Shewanella vesiculosa: KDH10_000450
Help
Entry
KDH10_000450 CDS
T08322
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
svm
Shewanella vesiculosa
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Big_1
Invasin_D3
ZirS_C
GMI1_Ig_3
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UJL43204
LinkDB
All DBs
Position
520592..523051
Genome browser
AA seq
819 aa
AA seq
DB search
MRSAYKVYFALLCTFFLVACGGGGAITDDGTGGGTTPDPTVSITLSIDNDQISVAEPATI
TATVKDSTGAAVSTLVSFSLNNAQYGTFAPGTGEVATNADGIATVQLNSAAINTGATVTA
TTSSGETSSLNVTMAGDGGVAGGGAQVSLVLTDAAGNAIESINTLSPGKLTATVSGLSKS
VIVTFDSPIGDLPVKTAVTNAQGKATVDIYAGSSLGAGEATASLSTNETGSTIVVVGATN
VVMGSGTPFVQGVASVSTADLSAGGTATVSVLIQDDQGNPFTQPVDVNFSSTCATKSPAQ
AVISSPVSSSNGVATSTYRAQGCVGEDQINVTANAGGISLSAVGTINVLQADVGSIVFVS
ATPENVSILGTGGDESSVVKFKVLDKNNNVVTNQNVLFELNTEIGGVKIDPLQATTDNSG
LVQTVVTTGTVATSLRVTATVDNGSIPAISSQSSQLIVSTGIPDQDSFSLSATILNAEGW
DVDGTEVTVVARMADAFNNPVPDGTTVSFTTEGGSIEDACQTLNGACSVKWTSQLPRPEG
ETILNGAGQMFRNPNADLAFDSTLGIYGNIYGQKYGGRATVTATAIGEESFPDLNGNGRF
DAAEASEFLSGTDVTGQAFDLNDAFNDYNEDGIFNPQQTGGQSGGSLEKLVDFNSNGVFD
LKDGKYNGVLCSDPVHSACADGTSDSKSLFVRRSLVIVMSGSTAYATESNNIVIADSTGT
HTGGSIQIIGKGSATATFTISDLHNQQMPAGSIVRFTTSAGSVVSTSEYTWPSTNYNGGR
QFTATLKGEDEPNTGVFIVEVESPGGLITQVVSIGVAIL
NT seq
2460 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaggtcagcatataaagtttatttcgcacttttatgtactttttttctcgtcgcatgt
ggtggcggcggcgctataacagatgatggcactggaggaggaacaactcccgatccaaca
gtctctattacgttaagtattgataacgatcaaatttctgttgcagaacctgcaactatt
actgcgactgtcaaagactcaacgggggctgcagtcagtaccctggtttctttttcatta
aataatgctcaatacggcacttttgctcctggtacaggtgaagttgctactaatgctgat
ggtattgctactgttcagttaaattccgccgcaatcaacactggtgcgaccgtcacggca
accacttcatctggcgagacaagttcactcaatgtgactatggccggtgatggtggtgta
gcaggcggtggcgcgcaagtttcattggtattaactgatgcagctggtaatgccattgaa
tcaatcaacacattatctcctggtaaattaacggctacggttagtgggctttctaagtct
gttattgtcacttttgatagtccaataggtgatttgccggttaaaacagcagtgactaat
gcacaaggaaaggcgaccgtcgatatttatgcgggtagctctttaggtgccggcgaagca
accgcttcgttatcaactaatgaaacgggttcgacgattgttgtcgtcggtgccaccaat
gttgtgatgggcagcggaacaccgtttgttcaaggtgtagcatcggtaagtacagccgat
ctttcggcgggcggtactgcaacggtttcagttttgattcaagatgatcaaggtaatcct
tttactcagccagtcgatgtgaacttctcgtcaacctgtgcgacaaaaagccctgctcag
gcggtgatcagctctcctgtttcatcaagtaatggcgttgcaacatcaacttatcgggct
caaggttgtgttggtgaagatcaaattaacgtcacagcaaacgccggtggcattagttta
tcagcagttgggactattaatgtactgcaggcggatgtaggtagtatcgtatttgtatct
gcaacacctgagaatgttagtattttgggtactggtggcgatgaatcatctgtggttaaa
tttaaagtactagataaaaataataacgttgtgaccaatcaaaatgtattatttgaactc
aataccgaaattggtggagtgaaaattgatcctttacaagccacaaccgacaacagtggt
ttagttcaaacggtagtcactacaggtacagtggctacctcgctgcgagtcactgcgacg
gtagacaatggctcaatccctgcaatatcgagtcagtctagccagttaattgtttcaaca
ggcattcctgatcaagacagtttctcattatctgcgacaatattaaatgctgaaggttgg
gatgttgatggaactgaagttacggtcgtagcccgtatggctgatgcgtttaataaccct
gtacctgatggaactacggtatcttttactaccgaaggtggctctattgaagatgcatgt
caaacgcttaatggagcttgttcagtaaaatggaccagtcagttgccaagaccagaaggt
gagacgattctcaatggcgcggggcagatgttccgtaatcctaatgctgatttagctttt
gattcaacgttgggtatttatggcaatatatatggtcaaaaatacggtggtcgtgcaacg
gttactgcaaccgcaattggtgaagagtcttttcctgatttaaacggtaatggtcgtttt
gatgctgcagaagcatctgaatttctttctggtacagacgtcactgggcaagcatttgat
ttaaatgatgcctttaatgattataacgaagatggaatattcaacccgcaacaaacgggt
ggtcagtcaggtggttcattagaaaagctagttgattttaattcaaatggtgtatttgat
ttaaaagacggcaaatacaatggggtactttgctcggaccctgttcacagtgcatgtgct
gatggtacaagtgattctaagtctttgtttgtgcgtcgaagtcttgtcatagtgatgtct
ggtagtactgcttatgctactgagtcaaataacattgttatagcagacagtacaggtact
catactggcggtagcattcaaattatcggaaaaggttctgctactgcaacatttactatt
tctgatttacacaatcagcaaatgccagcagggtctattgttagatttacaacctctgca
ggttctgtagtaagtactagtgaatatacttggccgagcactaactataatggtggccgt
cagttcacggctaccctaaaaggtgaagatgagcctaacactggagtgttcattgttgaa
gtagaatcaccaggcgggttaattactcaagtggtttcaattggtgtagcgattttataa
DBGET
integrated database retrieval system