KEGG   Shewanella vesiculosa: KDH10_000602
Entry
KDH10_000602      CDS       T08322                                 
Name
(GenBank) RHS repeat protein
Organism
svm  Shewanella vesiculosa
SSDB
Motif
Pfam: RHS_repeat DUF6531 RHS
Other DBs
NCBI-ProteinID: UJL43326
LinkDB
Position
694478..699025
AA seq 1515 aa
MAVSNFYFKGHNRYIVIAPASASTPAGFQLSTFEQNNNISTIINEISPHLVRDRNALIHA
RSLVMNAGVNVTLSARDITHKLSDIIGRNLLRVYLEMPKQQIQSSTEIASVGASSTNKKS
PKASKGKQTSASVQSGTVTNHSPTEVSIDKQECRSDPVSMLSGEEILPLVDFELNGLMPL
TWRRLYRSSKVGTNVGMGYGWRHNFCVQLEHQYQAPAKVGPKKPGKYWFELTDDEGRVHV
FDSVKRGQTSIQLSTGWSLVHQADGRQVLIKPDDSHWAFVKQQVAGKDVWQLESISNHQG
QYFQLYYDHQGRLTQITTGPKRGVLLFYNAQSNLLKVASYMLDNQGNKQVHQNLLASYQY
DDAQALIAATDINGRVERYSYVKVKSADITSDSDHQYNPKSTTHLLQRRTRASGFSHHFA
WDGQDHQAKCIEQWGDDDIYHYHFEYTALVHGVKSRCTDSLGHSETFIHNTQGLLTEHHN
PNGSIIRHQYDAVGRKVATIDACDNKIQYNYNHQGQLLAVIQADGGTTRFEYNRLGQRIV
TRDAIGRTAKRHYDATGRLLSETGFDGRPSHYQYNDAGQLTQKIDVNGVTHRYHWDHDGE
LLATQVGDALTRFSHDRLGRVNATINPQGLVTEFIRDNKGQIIESKSYPQDKQDKQDNQD
MPEEAISHYYQYDDAGRIIRQRQQADVAGDHELSNDSEYIENIIDYDGLAQPRQQTFADG
SWLKFFYDKERNLNRIERSDGAQYRIEYTPTEQPRTLIGFDGREQHYQYDANDKLVAVND
SDIRFVELKRDAMGRICQQSSHVKLEPSATSALLNTQNFYQYNPIGQITRAHNQHRTVQQ
HLDPQGRINRVLQSQWQLDYQYDDSGNRSGLTLPDGQHIDYQYNKNCQLSGISFTGNGSS
KPCVQLAHYHYLSSGLLHKTIQGNQLELSHAYDSHSRLIEQTWRHTQKETRLFESRRYQY
DKQHQLQRCESKLGNDSAVNGQSFDHINHKLEVKQFSYNKISQLISNSDTGVSGENANIA
DNASNARQQYQWDAFGNPLQAIRASDIHSHTHTQDISSNHVSANETASSQSAETVRPNKN
LNDVVVNNDRLMSMAGVDYRYDASGNQISQVGTGDKQQRSFNGLNQLVQINVNGKLTQYE
YDALGRRSAKITELGRTDFIWDNHQLIGEYTLGEYTWYIYQPDTFTPVALIKAGQVYYYH
LDQLGTPICLTDENAKIVWHSQQDVFGQTIERTSIKHRDIEYTDCKDAAKQDKITNPIRF
QGQYFDDESGLHYNRFRYYSPGQARFIHQDPIGLVGGINHYQYAPNHVNWVDPFGLICKE
HSWNVFQKNTRGHFKSSSEAAESYRKVKEVEAMDKINRPDPLTYLPESYINAHIQQFAIE
GAGFIAIQGWMENPDYPNLPPRKFGGLRSEMDVIIQKYQASGGDWTILRDELSLGEGVDL
SKDEIAYLVIEPGDSRISYDMPTGREAGAYKNEWVPGGKTKGGITEAALVNSEKIFHNND
INELSKQFKGSKKIK
NT seq 4548 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atggcggtcagtaatttctattttaaaggtcataaccgttacattgttatcgcgcctgcc
agcgcgtcaacccctgctgggtttcaattatctacgtttgaacaaaataataatattagt
accattattaatgaaatctcgcctcatttagtccgcgaccgtaatgctttaattcatgcc
agaagtttggtgatgaacgccggcgtaaacgtgactttatctgccagagatattactcat
aaactcagtgacattattgggcgtaatttactccgagtgtatctcgaaatgcccaaacaa
