Shewanella vesiculosa: KDH10_002951
Help
Entry
KDH10_002951 CDS
T08322
Name
(GenBank) carboxypeptidase
Organism
svm
Shewanella vesiculosa
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Peptidase_M14
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UJL41891
LinkDB
All DBs
Position
3423323..3425182
Genome browser
AA seq
619 aa
AA seq
DB search
MRRFLLASLMVSPLLICSTFTHADDAASSTPIVATEHTAHFENDNILPPIHPWSGASETL
LLSADQPWITPFEQNGYVSSPNYHDTVQWLNKLVDSSDVLQLVSIGKSPQGRDIWMIVAS
QDGASTAQALSDNGKATVLVQAGIHAGEIDGKDAGMMLLRDISHNHKRELLENVNLLFIP
IFSVDAHERSSKFNRVNQRGPVNMGWRTTAKNLNLNRDYAKADALEMQHLIRTINIWQPD
LYIDVHVTDGIDYQYDVTFGYNLAQGYSPSIFKWLETIYRPEVEQALTEQGHIPGPLVFA
NDNTDISKGISLWNPSPRFSNGYGDARHLPTILIENHSLKPYKQRVLGTYVMLEQTLKTV
AQNSTKLKSAINEDKYRNPSKLTLSWENQTLAQGRDFKGIDYRIEQSPISGDKVVRWTGE
PKLYKNLPLVANTKPIVTVTRPVAYYIPPQWADVIDRLALHGIRMTRLNQITTVTAQQYQ
FSEPMFSSADYEGHQTVTANTTIHKVTTDLPAGTVRILTDQPLGDLAMLLLEPQAEDSLF
YWGFFNPIFTRTEYIEDYAVEPLAAKMLQENPGLQAEFNLALKNPDFAKDSEARLRWFYE
RSPYYDNQYMKYPVLRVSK
NT seq
1860 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcgccgctttttgcttgcaagtttaatggttagtccgttactgatttgttctactttc
actcatgctgatgatgctgcatcttcgacgcccatagtcgcaacagagcacactgcacat
tttgaaaacgacaatatactgccgccaattcacccttggtctggtgcaagtgaaaccttg
ttattaagtgcagatcagccatggatcactccgtttgagcaaaacggttacgtttctagc
ccgaactatcatgatacggtgcaatggttaaacaaactcgtcgacagcagcgatgtatta
caactggttagtatcggcaaaagtccccagggccgagatatatggatgattgttgcgtcg
caagatggagcatcaactgcgcaagcattgagtgataatggtaaagcgaccgtgctagtg
caagcgggcattcatgctggcgaaattgacggtaaagatgctgggatgatgttattgcgt
gatatcagtcataaccacaaacgcgagttacttgaaaacgttaacttactgtttatccct
attttcagtgttgatgctcacgagcgcagcagcaaatttaaccgcgttaatcagcgtgga
cctgtgaacatgggttggcgtactacggctaaaaaccttaatttaaaccgtgattatgcc
aaagctgatgcactggaaatgcaacaccttattcgcaccattaatatttggcagccagat
ttatacatagatgtccatgtaaccgatggtattgactaccaatatgatgtcacctttggc
tacaacctcgctcaaggttacagcccgagcatttttaaatggctagagactatttatcgt
ccagaggtagagcaagccttaacagaacaaggccacatacctggtccattagtttttgct
aacgacaataccgacataagtaaaggtatatcactttggaaccctagcccacgattctcc
aatggctatggcgatgcccgtcatttacccaccattttaattgaaaaccatagccttaag
ccctacaagcaacgcgtacttggcacctatgtcatgcttgaacaaacccttaaaacagtg
gcccaaaatagcactaagctaaaatctgccatcaatgaagataaataccgaaatccaagc
aagttaaccctaagctgggaaaaccaaacattagcacaagggcgagactttaaaggtatt
gattaccgtattgagcaaagcccaatcagtggcgacaaagtagtacgctggacaggtgaa
cctaagttatataaaaacttaccgcttgtggctaataccaaaccgattgtgacagtgacg
cgtcctgtggcgtattatattccaccacagtgggctgatgtgattgatcgtctcgcttta
cacggcatcagaatgacgcgtcttaatcaaatcaccacagtaactgcacagcaatatcaa
ttcagcgagcccatgttttctagtgctgattacgaaggccatcaaacagtcaccgccaac
acgaccattcacaaagttactactgatcttcctgcaggtactgtgcgtattctaaccgac
cagcctttgggcgatttagccatgctgctgctcgagccacaagcagaggattcattgttt
tactggggattttttaatcctattttcacccgcaccgaatacattgaagattatgcggtt
gaacctttagcggcaaaaatgttacaagagaatcccggcctacaagctgaattcaatcta
gcactaaagaaccctgattttgccaaagacagtgaagcaagactccgttggttttatgaa
cgcagcccatattatgataaccaatacatgaaatatcctgtgttaagggtatctaagtaa
DBGET
integrated database retrieval system