KEGG   Shewanella vesiculosa: KDH10_001573
Entry
KDH10_001573      CDS       T08322                                 
Name
(GenBank) DEAD/DEAH box helicase family protein
Organism
svm  Shewanella vesiculosa
SSDB
Motif
Pfam: SNF2-rel_dom Helicase_C ResIII DEAD SWIM
Other DBs
NCBI-ProteinID: UJL44139
LinkDB
Position
complement(1856383..1859595)
AA seq 1070 aa
MSAKLFNLPIKLSLEMIAKLFSATQIQKAQNYLIQGRVLEVTASSNNHDIEAYVEGSAAE
PYRQEITLVNVNHKIVMRSHCTCPVRTNCKHVAAAMLALVDKKPVEEQRIHQWLRQLDEQ
KTVAEFEDEEEEKDRIIYVLSNDPHGIFVEFKRSKLNKKDQYNKGSKLALADIRYSMPWW
IDPEDKQIISLLLSSNNQGSKIYIDGEISFLALTKMLAAEVCFWEENRTPLTWAKAITPE
FIWCEIDKKHTQMQMRMPGLENWEFIATEPPLYVELDYLHLGRIDTDLPVKKLSLLQHMP
PVPLAQVDAISHKMLQHFSPKTVPVPSEIDFCEITAELVTRLTFTREFFSSSQIMQPVIR
VDHCYGEITFNASTKPERISLVKKDQVQYQVHRQVDHELAALQSLTDIGLVTLEPDPVLV
SSHKPYYVSVGLLPESIFEWSELTSDGLDALSALGMDIHFDDDFDLQITDAQLDVDLVDD
DESGWFSLSLSADIDGQSVPLLALVARWLQQNGEPADDDELLLPGPNGGFIKIKAKTIKP
LISIIQELFNRHSGDVIAIPRNRAHILNDLSASDVRLLNGERVRNLATKLAEFKGVVPVE
LPNGLHATLRDYQKQGFDWLCFLKEYQLGGILADDMGLGKTVQALAFLLKAKQEATEHRT
SLIVCPTSLVGNWLKEANKFAPSLNVVVIHGNKRQPLLDQINQFDVVVTTYPLMLRDEAI
YCEYVFEHIILDEAQQIKNAQAKVTQVIKTLKGKFRLCLSGTPLENHLGELKSLMDFCLP
GLLGQHTYFNKQFRGPIEKQADVEKSLLLSQRIAPFMLRRTKQEVVSELPEKTVIIQTLE
LEKDQRNLYESIRLVMEKKLRELFAKKGVSSSHIEFLDALLKLRQACCDPRLVKLEQAQQ
VKDNAKMTWLIQNLPDMIEDGRKILIFSQFTGMLALIEDELKRLAITYSKLTGQTRDRQT
QIDAFQEGGNSVFLISLKAGGTGLNLTTADTVIHFDPWWNPAAERQATDRAHRIGQLNPV
FVYKLIAQGTVEEKIQEMQQHKQGLADSILSDGTQGPWQGSANDLLALLS
NT seq 3213 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgtcggcgaaactgtttaatcttcccattaagctttcattagagatgattgcgaaactg
ttttcggccacgcaaattcaaaaagcgcaaaactatttgatccaaggccgggtactcgaa
gttactgccagcagtaacaaccatgatattgaggcctatgtagagggatctgctgccgag
ccttatcgtcaagaaattaccctagtcaacgttaatcacaaaattgtgatgcgatctcat
tgtacttgtccggtcagaaccaattgtaaacacgttgctgcagctatgctggcactggtg
gataaaaaaccggttgaagaacagcgcattcatcaatggttacgccaacttgatgaacaa
aaaacggtagcagaatttgaagatgaagaggaagaaaaagaccgcattatctatgtgtta
tctaatgatcctcacggcatttttgtcgaattcaaacgcagtaaattaaataaaaaagat
caatataataaaggcagtaagctggcattagccgatattcgttatagcatgccttggtgg
atagatcctgaagataaacaaattattagcttgctattatcatctaacaatcaaggctca
aaaatttatatcgatggtgaaatttcatttttagccctgacaaaaatgcttgccgccgaa
gtgtgtttttgggaagaaaatcgcactccattgacctgggccaaagccattaccccagag
tttatctggtgtgagatagataaaaaacatactcaaatgcaaatgcgcatgcctgggctt
gaaaattgggagtttattgccaccgagccccctttgtatgtggaactagactatttgcat
ttaggccgaatagacacagatttacctgtgaaaaaactcagtttgttacagcatatgccg