cagattcaatcctcaacagaaatcgctagcgttggggcgagttcgacgaataaaaaatcc
cccaaagccagcaagggtaaacaaacttctgcatcagttcagtctggtactgtgaccaat
cattctccgacggaagtgagcatcgataaacaagagtgccgcagcgatccggtttcgatg
ctaagtggcgaagaaattttaccgttagtcgactttgagcttaatggtttaatgccgcta
acatggcgccgtttgtatcgttcgagtaaagttggtactaacgttggtatggggtacggc
tggcgtcataacttttgtgtacagctagaacatcaatatcaagcacctgcgaaagtcggg
cctaaaaaacctggtaaatattggtttgaattaaccgatgatgaaggccgagtgcatgtt
tttgattcggtcaaacgtggccagaccagcatccaactttcaacaggttggtcgttagtt
catcaagccgatggtcgtcaagtactcatcaagccagatgacagtcattgggcttttgta
aagcaacaggttgcaggcaaagatgtttggcaattagaaagcattagtaatcatcaaggc
caatattttcagctgtattatgatcatcaaggccgtttaacccaaataaccacaggccca
aaacgtggcgtattgttattttataatgcacagagcaacttattaaaagtggcttcgtac
atgttagataaccaaggtaacaaacaagttcatcaaaatttgttagccagttatcaatat
gacgacgctcaagcacttattgccgccactgacattaatggccgagtagagcgctacagt
tatgtcaaggtcaagtcagccgacatcacatctgacagtgatcatcaatataaccctaaa
agtaccactcatttattgcagcgccgaacacgcgcatctggctttagccatcactttgca
tgggacggacaagatcaccaagccaagtgcattgagcaatggggtgatgatgatatctat
cattatcattttgaatatacagcactcgttcacggcgtaaaaagccgttgtactgactct
ttaggtcatagcgaaacttttattcacaatacacaagggctgttgactgaacaccacaac
ccgaatggcagcataatacgtcatcaatatgatgcagttggtcgtaaagtggccaccatt
gatgcctgtgataataaaatacaatataactataaccatcaaggacagttactggctgtt
attcaagccgatggcggcactacgcggtttgaatataatcgtttaggtcaaagaattgtc
acccgagatgccatcggccgaacagctaaaagacattatgatgccactgggcgattactg
tctgaaacaggttttgatggtcgtccaagtcattatcaatacaatgatgctgggcagtta
acccaaaaaatcgatgttaatggtgtaacacatcgctaccattgggaccacgacggtgaa
ttacttgctacacaagtcggtgatgcgctcacccgttttagccatgacagactggggcgt
gttaatgccactattaatccccaaggcttagtcactgaatttattcgtgacaataaaggt
cagattatcgaaagtaaatcctatccacaagataaacaagataaacaagataatcaagac
atgcctgaagaagccattagtcattattatcagtatgatgatgccggacgcattattcgc
cagcgtcaacaggctgatgtggcaggcgatcacgaacttagtaacgatagcgagtacatt
gaaaacattatcgactatgacggtttagcccaaccgcgccagcaaacgtttgctgatggc
agttggctgaagtttttttacgataaagaacgtaacttaaatcgcatcgagcgcagtgac
ggggcgcaataccgtattgaatacacgccaacagagcaacctagaacattaattggtttt
gatggccgcgagcaacattatcaatatgacgcaaatgacaaattagttgccgtgaacgac
agtgatattcgatttgttgagctcaaacgtgatgccatggggcgaatttgtcagcaaagt
agccatgtcaaacttgagccaagtgccacatcagcgctactgaatactcagaacttttat
