Shewanella vesiculosa: KDH10_001247
Help
Entry
KDH10_001247 CDS
T08322
Name
(GenBank) ExeM/NucH family extracellular endonuclease
KO
K07004
uncharacterized protein
Organism
svm
Shewanella vesiculosa
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
svm00001
]
09190 Not Included in Pathway or Brite
09194 Poorly characterized
99997 Function unknown
KDH10_001247
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
PKD_4
PKD
LTD
DUF8508
Exo_endo_phos
K319L-like_PKD
LEA_2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UJL43875
LinkDB
All DBs
Position
complement(1468898..1471750)
Genome browser
AA seq
950 aa
AA seq
DB search
MLSNKTLLAASISTLMAFQVSAQDLLISEYVEGSSNNKAIELYNPTGTNIDLSDYVLSFY
FNGNTSASTKINLSGNIAANSTFVITDNDASADILALAQLTSNGSFFNGDDAIVLTHSDN
VIDSLGQVGVDPGTEWGSGDISTQNNTLRRDINNLTADQVIDDAVTFVGWQGFAQDDISD
LGRFSANGSTDPVDPVDPVDPVDPVEFVCGQSAVAIHEIQGNAQASALIGSTVVVEAIVT
SDQQAGLKGVFLQMADLEADADIDTSEGIFVYTGTQALQVNAGDRIRLAANVAEYNGVTQ
LSGVSQFALCATQQMLPSVSSVTLPINDSQQLERVEGMRVYFDQDLVVNEVYSLGRYGEV
LLGSSRHFIGTQVATPGADAVAVTAANSRDSIILDDGSTRQNPEVIPYPAPGLSANNTLR
VGDSVTRLEGVMHYGFNQFRIMPTSLVNVIQSNPRQMAPEVVADADLRVASFNVLNYFNG
DGNGNGFPTDRGADSAVEFERQRAKIINAMQTINADVFGLMEIENDGYDTSSAISDLVSG
LNAALGTTTYAYVVPSVAKIGTDAITVGMIYRTDKLTLSGEAGILSSANSPADDNGVQLF
DDSKNRPMLTQQFTVNGTDENIVVAVNHLKSKGSSCDSLGDPDLQDGQGNCNQTRTRASD
AIGQWLAAQYPDSKVLVIGDLNAYAKEDPLTMLASHGYNELTSYVGAQKPYSYVFSGESG
QLDHALANDELVSNLVGITQWHINADEPIVLDYNEEYKSATQLQELYQADAFRSSDHDPV
IISFKFAPANALPVASFEQQLNGSVLHVQSTSTDSDGQIVQHQWDFGDGTVVSGVTASHQ
YLQPGDYQVQLTVTDDKGDVATSVSSISIVEPVNMAPIAQIQRVNLWFMQLFISTSYDQD
GVIKRQQWAFNNGRKARGPVAFSFSRREHTVELTVVDNDGETGSATMRFR
NT seq
2853 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttaagcaataaaaccttgcttgcggcatcaatatcaacattaatggcttttcaagtc
agcgcacaagatttacttatttcagaatatgtggaaggtagtagtaataataaagctatc
gagttatataacccaacaggcaccaatattgatttaagtgattatgtattatcattttat
tttaatggtaatacttctgcgtcaaccaagattaatctttcaggcaacattgcggctaac
tctacttttgtgattactgataatgatgcttcagcagatattttagcattggcccagttg
acttctaatggtagtttttttaatggtgatgatgccattgtgctgactcatagcgacaat
gttatcgattctttaggccaagtaggcgtcgatcccggtacagaatggggcagtggcgat
atctctacccaaaacaatacgttgcgccgtgatataaataatttaactgcagatcaagtg
attgacgatgccgtaacatttgtgggctggcaaggttttgcgcaagatgacattagtgac
ttaggtcgattttcagccaatggttcaacggatccagttgatcctgttgatcctgttgat