ccggtgccattggctcaagttgatgcgattagccataaaatgctacaacatttttcacct
aaaacggtacctgttccaagcgagattgatttttgcgagataaccgcggaactggttaca
cgtttaacctttacgcgtgagtttttcagcagcagtcagatcatgcaaccggttattcga
gtcgatcattgttatggtgaaattacttttaatgcttcgactaagccagaacggattagc
ttagttaaaaaggatcaggtgcaatatcaagtgcatcgacaggtagatcatgaattagcc
gcgctgcaatcattaaccgatattggcttagtgacacttgagcccgatcctgtgctagtc
agttcacataaaccctattatgtcagtgtcggtttattacctgagtctatttttgaatgg
tctgagttgaccagtgatggtcttgatgcgttaagtgcattgggcatggacattcacttt
gatgatgattttgacttacaaattactgatgcacaacttgatgtcgacttggttgacgat
gatgagtcgggttggttttcgttatcactcagtgccgacattgatgggcagagtgtaccg
ttattggctttagtggctcgttggttacaacaaaatggtgaaccagcagatgacgatgaa
ttgctgttacctggtcctaatggcggctttattaaaattaaagccaaaaccattaagcca
ctcatcagcattatccaagagttatttaatcgtcattctggtgatgtaattgcaatacct
cgtaaccgtgcacatattttaaatgatttgtctgctagcgatgtgcgtttgcttaatggc
gagcgagtgcgcaacttagccacgaaactggctgagtttaaaggagttgttccggttgaa
ttacccaatggtttacatgcgacattacgtgattaccaaaaacagggttttgattggttg
tgtttccttaaggaatatcaactgggcggcattttagccgatgacatgggccttggtaaa
acagttcaagctttggcatttctactcaaagctaaacaagaagcgactgaacatcgcacc
agtttaattgtctgcccgaccagtttagttggtaactggttaaaagaagccaacaagttt
gcaccatcgctcaatgtcgtggtgatccacggtaataaacgtcaaccattattagaccaa
attaaccagtttgatgtggtcgtgaccacttatcctttaatgttgcgtgatgaagctatt
tactgtgaatatgtgtttgaacacattattttggatgaagcacaacagattaaaaatgcc
caagccaaagttactcaagtcattaaaaccctcaaaggtaagttccgcttgtgcttatca
ggtacgccacttgaaaatcatttaggtgaattaaaatcattgatggatttttgtttaccg
ggtctattaggtcagcatacttactttaataaacagtttcgtggtccgattgaaaagcag
gctgatgtcgaaaaatcgttgttactgagccagcgtattgcgccctttatgctgcgacgc
actaaacaggaagtggtatcagagttacctgaaaaaacggtaattatccaaaccttggag
cttgaaaaagaccaacgtaatttatatgaatctatccgcttagtgatggagaaaaaattg
cgtgagttgtttgctaaaaaaggcgtatcgagcagccatattgagtttttagatgcgtta
ctcaagcttcgccaagcctgttgcgaccctcgtttagttaagcttgaacaagctcagcaa
gtaaaagataacgctaaaatgacttggcttatccaaaacctgcctgacatgattgaagat
ggccgtaaaattcttatctttagccaatttactggcatgttagcgctgattgaagatgag
ttaaaacgcttggcgattacttacagtaagctgacagggcaaacacgcgaccgtcaaacc
cagattgatgcgtttcaagaaggcggcaactcagtgtttttgatcagtttaaaagctggc
ggcaccgggcttaatttaaccactgcggataccgttattcactttgatccttggtggaac
ccagccgcagaaaggcaagcaactgatcgtgcccatcgtattggtcagttaaatccggtc
tttgtgtataagctgattgcccaagggactgttgaagagaaaattcaagaaatgcagcag
cataagcaaggtttagcggacagtattttatcggatggtactcaaggtccatggcagggc
agtgccaatgatttattagctctactaagttaa

DBGET integrated database retrieval system