caatataatcctatagggcaaatcactcgtgcccataaccaacatcgtactgtgcagcaa
catcttgacccacaagggcgtataaatcgggtattgcaaagccagtggcaacttgactat
caatatgatgactcaggtaaccgcagtggcctaaccttgccagacgggcaacacattgac
tatcaatacaataaaaactgtcaattaagcggcattagctttacaggcaatggctcatcg
aagccgtgtgtacagctggctcattatcactatctgtcatcaggattattgcacaaaaca
attcagggtaatcaacttgaactcagtcatgcctatgatagccattcaagattaattgag
cagacatggcgacatacacaaaaagagactcgattatttgaatcaagacgttatcaatac
gataaacagcatcaattacaacgctgcgaaagtaagctgggcaacgatagtgctgtgaat
ggtcaatcttttgatcatattaaccacaagctagaggttaaacagtttagctataacaaa
ataagccagttaatcagtaatagtgatacaggcgtgtctggcgaaaacgcaaatattgct
gacaatgcatctaatgctcgtcagcaataccaatgggatgcttttggtaacccattacag
gctattcgtgctagtgatattcatagccatacccatacccaagatataagtagtaatcat
gttagtgctaatgaaacggctagcagtcaatcagctgaaacagtaagaccgaataagaac
cttaatgatgtggtggttaacaacgaccgcttaatgagcatggctggggtcgattaccgt
tatgatgccagtggcaaccaaatcagccaagtaggtactggcgataaacaacagcgcagt
tttaatggcttaaaccaactggtgcaaatcaacgttaatggcaagctgacgcaatacgaa
tatgatgccttaggccgtcgcagtgcaaaaatcaccgaacttggtcgcaccgactttatt
tgggacaatcatcaacttattggcgaatacaccttaggtgaatacacctggtatatctat
cagcccgacacttttacacctgtagcactgattaaagcagggcaggtttattattatcac
ctagaccaactaggcacaccgatttgcttaacggatgaaaatgctaaaatcgtctggcac
agccaacaagacgtgtttggtcagacaattgaaagaacatctattaaacatagagacatt
gaatatacagattgtaaagatgcagccaagcaagacaagataactaacccaatccgtttt
caaggccaatactttgatgacgaatcagggttacactacaaccgctttcggtactacagc
cctgggcaagcacgattcatccatcaagaccctattggtttagtcggcgggataaaccat
tatcaatatgcgcctaaccatgtcaactgggtggatccgtttgggctgatttgtaaagag
catagttggaatgtattccagaaaaatacaagagggcattttaagagtagtagtgaagca
gctgaaagttatagaaaagtaaaggaagtcgaggctatggataagataaatcgccctgat
ccattaacttatttaccagagtcgtatattaatgctcatattcaacaatttgcaattgaa
ggtgccggttttatagcgattcaaggatggatggaaaaccctgattatccaaatctaccg
cctagaaagtttggaggacttcgctctgaaatggatgtaattattcaaaagtatcaagca
tcaggtggggattggactatattacgagacgagcttagcttaggtgaaggggttgacctt
tccaaagatgaaattgcttatttagtaatagagcctggcgattcaagaatttcatacgac
atgccaacaggtagagaagctggtgcttataagaatgaatgggttcctgggggaaaaact
aaaggaggtattaccgaagcagctttagtaaactctgaaaaaatattccataataatgat
attaatgaactttccaaacaattcaaaggttctaaaaaaataaaatga

DBGET integrated database retrieval system