ccagttgaccctgttgagtttgtctgtggtcaatcagctgtcgcaattcatgaaatacaa
ggtaatgctcaagccagcgcattgatagggagtacagtggttgttgaagctattgtcacc
agcgatcagcaagcgggtttaaaaggcgtgttcttgcaaatggctgaccttgaagctgat
gctgatatagacacttcggaaggtatatttgtctataccggcactcaggcgttacaagtt
aatgcgggcgataggattcgactagccgcaaatgtagcagaatataacggtgtgactcag
ttatcgggcgttagccaatttgcgctttgtgctactcagcaaatgttgccaagtgtctca
tcggttaccttgccaataaatgacagtcagcagcttgaacgtgttgaaggtatgcgtgtg
tattttgaccaggatttagtggtcaatgaggtatacagcttaggccgctatggggaagtg
ttattaggcagtagccgccactttattggaactcaggtcgcgactccaggtgctgatgct
gttgccgttactgccgcgaattcccgtgacagcattattttagatgatggttcaactcgc
caaaatcctgaagtgatcccgtatcctgcgcccgggctatcggctaataataccttacga
gtgggtgatagtgtgaccaggcttgaaggggtaatgcattatggctttaatcaattccgc
attatgccgaccagtttagtaaatgttatccaaagtaatccacgtcaaatggcaccagaa
gtggttgccgatgccgatttaagagtcgccagttttaacgtgctcaattacttcaatggt
gatggtaacggtaacggttttccaactgatcgcggtgctgattcagccgttgaatttgag
cgtcaacgcgcaaaaattatcaatgccatgcaaacgatcaatgccgatgtatttggttta
atggaaattgagaatgatggctatgacactagctcggccatcagtgatcttgttagcggt
ttaaatgcggcactaggcacaacaacttatgcgtatgtagtgcctagcgtggcaaaaatc
ggcaccgatgcaattactgtgggaatgatttatcgcactgataaactgacgctatctggt
gaggctgggattttatcatcagcaaattcacccgctgatgataatggcgtgcaattgttt
gatgacagtaaaaatcgtccaatgctcactcagcaatttacggtcaatggcacagacgag
aatattgtggttgccgtgaatcatctaaaatctaaaggcagcagctgtgatagtcttggt
gatcctgacttacaagatggtcaaggtaattgtaatcaaacccgaactcgagcaagtgat
gctattggtcaatggttagcggcgcaataccctgatagcaaagtactggtaataggcgat
ttaaatgcctacgcaaaagaagatccgttaaccatgctagcaagtcatggttataatgaa
ttaaccagctatgtcggtgcccaaaagccttactcttatgtgttttctggtgagtcaggt
cagctagatcatgctttagccaatgatgaattagtcagtaacttagtcggcattactcaa
tggcacattaacgccgatgagcctatagtactggattataacgaagagtataaatcggca
acacaactgcaagaattgtatcaagcggatgcatttcgttcatccgatcatgatcctgtg
attatctcgtttaaatttgctccagcaaatgcgttacctgtggccagctttgagcaacaa
ttaaatggcagtgtattgcacgttcagtcaacttcaactgatagtgacggccaaattgtt
cagcatcaatgggactttggtgatggcactgtggtatctggcgtgacggcttcgcatcag
tatttgcaaccaggcgattaccaagtgcaattaaccgttaccgatgacaaaggtgatgtt
gcgacgagtgtcagcagcataagtattgtcgagcctgtcaacatggcccccattgcgcaa
attcagcgagtaaatttatggtttatgcagttatttatttcaactagctatgaccaagac
ggtgtcattaagcgccagcaatgggcctttaataatggccgcaaagcgcgcggacctgtg
gcctttagtttcagccgtcgtgaacataccgttgagttaactgtggttgataatgacggt
gaaacaggctcagcaacgatgcgctttagataa
DBGET
integrated database retrieval system