcgcgggttgggcattaaagaaacagcct
aataccgacgaagaaacctatgcccagtttgatgtgacagtgccaacagatttaggggcc
atttcgtcaatcaaaacaggtattcgttatgctgaccacgatgtgactcaacaaactgat
gcagcaatagttggtgatatcgccgttcatgatgcctcttattattttgacggcacaatg
agctcgggtgctggttttactttgcctaagccaaactttgataacatgattaacgatgct
aaagcggcaattaacggttttactcgtgacaagtctggttacggtacattgaacgagaaa
aacctatcagtgtatgcaatggctaacttcgagtctgaaggcattcgtggtaactttggt
ttacgttatatctctaccgacattgaatctgactactatgcactcagttctacaggtcag
tttgcagatgcaacatcaacagattctgctagttacagtgatgtgttaccaagcttaaac
gtcgcgtttgatttagctccagatctgattttacgtacttctgcatcacaagtaatgtct
cgccctaactatgcagagctatttgctacgtcaacattaccgggtttaaacgatggtact
cctggtaacgagaagcttaaccgtggttctgtttcattagacccatttaaagcaactcaa
gccgacttaagtttagagtggtatttcagcgattcaggtttagctgcagcaacttacttt
attaaagatgtaagttcattcatttcaactcgtcaaaagttaaaccaacaaattggtatt
aacgataatgaccttgctgctcaaggccaaagtgcttgtggagtcggtgtatatgattgc
tggacggtaagtgaaaaatacaatgctaccggtggtcgtattgaaggtcttgaattgcaa
cttcaagattcatatgaaaacggtttaggttactctattaactatacttatgcagatgca
ggttctcctgctgaaaactaccctgatcaagtgggtgtgttctctgattcgtctaagcat
acagttaacttagtcggttactatgagatggatgcattttcagcccgcttggcctataac
tggcgcagcgaatacatgatgcgtgaattacctggcttctatggtaaccgtcaacatgaa
gactatggcacacttgatttaagcacaacatacagcgtgacagattggatggatataacg
tttgaagctgttaacttaaccgaagaagacagcatccaaacaggtgttgcaccactagac
tctgaagtgattgctgagtttaaagcagactacccagtgtggagctttgaaggtgaagct
cgctataaagtgggtgtcgcattccgtttctaa
DBGET
integrated database retrieval system