Shewanella vesiculosa: KDH10_000389
Help
Entry
KDH10_000389 CDS
T08322
Name
(GenBank) FtsX-like permease family protein
KO
K02004
putative ABC transport system permease protein
Organism
svm
Shewanella vesiculosa
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
svm00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
svm02000
]
KDH10_000389
Transporters [BR:
svm02000
]
ABC transporters, prokaryotic type
ABC-2 type and other transporters
Putative ABC transporter
KDH10_000389
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
FtsX
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UJL43153
LinkDB
All DBs
Position
444393..446876
Genome browser
AA seq
827 aa
AA seq
DB search
MEWQIAWRLFKRELAQGQLILIVLAITLAVLSVTGLARVSERLQVAINGEAANFIAADRI
IDSPVELDPQVLTIADKLGLAHVTNMQFNSMVYSGDKFQLVTVKAVGDGYPLKGDIELSS
GVTQELPKTGQAWFESRLGGLLGFPQSIELGNSELSLTEEIKRLPDAGFNPFASSPVLLI
RLDDVAATGIIQPGSRVTYLYQFTGNADQLTVFEQQAKPLLNNSQRWVDVQSGDSPIASA
VQRAERFLLLASLLGIALACAAIGIAAQRYCQRHYDVVAMLKTFGASGKQIRVLFGLHLS
LVTLLGIALGLLGGVLLDLGITAFLPKEIAAYSPPYLRPVLLGVSTGLISAFMFSAYPLM
RLLAIPPLRVLQRQLEGLQLGMWLHLLLSLAAMALLGYLYSRSLALTMTVVLAVLLLGLL
LSVLGFVMIRFGHGIGMKTTNPFQLALAGLRRRARQNAVQLVGFSSALVLLLTILALRQD
LLNEWQKQLPENAPNYFLVNIAPEDAKPLNDFLTLNHINATDIYPVVRGRLTHINDEELI
SGKQSEDGVEGRVGISRELNLTYRETLPPNNKLLEGEFNQASNDVSVESGVADRLGIVLG
DKLTYSIDNQAFSVKVTSIRQVQWETLQPNFFMIFTPEALAPFAYTSMASFHLNDAQLAA
DGSLLSANQVVLQLIQQFPTVSIIDVGAMVEQLRQIIDQVSLSLSLVLVLVLLASALVLI
AQTEAGMATRQRELAVLRTFGASGWLLRAATGFEFALLGAIAGLLAVIVAEFALYMLKTQ
VFELVVYMHWPWWGITPIAGAIIVAILGVWRCRQLLNKSCSDMLKEG
NT seq
2484 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaatggcaaattgcgtggcgcttgtttaaacgtgaactcgctcaagggcaattaatt
cttattgtattggcgattaccttagcagtgttatcagtaactgggcttgcgcgagtcagt
gagcgtttacaagttgctattaacggtgaagcggccaactttattgctgccgaccgtatt
attgactcgccagttgaacttgacccacaagtgctgaccatagcggataagcttggtctc
gcccatgtcaccaatatgcaatttaattcgatggtatattccggagataaatttcagtta
gtgacggtcaaagctgtaggtgatggttacccattaaaaggcgatatcgaactcagtagt
ggtgtcactcaggagttgccaaagacaggtcaagcatggtttgagagtcgtctaggcggt
ttacttggtttcccgcaaagcattgagttaggcaatagtgagctatcactaaccgaagag
attaagcgtttacctgatgctggttttaatccgtttgcatcttcgccagtgttactgatc
cgcctagatgacgtggcggcgacaggtattattcagcctggcagtagggtgacttattta
taccaatttaccggaaatgctgatcaattaaccgtatttgagcagcaagctaaaccttta
ctcaataacagccaacgatgggtagacgtgcagtcgggagattctccgatcgcttcggcg
gtgcaacgtgctgagcgattcctgctgcttgccagtttactcggtatagcccttgcgtgt
gcggcgattggtattgcggcgcagcgttattgccaacgccattacgatgtcgttgccatg
ctcaaaacctttggcgcctcgggtaagcaaattagagtattattcggactgcatctgtct
ttggttactttactggggattgcactgggtctgcttggcggagtattacttgatcttggt
ataacggcatttctgcctaaagaaatcgccgcttattcaccaccatacttacgccctgta
ttactaggcgttagcacgggtttgattagtgcatttatgttttcggcttatccattaatg
cgcttgttagccattccgcccttaagagtattgcagcgtcaattagaaggtttgcaactg
gggatgtggttacatctgctattaagtttggctgccatggctttgttaggctatttatat
tcaagaagtttagccttgaccatgacagtggtgcttgcagtactactattaggtttgtta
ttaagcgtgcttggatttgtgatgatccgttttggtcatggtattggcatgaaaaccacc
aatcctttccaattagctttggctggtcttcgccgccgtgcgcgccaaaatgcggtgcaa
ttagtcggttttagcagtgcgttagtattactgttaacgattttggctttgcgccaagat
ttactcaatgaatggcaaaagcagttacctgaaaatgcccctaattactttttagtcaat
attgcgcctgaagatgctaaaccattgaatgactttttgacgcttaatcatattaatgcg
actgacatttatcctgtggttcgtggtcgtttgacacatattaatgatgaagagttgatt
tcaggcaagcagtctgaggacggtgttgaagggcgagtaggtatttctcgcgaactaaac
ctaacgtatcgagagaccttaccacctaataataagctccttgaaggtgagtttaatcag
gctagcaatgatgtgtcggttgaatctggtgttgctgatcgcttaggtatagtgttgggc
gataagctaacctatagcatagataatcaagccttctcggttaaggttaccagcataagg
caggttcaatgggaaactctacagcctaattttttcatgatttttaccccagaagcatta
gcgccatttgcctatacctcgatggcgagctttcatcttaatgatgcgcaattagccgcg
gacggcagcctactgagcgcgaatcaagtggtgctgcaattgatccaacaattcccgacg
gtatcgattattgatgttggcgctatggttgaacagttacgacaaattatcgatcaagtg
tcattatctttgtcattagtgttggttctagtgttactggccagtgctttagtactgata
gcccagactgaagctggtatggcgactcggcagcgagaattggcggtattgcgtacgttt
ggtgcatcgggttggttattaagagcggctactggatttgaatttgctttacttggggcc
atcgcaggtttattggcagtcattgttgctgagtttgctttgtacatgcttaaaacccaa
gtgtttgagttggtcgtttatatgcattggccttggtgggggatcacaccaattgctgga
gcaatcattgtggcgattcttggggtatggcgttgtcgtcagttacttaataagtcgtgc
agtgacatgttaaaagagggctaa
DBGET
integrated database retrieval system
